├── BoundaryElement └── BoundaryElementProgramming │ ├── Cont │ ├── exefiles │ │ ├── prog111 │ │ │ └── prog111.exe │ │ ├── prog31 │ │ │ └── prog31.exe │ │ ├── prog51 │ │ │ └── prog51.exe │ │ ├── prog52 │ │ │ └── prog52.exe │ │ ├── prog71 │ │ │ └── prog71.exe │ │ └── prog91 │ │ │ └── prog91.exe │ ├── inputfiles │ │ ├── prog111 │ │ │ └── Cantilever │ │ │ │ └── INPUT │ │ ├── prog31 │ │ │ └── Area │ │ │ │ └── input.dat │ │ ├── prog51 │ │ │ └── Trefftz │ │ │ │ └── input.dat │ │ ├── prog52 │ │ │ └── Isolator │ │ │ │ └── INPUT.dat │ │ ├── prog71 │ │ │ ├── Cantilever │ │ │ │ └── INPUT │ │ │ └── Isolator │ │ │ │ └── INPUT │ │ └── prog91 │ │ │ ├── Cantilever │ │ │ ├── INPUT │ │ │ └── INPUT2 │ │ │ └── Isolator │ │ │ ├── INPUT │ │ │ └── input2 │ ├── library │ │ ├── Bodyforce.f90 │ │ ├── Elast.f90 │ │ ├── Geometry.f90 │ │ ├── Integ.f90 │ │ ├── Laplace.f90 │ │ ├── Postproc.f90 │ │ ├── Stiffness.f90 │ │ └── Util.f90 │ └── sourcecodes │ │ ├── prog111 │ │ └── prog111.f90 │ │ ├── prog31 │ │ └── prog31.f90 │ │ ├── prog51 │ │ └── prog51.f90 │ │ ├── prog52 │ │ └── prog52.f90 │ │ ├── prog71 │ │ └── prog71.f90 │ │ └── prog91 │ │ └── prog91.f90 │ ├── Disconti │ ├── exefiles │ │ ├── prog111_disc │ │ │ └── prog111_disc.exe │ │ └── prog71_disc │ │ │ └── prog71_disc.exe │ ├── inputfiles │ │ ├── prog111 │ │ │ ├── Cantilever_2_regions_cantilever │ │ │ │ └── INPUT │ │ │ └── Compression_4_regions_compressiontest │ │ │ │ └── INPUT │ │ └── prog71 │ │ │ ├── Cantilever_12_parabolic │ │ │ └── INPUT │ │ │ └── Cantilever_8_parabolic │ │ │ └── INPUT │ ├── library │ │ ├── Elast.f90 │ │ ├── Geometry.f90 │ │ ├── Integ.f90 │ │ ├── Laplace.f90 │ │ ├── Postproc.f90 │ │ ├── Stiffness.f90 │ │ └── Util.f90 │ └── sourcecodes │ │ ├── prog111 │ │ └── prog111_disc.f90 │ │ └── prog71 │ │ └── prog71_disc.f90 │ ├── MyCodes │ ├── DirectMethod.py │ ├── Laplace.py │ ├── Trefftz.py │ └── __pycache__ │ │ └── Laplace.cpython-37.pyc │ └── parallel │ ├── inputfiles │ ├── coord.dat │ ├── job.dat │ ├── load.dat │ ├── plane.dat │ └── prog81.dat │ └── sourcecodes │ ├── bem_lib.f90 │ ├── bem_lib_p.f90 │ ├── coord.f90 │ ├── load.f90 │ ├── plane.f90 │ ├── prog81.f90 │ └── prog83.f90 ├── Bubble ├── AcousticBubbles │ └── bubble.py └── boiling │ ├── Boiling.sln │ ├── Boiling.vcproj │ ├── ExtendedYanagita.h │ ├── Makefile │ ├── OriginalYanagita.h │ └── boiling.cpp ├── Deformation ├── AnalyticEigensystems │ ├── Matlab │ │ ├── 2D │ │ │ ├── ARAP │ │ │ │ ├── ARAP_Hessian.m │ │ │ │ ├── ARAP_Hessian_sym.m │ │ │ │ ├── ARAP_PK1.m │ │ │ │ └── ARAP_Psi.m │ │ │ ├── Corotational │ │ │ │ ├── Corotational_Hessian.m │ │ │ │ ├── Corotational_Hessian_sym.m │ │ │ │ ├── Corotational_PK1.m │ │ │ │ └── Corotational_Psi.m │ │ │ ├── Get_Analytic_Eigensystem.m │ │ │ ├── Symmetric_ARAP │ │ │ │ ├── Symmetric_ARAP_Hessian.m │ │ │ │ ├── Symmetric_ARAP_Hessian_sym.m │ │ │ │ ├── Symmetric_ARAP_PK1.m │ │ │ │ └── Symmetric_ARAP_Psi.m │ │ │ ├── Symmetric_Dirichlet │ │ │ │ ├── Symmetric_Dirichlet_Hessian.m │ │ │ │ ├── Symmetric_Dirichlet_Hessian_sym.m │ │ │ │ ├── Symmetric_Dirichlet_PK1.m │ │ │ │ └── Symmetric_Dirichlet_Psi.m │ │ │ ├── Verify_2D.m │ │ │ ├── Verify_ARAP.m │ │ │ ├── Verify_Corotational.m │ │ │ ├── Verify_Symmetric_ARAP.m │ │ │ ├── Verify_Symmetric_Dirichlet.m │ │ │ └── util │ │ │ │ ├── DJDF.m │ │ │ │ ├── Get_Analytic_Eigensystem.m │ │ │ │ ├── Verify_Eigenpair.m │ │ │ │ ├── Verify_Hessian.m │ │ │ │ ├── Verify_PK1.m │ │ │ │ ├── axisAngle2D.m │ │ │ │ ├── eigenvector_gallery.m │ │ │ │ ├── eigenvector_gallery_sym.m │ │ │ │ ├── svd_rv.m │ │ │ │ └── vec.m │ │ ├── 3D │ │ │ ├── ARAP │ │ │ │ ├── ARAP_Hessian.m │ │ │ │ ├── ARAP_Hessian_sym.m │ │ │ │ ├── ARAP_PK1.m │ │ │ │ └── ARAP_Psi.m │ │ │ ├── Corotational │ │ │ │ ├── Corotational_Hessian.m │ │ │ │ ├── Corotational_Hessian_sym.m │ │ │ │ ├── Corotational_PK1.m │ │ │ │ └── Corotational_Psi.m │ │ │ ├── Symmetric_ARAP │ │ │ │ ├── Symmetric_ARAP_Hessian.m │ │ │ │ ├── Symmetric_ARAP_Hessian_sym.m │ │ │ │ ├── Symmetric_ARAP_PK1.m │ │ │ │ └── Symmetric_ARAP_Psi.m │ │ │ ├── Symmetric_Dirichlet │ │ │ │ ├── Symmetric_Dirichlet_Hessian.m │ │ │ │ ├── Symmetric_Dirichlet_Hessian_sym.m │ │ │ │ ├── Symmetric_Dirichlet_PK1.m │ │ │ │ └── Symmetric_Dirichlet_Psi.m │ │ │ ├── Verify_3D.m │ │ │ ├── Verify_ARAP.m │ │ │ ├── Verify_Corotational.m │ │ │ ├── Verify_Symmetric_ARAP.m │ │ │ ├── Verify_Symmetric_Dirichlet.m │ │ │ └── util │ │ │ │ ├── DFDF.m │ │ │ │ ├── DJDF.m │ │ │ │ ├── DJDF_sym.m │ │ │ │ ├── Get_Analytic_Eigensystem.m │ │ │ │ ├── HessianJ.m │ │ │ │ ├── IIC_Hessian.m │ │ │ │ ├── IIC_Hessian_sym.m │ │ │ │ ├── IIC_Star_Hessian.m │ │ │ │ ├── IIC_Star_Hessian_sym.m │ │ │ │ ├── Verify_Eigenpair.m │ │ │ │ ├── Verify_Hessian.m │ │ │ │ ├── Verify_PK1.m │ │ │ │ ├── axisAngle.m │ │ │ │ ├── eigenvector_gallery_sym.m │ │ │ │ ├── svd_rv.m │ │ │ │ └── vec.m │ │ ├── LICENSE.txt │ │ └── README.txt │ └── __MACOSX │ │ ├── ._Matlab │ │ └── Matlab │ │ ├── ._2D │ │ ├── ._3D │ │ ├── ._LICENSE.txt │ │ ├── ._README.txt │ │ ├── 2D │ │ ├── ._ARAP │ │ ├── ._Corotational │ │ ├── ._Get_Analytic_Eigensystem.m │ │ ├── ._Symmetric_ARAP │ │ ├── ._Symmetric_Dirichlet │ │ ├── ._Verify_2D.m │ │ ├── ._Verify_ARAP.m │ │ ├── ._Verify_Corotational.m │ │ ├── ._Verify_Symmetric_ARAP.m │ │ ├── ._Verify_Symmetric_Dirichlet.m │ │ ├── ._util │ │ ├── ARAP │ │ │ ├── ._ARAP_Hessian.m │ │ │ ├── ._ARAP_Hessian_sym.m │ │ │ ├── ._ARAP_PK1.m │ │ │ └── ._ARAP_Psi.m │ │ ├── Corotational │ │ │ ├── ._Corotational_Hessian.m │ │ │ ├── ._Corotational_Hessian_sym.m │ │ │ ├── ._Corotational_PK1.m │ │ │ └── ._Corotational_Psi.m │ │ ├── Symmetric_ARAP │ │ │ ├── ._Symmetric_ARAP_Hessian.m │ │ │ ├── ._Symmetric_ARAP_Hessian_sym.m │ │ │ ├── ._Symmetric_ARAP_PK1.m │ │ │ └── ._Symmetric_ARAP_Psi.m │ │ ├── Symmetric_Dirichlet │ │ │ ├── ._Symmetric_Dirichlet_Hessian.m │ │ │ ├── ._Symmetric_Dirichlet_Hessian_sym.m │ │ │ ├── ._Symmetric_Dirichlet_PK1.m │ │ │ └── ._Symmetric_Dirichlet_Psi.m │ │ └── util │ │ │ ├── ._DJDF.m │ │ │ ├── ._Get_Analytic_Eigensystem.m │ │ │ ├── ._Verify_Eigenpair.m │ │ │ ├── ._Verify_Hessian.m │ │ │ ├── ._Verify_PK1.m │ │ │ ├── ._axisAngle2D.m │ │ │ ├── ._eigenvector_gallery.m │ │ │ ├── ._eigenvector_gallery_sym.m │ │ │ ├── ._svd_rv.m │ │ │ └── ._vec.m │ │ └── 3D │ │ ├── ._ARAP │ │ ├── ._Corotational │ │ ├── ._Symmetric_ARAP │ │ ├── ._Symmetric_Dirichlet │ │ ├── ._Verify_3D.m │ │ ├── ._Verify_ARAP.m │ │ ├── ._Verify_Corotational.m │ │ ├── ._Verify_Symmetric_ARAP.m │ │ ├── ._Verify_Symmetric_Dirichlet.m │ │ ├── ._util │ │ ├── ARAP │ │ ├── ._ARAP_Hessian.m │ │ ├── ._ARAP_Hessian_sym.m │ │ ├── ._ARAP_PK1.m │ │ └── ._ARAP_Psi.m │ │ ├── Corotational │ │ ├── ._Corotational_Hessian.m │ │ ├── ._Corotational_Hessian_sym.m │ │ ├── ._Corotational_PK1.m │ │ └── ._Corotational_Psi.m │ │ ├── Symmetric_ARAP │ │ ├── ._Symmetric_ARAP_Hessian.m │ │ ├── ._Symmetric_ARAP_Hessian_sym.m │ │ ├── ._Symmetric_ARAP_PK1.m │ │ └── ._Symmetric_ARAP_Psi.m │ │ ├── Symmetric_Dirichlet │ │ ├── ._Symmetric_Dirichlet_Hessian.m │ │ ├── ._Symmetric_Dirichlet_Hessian_sym.m │ │ ├── ._Symmetric_Dirichlet_PK1.m │ │ └── ._Symmetric_Dirichlet_Psi.m │ │ └── util │ │ ├── ._DFDF.m │ │ ├── ._DJDF.m │ │ ├── ._DJDF_sym.m │ │ ├── ._Get_Analytic_Eigensystem.m │ │ ├── ._HessianJ.m │ │ ├── ._IIC_Hessian.m │ │ ├── ._IIC_Hessian_sym.m │ │ ├── ._IIC_Star_Hessian.m │ │ ├── ._IIC_Star_Hessian_sym.m │ │ ├── ._Verify_Eigenpair.m │ │ ├── ._Verify_Hessian.m │ │ ├── ._Verify_PK1.m │ │ ├── ._axisAngle.m │ │ ├── ._eigenvector_gallery_sym.m │ │ ├── ._svd_rv.m │ │ └── ._vec.m ├── Practicalities │ ├── ARAP_Hessian.m │ ├── ARAP_Hessian_Filtered.m │ ├── DRDF_Clean_2D.m │ ├── DRDF_Clean_3D.m │ ├── DRDF_Column.m │ ├── DRDF_Horrible.m │ ├── Get_ARAP_System.m │ ├── Get_Analytic_Anisotropic_Eigenvalues.m │ ├── Get_Analytic_Eigensystem.m │ ├── Get_Analytic_Eigenvalues.m │ ├── Get_Anisotropic_Systems.m │ ├── Get_SNH_System.m │ ├── Get_StVK_System.m │ ├── Get_Stretching_System.m │ ├── HandleContinuousCollisions.m │ ├── I1_Horrible_Hessian.m │ ├── InFaceRegion.m │ ├── PFPx.cpp │ ├── Simplify_Invariants.m │ ├── __MACOSX │ │ ├── ._ARAP_Hessian.m │ │ ├── ._ARAP_Hessian_Filtered.m │ │ ├── ._DRDF_Clean_2D.m │ │ ├── ._DRDF_Clean_3D.m │ │ ├── ._DRDF_Column.m │ │ ├── ._DRDF_Horrible.m │ │ ├── ._Get_ARAP_System.m │ │ ├── ._Get_Analytic_Anisotropic_Eigenvalues.m │ │ ├── ._Get_Analytic_Eigensystem.m │ │ ├── ._Get_Anisotropic_Systems.m │ │ ├── ._Get_SNH_System.m │ │ ├── ._Get_StVK_System.m │ │ ├── ._Get_Stretching_System.m │ │ ├── ._PFPx.cpp │ │ ├── ._eigenvector_gallery_sym.m │ │ ├── ._experimenting.m │ │ ├── ._gradientJ.m │ │ ├── ._svd_rv.m │ │ └── ._vec.m │ ├── cube_cache.cpp │ ├── cube_shape_derivative.cpp │ ├── eigenvector_gallery_sym.m │ ├── experimenting.m │ ├── flatten.cpp │ ├── gradientJ.m │ ├── hessianJ.m │ ├── localPairToArrayIndex.m │ ├── polar_decomposition_rv.m │ ├── svd_rv.m │ └── vec.m ├── anisotropicHyperelasticity │ ├── __MACOSX │ │ ├── ._matlab_verify │ │ └── matlab_verify │ │ │ ├── ._.DS_Store │ │ │ ├── ._.Verify_AStVK.m.un~ │ │ │ ├── ._.Verify_I5.m.un~ │ │ │ ├── ._I5 │ │ │ ├── ._LICENSE.txt │ │ │ ├── ._README.txt │ │ │ ├── ._Verify_I5.m │ │ │ ├── ._util │ │ │ ├── I5 │ │ │ ├── ._.DS_Store │ │ │ ├── ._.I5_Hessian.m.un~ │ │ │ ├── ._.I5_Hessian_sym.m.un~ │ │ │ ├── ._.I5_PK1.m.un~ │ │ │ ├── ._.I5_Psi.m.un~ │ │ │ ├── ._.I5_Sandbox.m.un~ │ │ │ ├── ._.Verify_I5_Hessian.m.un~ │ │ │ ├── ._.Verify_I5_PK1.m.un~ │ │ │ ├── ._I5_Hessian.m │ │ │ ├── ._I5_Hessian_sym.m │ │ │ ├── ._I5_PK1.m │ │ │ └── ._I5_Psi.m │ │ │ └── util │ │ │ ├── ._.DS_Store │ │ │ ├── ._.Verify_Anisotropic_Hessian.m.un~ │ │ │ ├── ._.Verify_Eigenpair.m.un~ │ │ │ ├── ._.svd_rv.m.un~ │ │ │ ├── ._Verify_Anisotropic_Hessian.m │ │ │ ├── ._Verify_Anisotropic_PK1.m │ │ │ ├── ._Verify_Eigenpair.m │ │ │ ├── ._axisAngle.m │ │ │ ├── ._svd_rv.m │ │ │ └── ._vec.m │ ├── matlab_verify │ │ ├── .DS_Store │ │ ├── .Verify_AStVK.m.un~ │ │ ├── .Verify_I5.m.un~ │ │ ├── I5 │ │ │ ├── .DS_Store │ │ │ ├── .I5_Hessian.m.un~ │ │ │ ├── .I5_Hessian_sym.m.un~ │ │ │ ├── .I5_PK1.m.un~ │ │ │ ├── .I5_Psi.m.un~ │ │ │ ├── .I5_Sandbox.m.un~ │ │ │ ├── .Verify_I5_Hessian.m.un~ │ │ │ ├── .Verify_I5_PK1.m.un~ │ │ │ ├── I5_Hessian.m │ │ │ ├── I5_Hessian_sym.m │ │ │ ├── I5_PK1.m │ │ │ └── I5_Psi.m │ │ ├── LICENSE.txt │ │ ├── README.txt │ │ ├── Verify_I5.m │ │ └── util │ │ │ ├── .DS_Store │ │ │ ├── .Verify_Anisotropic_Hessian.m.un~ │ │ │ ├── .Verify_Eigenpair.m.un~ │ │ │ ├── .svd_rv.m.un~ │ │ │ ├── Verify_Anisotropic_Hessian.m │ │ │ ├── Verify_Anisotropic_PK1.m │ │ │ ├── Verify_Eigenpair.m │ │ │ ├── axisAngle.m │ │ │ ├── svd_rv.m │ │ │ └── vec.m │ └── verifyPK1.py ├── boundedBiharmonic │ ├── README │ ├── alligator-skeleton-cage-points.tgf │ ├── alligator.obj │ ├── alligator.png │ ├── alligator_demo.m │ ├── avgedge.m │ ├── axisangle2quat.m │ ├── axisanglebetween.m │ ├── barycenter.m │ ├── bbw_demo.m │ ├── biharmonic_bounded.m │ ├── boundary_conditions.m │ ├── collapse_close_points.m │ ├── cotmatrix.m │ ├── cotmatrix3.m │ ├── doublearea.m │ ├── dualquatlbs.m │ ├── edges.m │ ├── faces_in_polygon.m │ ├── lbs.m │ ├── limit_faces.m │ ├── load_mesh.m │ ├── mask2poly.m │ ├── massmatrix.m │ ├── massmatrix3.m │ ├── massmatrix_intrinsic.m │ ├── normalizerow.m │ ├── normrow.m │ ├── ordered_outline.m │ ├── outline.m │ ├── png2mesh.m │ ├── png2poly.m │ ├── point_inside_polygon.m │ ├── poly2VEH.m │ ├── project_to_lines.m │ ├── pseudoedge_dof.m │ ├── quat2mat.m │ ├── quatmultiply.m │ ├── quattrans2udq.m │ ├── readEDGE.m │ ├── readELE.m │ ├── readNODE.m │ ├── readOBJ.m │ ├── readOBJfast.m │ ├── readOFF.m │ ├── readTGF.m │ ├── remesh_at_handles.m │ ├── sample_edges.m │ ├── simple_deform.m │ ├── skinning_transformations.m │ ├── snap_points_to_close_edges.m │ ├── stacktimes.m │ ├── tempprefix.m │ ├── tilefigs.m │ ├── triangle.m │ ├── tsurf.m │ ├── upsample.m │ ├── woody.obj │ ├── woody.png │ ├── woody.poly │ ├── writeELE.m │ ├── writeNODE.m │ └── writePOLY.m ├── cubica │ └── cubica-1.0 │ │ ├── .DS_Store │ │ ├── Makefile │ │ ├── SETTINGS.h │ │ ├── cfg │ │ ├── .DS_Store │ │ ├── arruda-boyce.stiff.material │ │ ├── bunny.cfg │ │ ├── head.regression.cfg │ │ ├── ode.armadillo.cfg │ │ ├── ode.armadillo.medium.cfg │ │ ├── ode.armadillo.small.cfg │ │ └── stvk.material │ │ ├── data │ │ ├── .DS_Store │ │ ├── armadillo.poses │ │ │ ├── ode.motion.0000.skeleton │ │ │ ├── ode.motion.0001.skeleton │ │ │ ├── ode.motion.0002.skeleton │ │ │ ├── ode.motion.0003.skeleton │ │ │ ├── ode.motion.0004.skeleton │ │ │ ├── ode.motion.0005.skeleton │ │ │ ├── ode.motion.0006.skeleton │ │ │ ├── ode.motion.0007.skeleton │ │ │ ├── ode.motion.0008.skeleton │ │ │ ├── ode.motion.0009.skeleton │ │ │ ├── ode.motion.0010.skeleton │ │ │ ├── ode.motion.0011.skeleton │ │ │ ├── ode.motion.0012.skeleton │ │ │ ├── ode.motion.0013.skeleton │ │ │ ├── ode.motion.0014.skeleton │ │ │ ├── ode.motion.0015.skeleton │ │ │ ├── ode.motion.0016.skeleton │ │ │ ├── ode.motion.0017.skeleton │ │ │ ├── ode.motion.0018.skeleton │ │ │ ├── ode.motion.0019.skeleton │ │ │ ├── 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(z-lib.org) │ ├── emirs.m │ ├── mcpdf.m │ ├── nsphere.m │ ├── ptscext.m │ ├── pypdf.m │ ├── qcacp.m │ ├── qcamie.m │ ├── readme.txt │ ├── rs1df.m │ ├── rs1dg.m │ ├── rs1do.m │ ├── rsgenf.m │ ├── rsgeng.m │ └── rsgeno.m ├── FLIP_MPM ├── narrowBand │ └── nbflip │ │ └── nbflip │ │ ├── ._CMakeLists.txt │ │ ├── ._COPYING │ │ ├── ._Doxyfile.in │ │ ├── ._INSTALLING │ │ ├── ._dependencies │ │ ├── ._resources │ │ ├── ._scenes │ │ ├── ._source │ │ ├── ._tools │ │ ├── CMakeLists.txt │ │ ├── COPYING │ │ ├── Doxyfile.in │ │ ├── INSTALLING │ │ ├── dependencies │ │ ├── ._zlib-1.2.8 │ │ └── zlib-1.2.8 │ │ │ ├── ._adler32.c │ │ │ ├── ._compress.c │ │ │ ├── ._crc32.c │ │ │ ├── ._crc32.h │ │ │ ├── ._deflate.c │ │ │ ├── ._deflate.h │ │ │ ├── ._gzclose.c │ │ │ ├── ._gzguts.h │ │ │ ├── ._gzlib.c │ │ │ ├── ._gzread.c │ │ │ ├── ._gzwrite.c │ │ │ ├── ._infback.c │ │ │ ├── ._inffast.c │ │ │ ├── ._inffast.h │ │ │ ├── ._inffixed.h │ │ │ ├── ._inflate.c │ │ │ ├── ._inflate.h │ │ │ ├── ._inftrees.c │ │ │ ├── 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FiniteElement ├── CracksDeepBlue │ ├── MYSUBROUTINES │ │ └── MYSUBROUTINES │ │ │ ├── CALC_DADN.for │ │ │ ├── CALC_KOP.for │ │ │ ├── CONV_S_TO_DISP.for │ │ │ ├── CONV_S_TO_K.for │ │ │ ├── NUM_INT.for │ │ │ ├── OOR_REDUCE.for │ │ │ ├── RESEQ.for │ │ │ ├── UAMP.for │ │ │ ├── UEXTERNALDB.for │ │ │ └── URDFIL.for │ ├── RPDD │ │ └── RPDD │ │ │ ├── COPYING │ │ │ ├── ConstCrack │ │ │ ├── AddStep_KL.m │ │ │ ├── AddStep_KL.m~ │ │ │ ├── AddStep_Predict.m │ │ │ ├── AddStep_Smooth.m │ │ │ ├── BetaError.m~ │ │ │ ├── CPDgen.m~ │ │ │ ├── CPDgen_DBN.m │ │ │ ├── CPDgen_SBN.m │ │ │ ├── CPDgen_SBN.m~ │ │ │ ├── ConsCrack_RUN.m~ │ │ │ ├── ConsCrack_RUN4Time.m~ │ │ │ ├── ConstCrack_BLR.m │ │ │ ├── ConstCrack_BLR.m~ │ │ │ ├── ConstCrack_DBNModel.m │ │ │ ├── ConstCrack_JtreeModel.m~ │ │ │ ├── ConstCrack_KF.m │ │ │ ├── ConstCrack_RUN.m │ │ │ ├── ConstCrack_SBNModel.m │ │ │ ├── ConstCrack_SBNModel.m~ │ │ │ ├── ConstCrack_Unif.m │ │ │ ├── ConstCrack_Unif.m~ │ │ │ ├── ConstCrack_myDD.m │ │ │ ├── ConstCrack_myDD.m~ 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LNormToNorm.m │ │ │ ├── M_CPDgen.m │ │ │ ├── NormalDisc.m │ │ │ ├── Output.mat │ │ │ ├── Readme │ │ │ ├── Readme~ │ │ │ ├── ReliabIndex.m │ │ │ ├── StochasticCrack_Fine.m │ │ │ ├── StochasticCrack_Fine.mat │ │ │ ├── StochasticCrack_RUN.m │ │ │ ├── StochasticCrack_RUN.m~ │ │ │ ├── StochasticCrack_Unif_Log.m │ │ │ ├── StochasticCrack_Unif_Log.m~ │ │ │ ├── StochasticCrack_myDD.m │ │ │ ├── StochasticCrack_myDD.m~ │ │ │ ├── StochasticCrack_myDDKL.m │ │ │ ├── StochasticCrack_myDDKL.m~ │ │ │ ├── Ytc_CPDgen.m │ │ │ ├── a_CPDgen.m │ │ │ ├── fYint.m │ │ │ └── faint.m │ ├── code │ │ └── CS_codes │ │ │ ├── .DS_Store │ │ │ ├── ._.DS_Store │ │ │ ├── CFRP_mm.py │ │ │ ├── CFRP_opt.py │ │ │ ├── Cant_tube_mm.py │ │ │ ├── Cant_tube_opt.py │ │ │ ├── LICENSE │ │ │ ├── evolutionary_operators.py │ │ │ ├── kriging_hess.py │ │ │ ├── latinhypercube.py │ │ │ ├── nsga2_michigan_vfo.py │ │ │ ├── pareto_front_comparison.py │ │ │ ├── post_process.py │ │ │ ├── pp_cfrp.py │ │ │ ├── pp_tube.py │ │ │ └── pyre │ │ │ ├── .DS_Store │ │ │ ├── ._.DS_Store │ │ │ ├── __init__.py │ │ │ ├── __init__.pyc │ │ │ ├── cholesky.py │ │ │ ├── cholesky.pyc │ │ │ ├── correlation.py │ │ │ ├── correlation.pyc │ │ │ ├── distributions │ │ │ ├── __init__.py │ │ │ ├── __init__.pyc │ │ │ ├── beta.py │ │ │ ├── beta.pyc │ │ │ ├── chisquare.py │ │ │ ├── chisquare.pyc │ │ │ ├── distribution.py │ │ │ ├── distribution.pyc │ │ │ ├── gamma.py │ │ │ ├── gamma.pyc │ │ │ ├── gumbel.py │ │ │ ├── gumbel.pyc │ │ │ ├── lognormal.py │ │ │ ├── lognormal.pyc │ │ │ ├── normal.py │ │ │ ├── normal.pyc │ │ │ ├── shiftedexponential.py │ │ │ ├── shiftedexponential.pyc │ │ │ ├── shiftedrayleigh.py │ │ │ ├── shiftedrayleigh.pyc │ │ │ ├── typeiiismallestvalue.py │ │ │ ├── typeiiismallestvalue.pyc │ │ │ ├── typeiilargestvalue.py │ │ │ ├── typeiilargestvalue.pyc │ │ │ ├── typeilargestvalue.py │ │ │ ├── typeilargestvalue.pyc │ │ │ ├── typeismallestvalue.py │ │ │ ├── typeismallestvalue.pyc │ │ │ ├── uniform.py │ │ │ ├── uniform.pyc │ │ │ ├── weibull.py │ │ │ └── weibull.pyc │ │ │ ├── form.py │ │ │ ├── form.pyc │ │ │ ├── integration.py │ │ │ ├── integration.pyc │ │ │ ├── limitstate.py │ │ │ ├── limitstate.pyc │ │ │ ├── mc.py │ │ │ ├── mc.pyc │ │ │ ├── model.py │ │ │ ├── model.pyc │ │ │ ├── quadrature.py │ │ │ ├── quadrature.pyc │ │ │ ├── stepsize.py │ │ │ ├── stepsize.pyc │ │ │ ├── transformation.py │ │ │ └── transformation.pyc │ └── readme.md ├── GUOJITAN │ ├── MyCodes │ │ ├── ch3_triangle.py │ │ └── ch4_gaussQuad.py │ ├── matlab版 │ │ ├── 第3章 平面三角形单元 │ │ │ ├── Elastic_Matrix.m │ │ │ ├── Equivalent_Nodal_Force_Surface.m │ │ │ ├── File_Name.m │ │ │ ├── Main_Strees.m │ │ │ ├── Plane_B3_Matrix.m │ │ │ ├── Plane_Tri_Load_Vector.m │ │ │ ├── Plane_Tri_Model_Data.m │ │ │ ├── Plane_Tri_Stiff_Matrix.m │ │ │ ├── Plane_Tri_Strees.m │ │ │ ├── Plane_Triangular_Element.m │ │ │ ├── Solve_1_Model.m │ │ │ └── sjx_RES.txt │ │ ├── 第4章 平面四边形单元与收敛准则 │ │ │ ├── 1.高斯积分函数Integral_Gauss.txt │ │ │ ├── 10.四节点等参单元应力函数.txt │ │ │ ├── 11.四节点等参单元程序使用说明.txt │ │ │ ├── 12.算例4.1模型数据.txt │ │ │ ├── 13.算例4.1模型数据的函数.txt │ │ │ ├── 14.四节点等参单元主函数（简版）.txt │ │ │ ├── 15.算例4.1计算结果文件.txt │ │ │ ├── 16.算例4.1的模型图及结果云图.docx │ │ │ ├── 2.推导几何模式函数XY_CxiEta.txt │ │ │ ├── 3.雅可比函数Jacobian.txt │ │ │ ├── 4.高斯积分法计算单元刚度矩阵函数.txt │ │ │ ├── 5.四节点等参单元应变矩阵.txt │ │ │ ├── 6.四节点等参单元总刚度矩阵.txt │ │ │ ├── 7.四节点等参单元面力等效载荷函数.txt │ │ │ ├── 8.四节点等参单元体力等效载荷函数.txt │ │ │ ├── 9.四节点等参单元总载荷矢量函数.txt │ │ │ ├── Equivalent_Nodal_Force_Body.m │ │ │ ├── Equivalent_Nodal_Force_Surface.m │ │ │ ├── Gauss_Stiff_Matrix.m │ │ │ ├── Integral_Gauss.m │ │ │ ├── Jacobian.m │ │ │ ├── Plane_Quad4_Model.m │ │ │ ├── Plane_Quad_4_Load_Matrix.m │ │ │ ├── Plane_Quad_4_Stiff_Matrix.m │ │ │ ├── Plane_Quadrilateral_Element.m │ │ │ ├── Q4dengcanyuan_RES.txt │ │ │ ├── Quad_B4_Matrix.m │ │ │ ├── Quadrilateral_Strees.m │ │ │ └── XY_CxiEta.m │ │ ├── 第5章 轴对称问题 │ │ │ ├── 1.轴对称模型数据格式.txt │ │ │ ├── 10.算例5.1计算结果文件.txt │ │ │ ├── 11.算例5.1轴对称模型图及结果云图.docx │ │ │ ├── 2.轴对称总刚度矩阵函数.txt │ │ │ ├── 3.轴对称应变矩阵函数.txt │ │ │ ├── 4.轴对称载荷矢量函数.txt │ │ │ ├── 5.求解轴对称有限元方程.txt │ │ │ ├── 6.计算轴对称单元应力函数.txt │ │ │ ├── 7.轴对称三角形单元程序使用说明.txt │ │ │ ├── 8.轴对称三角元主函数（简版）.txt │ │ │ └── 9.算例5.1模型数据的函数.txt │ │ ├── 第7章 杆系结构 │ │ │ ├── 1.杆元长度及方位函数.txt │ │ │ ├── 10.平面桁架主功能函数.txt │ │ │ ├── 11.算例7.1桁架模型数据的函数.txt │ │ │ ├── 12.算例7.1桁架结构结果文件.txt │ │ │ ├── 13.算例7.2平面桁架模型数据hj_2D.txt │ │ │ ├── 2.杆元刚度矩阵.txt │ │ │ ├── 3.桁架结构整体刚度矩阵.txt │ │ │ ├── 4.杆元上集中力函数.txt │ │ │ ├── 5.杆元上线性分布力函数.txt │ │ │ ├── 6.桁架结构总的载荷矢量.txt │ │ │ ├── 7.求解桁架结构有限元方程函数.txt │ │ │ ├── 8.计算桁架杆件内力函数.txt │ │ │ └── 9.平面桁架结构程序使用说明.txt │ │ └── 第8章 平板弯曲 │ │ │ ├── 1.推导矩形薄板刚度矩阵程序.txt │ │ │ └── 2.推导薄板线性面力等效载荷程序.txt │ └── 有限元与MTALAB程序设计程序文件 │ │ ├── 第3章 平面三角形单元 │ │ ├── 1.文件名管理函数.txt │ │ ├── 10.计算主应力函数.txt │ │ ├── 11.算例3.2模型数据文档_sjxdy.txt │ │ ├── 12.平面三角元主函数（简版）.txt │ │ ├── 13.平面三角形单元程序使用说明.txt │ │ ├── 14.算例3.2模型数据的函数.txt │ │ ├── 15.算例3.2平面三角形单元模型图及结果云图.docx │ │ ├── 16.算例3.2平面问题计算结果数据文件.txt │ │ ├── 2.平面三角形单元模型数据格式案例.txt │ │ ├── 3.弹性矩阵函数.txt │ │ ├── 4.应变矩阵函数.txt │ │ ├── 5.总刚度矩阵函数.txt │ │ ├── 6.面力等效节点载荷的通用函数.txt │ │ ├── 7.总载荷矢量函数.txt │ │ ├── 8.置“1”法求解有限元方程函数.txt │ │ └── 9.计算单元应力分量函数.txt │ │ ├── 第4章 平面四边形单元与收敛准则 │ │ ├── 1.高斯积分函数Integral_Gauss.txt │ │ ├── 10.四节点等参单元应力函数.txt │ │ ├── 11.四节点等参单元程序使用说明.txt │ │ ├── 12.算例4.1模型数据.txt │ │ ├── 13.算例4.1模型数据的函数.txt │ │ ├── 14.四节点等参单元主函数（简版）.txt │ │ ├── 15.算例4.1计算结果文件.txt │ │ ├── 16.算例4.1的模型图及结果云图.docx │ │ ├── 2.推导几何模式函数XY_CxiEta.txt │ │ ├── 3.雅可比函数Jacobian.txt │ │ ├── 4.高斯积分法计算单元刚度矩阵函数.txt │ │ ├── 5.四节点等参单元应变矩阵.txt │ │ ├── 6.四节点等参单元总刚度矩阵.txt │ │ ├── 7.四节点等参单元面力等效载荷函数.txt │ │ ├── 8.四节点等参单元体力等效载荷函数.txt │ │ └── 9.四节点等参单元总载荷矢量函数.txt │ │ ├── 第5章 轴对称问题 │ │ ├── 1.轴对称模型数据格式.txt │ │ ├── 10.算例5.1计算结果文件.txt │ │ ├── 11.算例5.1轴对称模型图及结果云图.docx │ │ ├── 2.轴对称总刚度矩阵函数.txt │ │ ├── 3.轴对称应变矩阵函数.txt │ │ ├── 4.轴对称载荷矢量函数.txt │ │ ├── 5.求解轴对称有限元方程.txt │ │ ├── 6.计算轴对称单元应力函数.txt │ │ ├── 7.轴对称三角形单元程序使用说明.txt │ │ ├── 8.轴对称三角元主函数（简版）.txt │ │ └── 9.算例5.1模型数据的函数.txt │ │ ├── 第7章 杆系结构 │ │ ├── 1.杆元长度及方位函数.txt │ │ ├── 10.平面桁架主功能函数.txt │ │ ├── 11.算例7.1桁架模型数据的函数.txt │ │ ├── 12.算例7.1桁架结构结果文件.txt │ │ ├── 13.算例7.2平面桁架模型数据hj_2D.txt │ │ ├── 2.杆元刚度矩阵.txt │ │ ├── 3.桁架结构整体刚度矩阵.txt │ │ ├── 4.杆元上集中力函数.txt │ │ ├── 5.杆元上线性分布力函数.txt │ │ ├── 6.桁架结构总的载荷矢量.txt │ │ ├── 7.求解桁架结构有限元方程函数.txt │ │ ├── 8.计算桁架杆件内力函数.txt │ │ └── 9.平面桁架结构程序使用说明.txt │ │ └── 第8章 平板弯曲 │ │ ├── 1.推导矩形薄板刚度矩阵程序.txt │ │ └── 2.推导薄板线性面力等效载荷程序.txt ├── NodalGalerkin_Book │ └── nodal-dg-master │ │ ├── Codes1.1 │ │ ├── CFD1D │ │ │ ├── Euler1D.m │ │ │ ├── EulerDriver1D.m │ │ │ ├── EulerRHS1D.m │ │ │ ├── SlopeLimit1.m │ │ │ ├── SlopeLimitLin.m │ │ │ ├── SlopeLimitN.m │ │ │ ├── minmod.m │ │ │ └── minmodB.m │ │ ├── CFD2D │ │ │ ├── BoxFlowBC2D.m │ │ │ ├── BoxFlowIC2D.m │ │ │ ├── ChannelBC2D.m │ │ │ ├── ChannelIC2D.m │ │ │ ├── CouetteBC2D.m │ │ │ ├── CouetteIC2D.m │ │ │ ├── CurvedCNS2D.m │ │ │ ├── CurvedCNSDriver2D.m │ │ │ ├── CurvedCNSRHS2D.m │ │ │ ├── CurvedCNSdt2D.m │ │ │ ├── CurvedDGDiv2D.m │ │ │ ├── CurvedDGGrad2D.m │ │ │ ├── CurvedDGJump2D.m │ │ │ ├── CurvedDGPenalty2D.m │ │ │ ├── CurvedEuler2D.m │ │ │ ├── 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└── PegIC2D.m │ │ ├── Codes1D │ │ │ ├── Advec1D.m │ │ │ ├── AdvecDriver1D.m │ │ │ ├── AdvecRHS1D.m │ │ │ ├── BuildMaps1D.m │ │ │ ├── Burgers1D.m │ │ │ ├── BurgersDriver1D.m │ │ │ ├── BurgersRHS1D.m │ │ │ ├── Connect1D.m │ │ │ ├── DispersiveLDGRHS1D.m │ │ │ ├── Dmatrix1D.m │ │ │ ├── Filter1D.m │ │ │ ├── GeometricFactors1D.m │ │ │ ├── Globals1D.m │ │ │ ├── GradJacobiP.m │ │ │ ├── GradVandermonde1D.m │ │ │ ├── Heat1D.m │ │ │ ├── HeatCRHS1D.m │ │ │ ├── HeatCstabRHS1D.m │ │ │ ├── HeatDriver1D.m │ │ │ ├── HeatLDGRHS1D.m │ │ │ ├── JacobiGL.m │ │ │ ├── JacobiGQ.m │ │ │ ├── JacobiP.m │ │ │ ├── Lift1D.m │ │ │ ├── Maxwell1D.m │ │ │ ├── MaxwellDriver1D.m │ │ │ ├── MaxwellRHS1D.m │ │ │ ├── Normals1D.m │ │ │ ├── PoissonCDriver1D.m │ │ │ ├── PoissonCstab1D.m │ │ │ ├── PoissonCstabRHS1D.m │ │ │ ├── PoissonIPstabRHS1D.m │ │ │ ├── StartUp1D.m │ │ │ └── Vandermonde1D.m │ │ ├── Codes2D │ │ │ ├── BuildBCMaps2D.m │ │ │ ├── BuildCurvedOPS2D.m │ │ │ ├── BuildHNonCon2D.m │ │ │ ├── BuildMaps2D.m │ │ │ ├── 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main.cpp │ │ │ │ ├── STL │ │ │ │ ├── CMakeLists.txt │ │ │ │ ├── STL_interface.hh │ │ │ │ └── main.cpp │ │ │ │ ├── blitz │ │ │ │ ├── CMakeLists.txt │ │ │ │ ├── blitz_LU_solve_interface.hh │ │ │ │ ├── blitz_interface.hh │ │ │ │ ├── btl_blitz.cpp │ │ │ │ ├── btl_tiny_blitz.cpp │ │ │ │ └── tiny_blitz_interface.hh │ │ │ │ ├── eigen2 │ │ │ │ ├── CMakeLists.txt │ │ │ │ ├── btl_tiny_eigen2.cpp │ │ │ │ ├── eigen2_interface.hh │ │ │ │ ├── main_adv.cpp │ │ │ │ ├── main_linear.cpp │ │ │ │ ├── main_matmat.cpp │ │ │ │ └── main_vecmat.cpp │ │ │ │ ├── eigen3 │ │ │ │ ├── CMakeLists.txt │ │ │ │ ├── btl_tiny_eigen3.cpp │ │ │ │ ├── eigen3_interface.hh │ │ │ │ ├── main_adv.cpp │ │ │ │ ├── main_linear.cpp │ │ │ │ ├── main_matmat.cpp │ │ │ │ └── main_vecmat.cpp │ │ │ │ ├── gmm │ │ │ │ ├── CMakeLists.txt │ │ │ │ ├── gmm_LU_solve_interface.hh │ │ │ │ ├── gmm_interface.hh │ │ │ │ └── main.cpp │ │ │ │ ├── mtl4 │ │ │ │ ├── .kdbgrc.main │ │ │ │ ├── CMakeLists.txt │ │ │ │ ├── main.cpp │ │ │ │ ├── mtl4_LU_solve_interface.hh │ │ │ │ └── mtl4_interface.hh │ │ │ │ ├── tvmet │ │ │ │ ├── CMakeLists.txt │ │ │ │ ├── main.cpp │ │ │ │ └── tvmet_interface.hh │ │ │ │ └── ublas │ │ │ │ ├── CMakeLists.txt │ │ │ │ ├── main.cpp │ │ │ │ └── ublas_interface.hh │ │ ├── check_cache_queries.cpp │ │ ├── eig33.cpp │ │ ├── geometry.cpp │ │ ├── product_threshold.cpp │ │ ├── quat_slerp.cpp │ │ ├── quatmul.cpp │ │ ├── sparse_cholesky.cpp │ │ ├── sparse_dense_product.cpp │ │ ├── sparse_lu.cpp │ │ ├── sparse_product.cpp │ │ ├── sparse_randomsetter.cpp │ │ ├── sparse_setter.cpp │ │ ├── sparse_transpose.cpp │ │ ├── sparse_trisolver.cpp │ │ ├── spbench │ │ │ ├── CMakeLists.txt │ │ │ ├── spbenchsolver.cpp │ │ │ └── spbenchsolver.h │ │ ├── spmv.cpp │ │ └── vdw_new.cpp │ ├── cmake │ │ ├── CMakeDetermineVSServicePack.cmake │ │ ├── EigenConfigureTesting.cmake │ │ ├── EigenDetermineOSVersion.cmake │ │ ├── EigenTesting.cmake │ │ ├── FindAdolc.cmake │ │ ├── FindBLAS.cmake │ │ ├── FindCholmod.cmake │ │ ├── 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transpose_on_const_type_actually_const.cpp │ ├── lapack │ │ ├── CMakeLists.txt │ │ ├── cholesky.cpp │ │ ├── complex_double.cpp │ │ ├── complex_single.cpp │ │ ├── double.cpp │ │ ├── eigenvalues.cpp │ │ ├── lapack_common.h │ │ ├── lu.cpp │ │ └── single.cpp │ ├── scripts │ │ ├── CMakeLists.txt │ │ ├── buildtests.in │ │ ├── check.in │ │ ├── debug.in │ │ ├── eigen_gen_credits.cpp │ │ ├── eigen_gen_docs │ │ ├── release.in │ │ └── relicense.py │ └── signature_of_eigen3_matrix_library │ ├── cubature │ ├── .DS_Store │ ├── CUBATURE_GENERATOR_EIGEN.cpp │ ├── CUBATURE_GENERATOR_EIGEN.h │ └── CUBATURE_GENERATOR_EIGEN.o │ ├── geometry │ ├── .DS_Store │ ├── FIELD_3D.cpp │ ├── FIELD_3D.h │ ├── FIELD_3D.o │ ├── OBSTACLE.h │ ├── VECTOR3_FIELD_3D.cpp │ ├── VECTOR3_FIELD_3D.h │ └── VECTOR3_FIELD_3D.o │ ├── glvu │ ├── .DS_Store │ ├── camera.h │ ├── glvu.cpp │ ├── glvu.h │ ├── glvu.o │ ├── glvuMat16fv.h │ ├── glvuVec3f.h │ ├── glvuVec3fv.h │ ├── snapshot.h │ ├── text.h │ └── trackball.h │ ├── integrators │ ├── .DS_Store │ ├── FLUID_3D_MIC.cpp │ ├── FLUID_3D_MIC.h │ ├── FLUID_3D_MIC.o │ ├── SUBSPACE_FLUID_3D_EIGEN.cpp │ ├── SUBSPACE_FLUID_3D_EIGEN.h │ └── SUBSPACE_FLUID_3D_EIGEN.o │ ├── linearalgebra │ ├── .DS_Store │ ├── BIG_MATRIX.cpp │ ├── BIG_MATRIX.h │ ├── BIG_MATRIX.o │ ├── EIGEN.cpp │ ├── EIGEN.h │ ├── EIGEN.o │ ├── MATRIX.cpp │ ├── MATRIX.h │ ├── MATRIX.o │ ├── MATRIX3.cpp │ ├── MATRIX3.h │ ├── MATRIX3.o │ ├── NNLS.cpp │ ├── NNLS.h │ ├── NNLS.o │ ├── SPARSE_MATRIX.cpp │ ├── SPARSE_MATRIX.h │ ├── SPARSE_MATRIX.o │ ├── SPARSE_MATRIX_ARRAY.cpp │ ├── SPARSE_MATRIX_ARRAY.h │ ├── SPARSE_MATRIX_ARRAY.o │ ├── VEC2.h │ ├── VEC3.h │ ├── VECTOR.cpp │ ├── VECTOR.h │ └── VECTOR.o │ ├── matlab │ ├── .DS_Store │ ├── analyzeSnapshots.m │ ├── analyzeSnapshots.perl │ ├── bbnnls.m │ ├── bbnnlsFromFile.m │ ├── fnnls.m │ ├── fnnlsFromFile.m │ ├── leastsquares.m │ ├── matlabSVD.perl │ ├── nnls.m │ ├── pinvleastsquares.m │ ├── transposeSVD.perl │ └── writevector.m │ └── util │ ├── .DS_Store │ ├── MERSENNETWISTER.h │ ├── QUICKTIME_MOVIE.h │ ├── SIMPLE_PARSER.cpp │ ├── SIMPLE_PARSER.h │ ├── SIMPLE_PARSER.o │ ├── TIMER.cpp │ ├── TIMER.h │ └── TIMER.o ├── FrontTracking ├── DNS-Solver.pdf ├── LevelSetSculpt │ ├── fastlevelset.cpp │ ├── fastlevelset.h │ └── main.cpp ├── MatchingFluid │ └── voronoi2d │ │ ├── Makefile │ │ ├── Makefile.example_defs │ │ ├── VoronoiFluid2D.sln │ │ ├── VoronoiFluid2D.vcproj │ │ ├── accelerationgrid.cpp │ │ ├── accelerationgrid.h │ │ ├── broadphasegrid.cpp │ │ ├── broadphasegrid.h │ │ ├── common │ │ ├── array1.h │ │ ├── array2.h │ │ ├── blas_wrapper.h │ │ ├── ccd_wrapper.h │ │ ├── collisionqueries.cpp │ │ ├── collisionqueries.h │ │ ├── cubic_ccd_wrapper.cpp │ │ ├── gluvi.cpp │ │ ├── gluvi.h │ │ ├── hashtable.h │ │ ├── makelevelset2.h │ │ ├── marching_triangles.cpp │ │ ├── marching_triangles.h │ │ ├── mat.h │ │ ├── openglutils.cpp │ │ ├── openglutils.h │ │ ├── predicates.cpp │ │ ├── predicates.h │ │ ├── util.h │ │ ├── vec.h │ │ ├── vector_math.h │ │ ├── wallclocktime.cpp │ │ └── wallclocktime.h │ │ ├── dist_funcs.cpp │ │ ├── dist_funcs.h │ │ ├── dualfluidsim.cpp │ │ ├── dualfluidsim.h │ │ ├── dynamicsurface.cpp │ │ ├── dynamicsurface.h │ │ ├── edgemesh.cpp │ │ ├── edgemesh.h │ │ ├── eltopo.cpp │ │ ├── eltopo.h │ │ ├── framestepper.cpp │ │ ├── framestepper.h │ │ ├── geom_routines.cpp │ │ ├── geom_routines.h │ │ ├── interpolator.cpp │ │ ├── interpolator.h │ │ ├── main.cpp │ │ ├── meshlevelset.cpp │ │ ├── meshlevelset.h │ │ ├── newsparse │ │ ├── dense_matrix.cpp │ │ ├── dense_matrix.h │ │ ├── krylov_solvers.cpp │ │ ├── krylov_solvers.h │ │ ├── linear_operator.h │ │ ├── sparse_matrix.cpp │ │ └── sparse_matrix.h │ │ ├── pressure_vor2d.cpp │ │ ├── pressure_vor2d.h │ │ ├── readme.txt │ │ ├── sampleseeder.cpp │ │ ├── sampleseeder.h │ │ ├── scenes.cpp │ │ ├── scenes.h │ │ ├── sparse │ │ ├── cgsolver.h │ │ ├── sparseilu.h │ │ ├── sparsematrix.h │ │ └── sparsemilu.h │ │ ├── surftrack.cpp │ │ ├── surftrack.h │ │ ├── triangle │ │ ├── triangle.c │ │ └── triangle.h │ │ ├── triangle_wrapper.cpp │ │ ├── triangle_wrapper.h │ │ ├── trimesh2d.cpp │ │ └── trimesh2d.h └── skin │ └── src │ ├── Makefile │ ├── README.TXT │ ├── kdTree.H │ ├── kdTree.cpp │ ├── main.cpp │ ├── marchingCube.H │ ├── marchingCube.cpp │ ├── particleIO.H │ ├── particleIO.cpp │ ├── slMatrix.H │ ├── slMatrix.cpp │ ├── slUtil.H │ ├── slUtil.cpp │ ├── slVector.H │ ├── slVector.cpp │ ├── smoothingFilter.H │ ├── smoothingFilter.cpp │ ├── smoothingGrid.H │ └── smoothingGrid.cpp ├── Gemotry ├── AdaptDynamicMeshes │ ├── ADM │ │ ├── .DS_Store │ │ ├── Makefile │ │ ├── README │ │ ├── TML │ │ │ ├── .svn │ │ │ │ ├── entries │ │ │ │ ├── format │ │ │ │ └── text-base │ │ │ │ │ ├── Makefile.svn-base │ │ │ │ │ └── README.svn-base │ │ │ ├── Makefile │ │ │ ├── README │ │ │ ├── TNT │ │ │ │ ├── .svn │ │ │ │ │ ├── entries │ │ │ │ │ ├── format │ │ │ │ │ └── text-base │ │ │ │ │ │ ├── jama_cholesky.h.svn-base │ │ │ │ │ │ ├── jama_eig.h.svn-base │ │ │ │ │ │ ├── jama_lu.h.svn-base │ │ │ │ │ │ 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format │ │ │ │ ├── edge.h │ │ │ │ ├── facet.h │ │ │ │ ├── heap.h │ │ │ │ ├── io.h │ │ │ │ ├── r3.h │ │ │ │ ├── rply.h │ │ │ │ ├── tml.h │ │ │ │ ├── trimesh.h │ │ │ │ └── vertex.h │ │ │ ├── lib │ │ │ │ └── .svn │ │ │ │ │ ├── entries │ │ │ │ │ └── format │ │ │ └── src │ │ │ │ ├── .svn │ │ │ │ ├── entries │ │ │ │ ├── format │ │ │ │ └── text-base │ │ │ │ │ ├── Makefile.svn-base │ │ │ │ │ ├── basic_io.cc.svn-base │ │ │ │ │ ├── edge.cc.svn-base │ │ │ │ │ ├── edge.h.svn-base │ │ │ │ │ ├── facet.cc.svn-base │ │ │ │ │ ├── facet.h.svn-base │ │ │ │ │ ├── heap.cc.svn-base │ │ │ │ │ ├── heap.h.svn-base │ │ │ │ │ ├── ifs_io.cc.svn-base │ │ │ │ │ ├── io.h.svn-base │ │ │ │ │ ├── obj_io.cc.svn-base │ │ │ │ │ ├── ply_io.cc.svn-base │ │ │ │ │ ├── quaternion.cc.svn-base │ │ │ │ │ ├── r3.h.svn-base │ │ │ │ │ ├── rply.c.svn-base │ │ │ │ │ ├── rply.h.svn-base │ │ │ │ │ ├── tml.h.svn-base │ │ │ │ │ ├── trimesh.h.svn-base │ │ │ │ │ ├── vertex.cc.svn-base │ │ │ │ │ └── vertex.h.svn-base │ │ │ │ ├── Makefile │ │ │ │ ├── basic_io.cc │ │ │ │ ├── edge.cc │ │ │ │ ├── edge.h │ │ │ │ ├── facet.cc │ │ │ │ ├── facet.h │ │ │ │ ├── heap.cc │ │ │ │ ├── heap.h │ │ │ │ ├── ifs_io.cc │ │ │ │ ├── io.h │ │ │ │ ├── obj_io.cc │ │ │ │ ├── ply_io.cc │ │ │ │ ├── quaternion.cc │ │ │ │ ├── r3.h │ │ │ │ ├── rply.c │ │ │ │ ├── rply.h │ │ │ │ ├── tml.h │ │ │ │ ├── trimesh.h │ │ │ │ ├── vertex.cc │ │ │ │ └── vertex.h │ │ ├── examples │ │ │ ├── .DS_Store │ │ │ ├── ADMmake.defs │ │ │ ├── adm_viewer.h │ │ │ ├── base_mesh │ │ │ │ ├── cube.off │ │ │ │ ├── cylinder.off │ │ │ │ └── plane.off │ │ │ ├── cubelp │ │ │ │ ├── .DS_Store │ │ │ │ ├── Makefile │ │ │ │ ├── lp3d.h │ │ │ │ ├── main.cc │ │ │ │ ├── multi.cc │ │ │ │ └── multi_criteria.h │ │ │ ├── drawing.h │ │ │ ├── ellipsoid │ │ │ │ ├── Makefile │ │ │ │ ├── ellipsoid.h │ │ │ │ └── main.cc │ │ │ ├── extrudelp │ │ │ │ ├── Makefile │ │ │ │ ├── extrudelp.h │ │ │ │ └── main.cc │ │ │ ├── glViewer.h │ │ │ ├── levelset │ │ │ │ ├── .DS_Store │ │ │ │ ├── Makefile │ │ │ │ ├── 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fpclassify.h │ │ │ │ └── jet.h │ │ │ └── main.cpp │ │ └── writeup │ │ │ ├── makefile │ │ │ ├── mls.pdf │ │ │ └── mls.tex │ └── mls.pdf ├── derivate │ ├── code │ │ ├── SConstruct │ │ ├── example-a.cpp │ │ ├── example-b-step-1.cpp │ │ ├── example-b-step-2.cpp │ │ ├── example-b-step-3.cpp │ │ ├── example-b-step-4.cpp │ │ ├── example-b-step-5.cpp │ │ ├── example-b-step-6.cpp │ │ ├── example-b-step-7.cpp │ │ ├── example-b-step-8.cpp │ │ ├── example-b.cpp │ │ ├── example-b2-step-1.cpp │ │ ├── example-b2-step-2.cpp │ │ ├── example-b2-step-3.cpp │ │ ├── example-b2-step-4.cpp │ │ ├── example-b2-step-5.cpp │ │ ├── example-b2-step-6.cpp │ │ ├── example-b2-step-7.cpp │ │ ├── example-b2.cpp │ │ ├── example-c-step-1.cpp │ │ ├── example-c-step-10.cpp │ │ ├── example-c-step-11.cpp │ │ ├── example-c-step-2.cpp │ │ ├── example-c-step-3.cpp │ │ ├── example-c-step-4.cpp │ │ ├── example-c-step-5.cpp │ │ ├── example-c-step-6.cpp │ │ ├── example-c-step-7.cpp │ │ ├── example-c-step-8.cpp │ │ ├── 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Singular_Value_Decomposition_Kernel_Declarations.hpp │ │ ├── Singular_Value_Decomposition_Main_Kernel_Body.hpp │ │ ├── Singular_Value_Decomposition_Preamble.hpp │ │ ├── Singular_Value_Decomposition_Streaming_Test.cpp │ │ └── Singular_Value_Decomposition_Unit_Test.cpp ├── multipcg │ ├── bridsongreif-2005-multipcg.pdf │ └── multipcg.m └── parallelMultigrid │ └── MGPCG-1.0 │ ├── COPYRIGHT.txt │ ├── Projects │ └── multigrid_poisson_for_pcg │ │ ├── BOX_ITERATOR.h │ │ ├── MG_PRECONDITIONED_CONJUGATE_GRADIENT.h │ │ ├── MULTIGRID_POISSON.cpp │ │ ├── MULTIGRID_POISSON.h │ │ ├── MULTIGRID_POISSON_REFINEMENT.cpp │ │ ├── MULTIGRID_POISSON_REFINEMENT.h │ │ ├── MULTIGRID_POISSON_SOLVER.h │ │ ├── MULTIGRID_POISSON_TESTS.h │ │ ├── Makefile │ │ ├── SConscript │ │ └── main.cpp │ ├── Public_Library │ ├── Advection_Equations │ │ └── ADVECTION_FORWARD.h │ ├── Arrays │ │ ├── ARRAY.h │ │ ├── ARRAYS_1D.h │ │ ├── ARRAYS_2D.h │ │ ├── ARRAYS_3D.h │ │ ├── ARRAYS_FORWARD.h │ │ ├── ARRAYS_ND_BASE.h │ │ ├── ARRAY_BASE.h │ │ ├── ARRAY_DIFFERENCE.h │ │ ├── ARRAY_EXPRESSION.h │ │ ├── ARRAY_LEFT_MULTIPLE.h │ │ ├── ARRAY_NEGATION.h │ │ ├── ARRAY_PLUS_SCALAR.h │ │ ├── ARRAY_PRODUCT.h │ │ ├── ARRAY_SUM.h │ │ ├── IDENTITY_MAP.h │ │ ├── LIST_ARRAY.h │ │ ├── PROJECTED_ARRAY.h │ │ └── RAW_ARRAY.h │ ├── Boundaries │ │ └── BOUNDARY_FORWARD.h │ ├── Collisions_And_Interactions │ │ └── COLLISIONS_FORWARD.h │ ├── Data_Structures │ │ ├── DATA_STRUCTURES_FORWARD.h │ │ ├── ELEMENT_ID.h │ │ └── HASHTABLE.h │ ├── Documentation │ │ └── PHYSBAM_COPYRIGHT.txt │ ├── Geometry │ │ ├── BOX.h │ │ ├── GEOMETRY_FORWARD.h │ │ └── GEOMETRY_POLICY.h │ ├── Grids │ │ ├── GRID_0D.h │ │ ├── GRID_1D.cpp │ │ ├── GRID_1D.h │ │ ├── GRID_2D.cpp │ │ ├── GRID_2D.h │ │ ├── GRID_3D.cpp │ │ ├── GRID_3D.h │ │ ├── GRID_POLICY.h │ │ └── POLICY_UNIFORM.h │ ├── Interpolation │ │ └── INTERPOLATION_FORWARD.h │ ├── Math_Tools │ │ ├── Hash.h │ │ ├── Inverse.h │ │ ├── ZERO.h │ │ ├── argmax.h │ │ ├── argmin.h │ │ ├── clamp.h │ │ ├── constants.h │ │ ├── exchange.h │ │ ├── exchange_sort.h │ │ ├── integer_log.h │ │ ├── max.h │ │ ├── maxabs.h │ │ ├── maxmag.h │ │ ├── min.h │ │ ├── minmag.h │ │ ├── sign.h │ │ ├── sqr.h │ │ └── wrap.h │ ├── Matrices_And_Vectors │ │ ├── ARITHMETIC_POLICY.h │ │ ├── Dot_Product.h │ │ ├── MATRIX_FORWARD.h │ │ ├── Magnitude.h │ │ ├── SCALAR_POLICY.h │ │ ├── VECTOR.h │ │ ├── VECTOR_0D.h │ │ ├── VECTOR_1D.h │ │ ├── VECTOR_2D.h │ │ ├── VECTOR_3D.h │ │ ├── VECTOR_BASE.h │ │ ├── VECTOR_EXPRESSION.h │ │ ├── VECTOR_FORWARD.h │ │ └── VECTOR_POLICY.h │ ├── Particles │ │ └── PARTICLES_FORWARD.h │ ├── Poisson_MGPCG_optimized_kernels │ │ ├── Block_Counting_Helper.cpp │ │ ├── Block_Counting_Helper.h │ │ ├── Block_Enumeration_Helper.cpp │ │ ├── Block_Enumeration_Helper.h │ │ ├── Boundary_Initialization_Helper.cpp │ │ ├── Boundary_Initialization_Helper.h │ │ ├── Coarsened_Discretization_Helper.cpp │ │ ├── Coarsened_Discretization_Helper.h │ │ ├── Combined_Saxpy_Helper.cpp │ │ ├── Combined_Saxpy_Helper.h │ │ ├── Initialize_Interior_Bitmaps_And_Diagonal_Entries_Helper.cpp │ │ ├── Initialize_Interior_Bitmaps_And_Diagonal_Entries_Helper.h │ │ ├── Instantiation_Helpers.h │ │ ├── Multiplication_And_Dot_Product_Helper.cpp │ │ ├── Multiplication_And_Dot_Product_Helper.h │ │ ├── Multiply_And_Compute_Sum_And_Extrema_Helper.cpp │ │ ├── Multiply_And_Compute_Sum_And_Extrema_Helper.h │ │ ├── POINTER_QUEUE.h │ │ ├── PTHREAD_QUEUE.cpp │ │ ├── PTHREAD_QUEUE.h │ │ ├── Prolongation_Helper.cpp │ │ ├── Prolongation_Helper.h │ │ ├── Reduce_Maxabs_Helper.cpp │ │ ├── Reduce_Maxabs_Helper.h │ │ ├── Relaxation_And_Dot_Product_Interior_Helper.cpp │ │ ├── Relaxation_And_Dot_Product_Interior_Helper.h │ │ ├── Relaxation_And_Residual_With_Zero_Initial_Guess_Helper.cpp │ │ ├── Relaxation_And_Residual_With_Zero_Initial_Guess_Helper.h │ │ ├── Relaxation_Boundary_Helper.cpp │ │ ├── Relaxation_Boundary_Helper.h │ │ ├── Relaxation_Interior_Helper.cpp │ │ ├── Relaxation_Interior_Helper.h │ │ ├── Residual_Boundary_Helper.cpp │ │ ├── Residual_Boundary_Helper.h │ │ ├── Restriction_Helper.cpp │ │ ├── Restriction_Helper.h │ │ ├── Saxpy_Helper.cpp │ │ ├── Saxpy_Helper.h │ │ ├── Scalar_Multiply_And_Accumulate_And_Compute_Sum_And_Extrema_Helper.cpp │ │ └── Scalar_Multiply_And_Accumulate_And_Compute_Sum_And_Extrema_Helper.h │ ├── Random_Numbers │ │ └── RANDOM_NUMBERS.h │ ├── Read_Write │ │ ├── FILE_UTILITIES.cpp │ │ ├── FILE_UTILITIES.h │ │ ├── READ_WRITE.h │ │ ├── READ_WRITE_FORWARD.h │ │ ├── READ_WRITE_FUNCTIONS.h │ │ └── TYPED_STREAM.h │ ├── SConscript │ └── Utilities │ │ ├── ARG_DATA.h │ │ ├── DEBUG_UTILITIES.cpp │ │ ├── DEBUG_UTILITIES.h │ │ ├── EXCEPTIONS.cpp │ │ ├── EXCEPTIONS.h │ │ ├── INTERRUPTS.cpp │ │ ├── INTERRUPTS.h │ │ ├── LOG.cpp │ │ ├── LOG.h │ │ ├── LOG_ENTRY.cpp │ │ ├── LOG_ENTRY.h │ │ ├── LOG_SCOPE.h │ │ ├── NONCOPYABLE.h │ │ ├── PARSE_ARGS.cpp │ │ ├── PARSE_ARGS.h │ │ ├── PROCESS_UTILITIES.cpp │ │ ├── PROCESS_UTILITIES.h │ │ ├── STATIC_ASSERT.h │ │ ├── STRING_UTILITIES.cpp │ │ ├── STRING_UTILITIES.h │ │ ├── TIMER.cpp │ │ ├── TIMER.h │ │ ├── TYPE_UTILITIES.h │ │ └── override.h │ ├── README │ └── Scripts │ └── scons │ ├── README │ ├── SConstruct │ ├── SConstruct.options │ ├── setup_scons.py │ └── wrapper_template ├── Math └── Eigen │ └── jacobiSVD.py ├── MeshGeneration └── mesh2d │ ├── centroid_mesh.m │ ├── checkgeometry.m │ ├── circumcircle.m │ ├── connectivity.m │ ├── dist2poly.m │ ├── findedge.m │ ├── fixmesh.m │ ├── inpoly.m │ ├── mesh2d.m │ ├── mesh2d_to_xml.m │ ├── meshfaces.m │ ├── meshpoly.m │ ├── mydelaunayn.m │ ├── mytsearch.m │ ├── quadtree.m │ ├── quality.m │ ├── read.txt │ ├── refine.m │ ├── smoothmesh.m │ ├── tinterp.m │ ├── triarea.m │ └── tsearch_mex.c ├── MultiGrid └── amglab │ ├── ACMeasure.m │ ├── AMGLab.m │ ├── AMGLab_GUI.fig │ ├── AMGLab_GUI.m │ ├── AMGeCoarsen.m │ ├── AMGmCoarsen.m │ ├── AccumulateMatrix.m │ ├── Dirichlet_Correction.m │ ├── GetEdgeElements_Schur.m │ ├── IQMeasure.m │ ├── NodeNeighbors.m │ ├── NodeNeighborsEdges.m │ ├── NodeNeighbourAMGe.m │ ├── README.txt │ ├── README_UF.txt │ ├── RugeStuebenCoarsen.m │ ├── SOR_smoother.m │ ├── SmoothAggregateCoarsen.m │ ├── Synopsis.txt │ ├── UFget.m │ ├── UFget_defaults.m │ ├── UFget_example.m │ ├── UFget_lookup.m │ ├── UFgrep.m │ ├── UFweb.m │ ├── amg_cycle.m │ ├── amg_defaults.m │ ├── amg_example1.m │ ├── amg_globals.m │ ├── amg_setup.m │ ├── amg_solve.m │ ├── amg_usersetFD.m │ ├── amg_usersetFEM.m │ ├── amg_usersetMAT.m │ ├── amg_usersetUF.m │ ├── anisox_81.txt │ ├── beck_coarsen.m │ ├── coarse_solve.m │ ├── descendSort.m │ ├── e32_isb.txt │ ├── gauss_elim.m │ ├── get_settings.m │ ├── interpolate.m │ ├── jacobi_smoother.m │ ├── residual.m │ ├── restrict.m │ ├── richardson_smoother.m │ ├── settingsGUI.fig │ ├── settingsGUI.m │ ├── smooth.m │ ├── spectral_radius.m │ ├── strong.m │ └── strongT.m ├── Physics ├── ManyWorlds │ ├── libtwigg │ │ ├── EulerAngles.c │ │ ├── LICENSE.txt │ │ ├── LICENSE.txt~ │ │ ├── Makefile │ │ ├── TRAFile.cpp │ │ ├── blockmat.cpp │ │ ├── boundingbox.cpp │ │ ├── camera.cpp │ │ ├── exception.cpp │ │ ├── fastTableLookup.cpp │ │ ├── gslWrappers.cpp │ │ ├── imagelib.cpp │ │ ├── interpolation.cpp │ │ ├── ioutil.cpp │ │ ├── keyable.cpp │ │ ├── libtwigg.sln │ │ ├── libtwigg.vcproj │ │ ├── linalg.cpp │ │ ├── nagWrappers.cpp │ │ ├── objfile.cpp │ │ ├── pathUtils.cpp │ │ ├── primitive.cpp │ │ ├── prt.cpp │ │ ├── random.cpp │ │ ├── renderUtils.cpp │ │ ├── stdafx.cpp │ │ ├── stdafx.h │ │ ├── testCoverTree.cpp │ │ ├── tr.c │ │ ├── twigg │ │ │ ├── EulerAngles.h │ │ │ ├── QuatTypes.h │ │ │ ├── TRAFile.h │ │ │ ├── aabbtree.h │ │ │ ├── blockmat.h │ │ │ ├── boundingbox.h │ │ │ ├── camera.h │ │ │ ├── cover_tree.h │ │ │ ├── exception.h │ │ │ ├── fastTableLookup.h │ │ │ ├── gslWrappers.h │ │ │ ├── imagelib.h │ │ │ ├── interpolation.h │ │ │ ├── ioutil.h │ │ │ ├── keyable.h │ │ │ ├── linalg.h │ │ │ ├── magicWrappers.h │ │ │ ├── nagWrappers.h │ │ │ ├── objfile.h │ │ │ ├── pathUtils.h │ │ │ ├── primitive.h │ │ │ ├── prt.h │ │ │ ├── random.h │ │ │ ├── renderutils.h │ │ │ ├── screenSpace.h │ │ │ ├── stlext.h │ │ │ ├── tr.h │ │ │ ├── util.h │ │ │ ├── vlutil.h │ │ │ └── volumeIntegrals.h │ │ ├── util.cpp │ │ └── volumeIntegrals.cpp │ └── mwb │ │ ├── GLView.cpp │ │ ├── GLView.h │ │ ├── LICENSE.txt │ │ ├── OBB.cpp │ │ ├── OBB.h │ │ ├── Resource.h │ │ ├── TimeView.cpp │ │ ├── TimeView.h │ │ ├── action.cpp │ │ ├── action.h │ │ ├── barbicUtils.cpp │ │ ├── barbicUtils.h │ │ ├── bestScoresView.cpp │ │ ├── bestScoresView.h │ │ ├── bulletWrappers.cpp │ │ ├── bulletWrappers.h │ │ ├── checkerboard.h │ │ ├── compress.h │ │ ├── compression.cpp │ │ ├── compression.h │ │ ├── constraints.cpp │ │ ├── constraints.h │ │ ├── distanceField.cpp │ │ ├── distanceField.h │ │ ├── hierarchyView.cpp │ │ ├── hierarchyView.h │ │ ├── mechModel.cpp │ │ ├── mechModel.h │ │ ├── meshes │ │ ├── ballJointLeft.mtl │ │ ├── ballJointLeft.obj │ │ ├── ballJointRight.mtl │ │ ├── ballJointRight.obj │ │ ├── gen.sh │ │ ├── hingeJointLeft.mtl │ │ ├── hingeJointLeft.obj │ │ ├── hingeJointRight.mtl │ │ ├── hingeJointRight.obj │ │ ├── meshes.h │ │ ├── planeConstraint.mb │ │ ├── planeJoint.mtl │ │ ├── planeJoint.obj │ │ ├── univJointLeft.mtl │ │ ├── univJointLeft.obj │ │ ├── univJointRight.mtl │ │ └── univJointRight.obj │ │ ├── mwSample.cpp │ │ ├── mwSample.h │ │ ├── newtonWrappers.cpp │ │ ├── novodexWrappers.cpp │ │ ├── novodexWrappers.h │ │ ├── odeWrappers.cpp │ │ ├── odeWrappers.h │ │ ├── parser.cpp │ │ ├── parser.h │ │ ├── pathTree.cpp │ │ ├── physicsFwd.h │ │ ├── physicsObject.cpp │ │ ├── physicsObject.h │ │ ├── planning.cpp │ │ ├── planning.h │ │ ├── planning.ico │ │ ├── planning.sln │ │ ├── planning.vcproj │ │ ├── planningUI.cpp │ │ ├── planningUI.h │ │ ├── quat.h │ │ ├── renderLines.cpp │ │ ├── renderLines.h │ │ ├── ribFile.cpp │ │ ├── ribFile.h │ │ ├── sampleServer.cpp │ │ ├── scene.cpp │ │ ├── scene.h │ │ ├── simulationTree.cpp │ │ ├── simulationTree.h │ │ ├── small.ico │ │ ├── sound.cpp │ │ ├── sound.h │ │ ├── spatial_tree.cpp │ │ ├── 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extprelimitDG.m │ │ ├── lagrangeweights.m │ │ ├── maxmod.m │ │ ├── minmod.m │ │ ├── minmodTVB.m │ │ └── wavetest.m └── PhysicsBasedAnimation │ ├── code │ ├── .DS_Store │ ├── array3D.h │ ├── explicitfem.cpp │ ├── explicitfem.h │ ├── fluid.cpp │ ├── fluid.h │ ├── implicitfem.cpp │ ├── implicitfem.h │ ├── inputs │ │ ├── cubeandspheres.mesh │ │ ├── explicitfem.json │ │ ├── fem.mesh │ │ ├── fluid.json │ │ ├── implicitfem.json │ │ ├── input.mesh │ │ ├── input.rb │ │ ├── input.sm │ │ ├── particles.in │ │ ├── rb.json │ │ └── springmass.json │ ├── json │ │ ├── json-forwards.h │ │ └── json.h │ ├── jsoncpp.cpp │ ├── makefile │ ├── partviewer.cpp │ ├── rigidbody.cpp │ ├── rigidbody.h │ ├── springmass.cpp │ └── springmass.h │ ├── explicitFem.py │ └── implicitFem.py ├── Plastic └── localRemeshing │ └── Stellar-1.1.tgz ├── README.md ├── Siggraph └── HighlyAdaptive │ └── code │ ├── .DS_Store │ ├── ReadMe.txt │ ├── femflip2 │ ├── .DS_Store │ ├── Makefile │ └── src │ │ ├── .DS_Store │ │ ├── adaptive2.cpp │ │ ├── adaptive2.h │ │ ├── ann │ │ ├── ANN.cpp │ │ ├── ANN.h │ │ ├── ANNperf.h │ │ ├── ANNx.h │ │ ├── bd_fix_rad_search.cpp │ │ ├── bd_pr_search.cpp │ │ ├── bd_search.cpp │ │ ├── bd_tree.cpp │ │ ├── bd_tree.h │ │ ├── brute.cpp │ │ ├── kd_dump.cpp │ │ ├── kd_fix_rad_search.cpp │ │ ├── kd_fix_rad_search.h │ │ ├── kd_pr_search.cpp │ │ ├── kd_pr_search.h │ │ ├── kd_search.cpp │ │ ├── kd_search.h │ │ ├── kd_split.cpp │ │ ├── kd_split.h │ │ ├── kd_tree.cpp │ │ ├── kd_tree.h │ │ ├── kd_util.cpp │ │ ├── kd_util.h │ │ ├── perf.cpp │ │ ├── pr_queue.h │ │ └── pr_queue_k.h │ │ ├── ann2.h │ │ ├── annsorter2.cpp │ │ ├── annsorter2.h │ │ ├── array2.h │ │ ├── bcc2.cpp │ │ ├── bcc2.h │ │ ├── bccmesher2.cpp │ │ ├── bccmesher2.h │ │ ├── bccsurf2.cpp │ │ ├── bccsurf2.h │ │ ├── camera2.cpp │ │ ├── camera2.h │ │ ├── cellsurf2.cpp │ │ ├── cellsurf2.h │ │ ├── corrector2.cpp │ │ ├── corrector2.h │ │ ├── email.cpp │ │ ├── email.h │ │ ├── extsurf2.cpp │ │ ├── extsurf2.h │ │ ├── fastmarch2.cpp │ │ ├── fastmarch2.h │ │ ├── femfluid2.cpp │ │ ├── femfluid2.h │ │ ├── flip2.cpp │ │ ├── flip2.h │ │ ├── fluid2.h │ │ ├── fvmfluid2.cpp │ │ ├── fvmfluid2.h │ │ ├── glhelpviewer.cpp │ │ ├── glhelpviewer.h │ │ ├── glut.h │ │ ├── glviewer.cpp │ │ ├── glviewer.h │ │ ├── kernel.h │ │ ├── levelset2.cpp │ │ ├── levelset2.h │ │ ├── macfluid2.cpp │ │ ├── macfluid2.h │ │ ├── macros.h │ │ ├── main.cpp │ │ ├── mesher2.cpp │ │ ├── mesher2.h │ │ ├── meshsurf2.cpp │ │ ├── meshsurf2.h │ │ ├── octfluid2.cpp │ │ ├── octfluid2.h │ │ ├── octgrid2.h │ │ ├── octhash2.h │ │ ├── octlevelset2.h │ │ ├── octree2.cpp │ │ ├── octree2.h │ │ ├── opengl.h │ │ ├── pann2.h │ │ ├── particle2.cpp │ │ ├── particle2.h │ │ ├── pcgsolver │ │ ├── blas_wrapper.h │ │ ├── matutil.h │ │ ├── pcg_solver.h │ │ ├── sparse_matrix.h │ │ └── util.h │ │ ├── sizefunc2.h │ │ ├── sorter2.h │ │ ├── surf2.cpp │ │ ├── surf2.h │ │ ├── svd2.h │ │ ├── testcase.h │ │ ├── umesher2.cpp │ │ ├── umesher2.h │ │ ├── util2.h │ │ ├── vec2.h │ │ ├── write_bmp.cpp │ │ └── write_bmp.h │ └── femflip3 │ ├── .DS_Store │ ├── Makefile │ └── src │ ├── .DS_Store │ ├── adaptive3.cpp │ ├── adaptive3.h │ ├── ann │ ├── ANN.cpp │ ├── ANN.h │ ├── ANNperf.h │ ├── ANNx.h │ ├── bd_fix_rad_search.cpp │ ├── bd_pr_search.cpp │ ├── bd_search.cpp │ ├── bd_tree.cpp │ ├── bd_tree.h │ ├── brute.cpp │ ├── kd_dump.cpp │ ├── kd_fix_rad_search.cpp │ ├── kd_fix_rad_search.h │ ├── kd_pr_search.cpp │ ├── kd_pr_search.h │ ├── kd_search.cpp │ ├── kd_search.h │ ├── kd_split.cpp │ ├── kd_split.h │ ├── kd_tree.cpp │ ├── kd_tree.h │ ├── kd_util.cpp │ ├── kd_util.h │ ├── perf.cpp │ ├── pr_queue.h │ └── pr_queue_k.h │ ├── ann3.h │ ├── annsorter3.cpp │ ├── annsorter3.h │ ├── array3.h │ ├── bcc3.cpp │ ├── bcc3.h │ ├── bccmesher3.cpp │ ├── bccmesher3.h │ ├── bccsurf3.cpp │ ├── bccsurf3.h │ ├── camera3.cpp │ ├── camera3.h │ ├── cellsurf3.cpp │ ├── cellsurf3.h │ ├── corrector3.cpp │ ├── corrector3.h │ ├── email.cpp │ ├── email.h │ ├── exporter3.cpp │ ├── exporter3.h │ ├── 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opengl.h │ ├── pann3.h │ ├── particle3.cpp │ ├── particle3.h │ ├── pbrt │ ├── attributes.pbrt │ ├── env.pbrt │ ├── fix.sh │ ├── material.pbrt │ ├── render.sh │ └── template.pbrt │ ├── pcgsolver │ ├── blas_wrapper.h │ ├── matutil.h │ ├── pcg_solver.h │ ├── sparse_matrix.h │ └── util.h │ ├── rchandra │ ├── BinVoxReader.cpp │ ├── BinVoxReader.h │ ├── CIsoSurface.cpp │ ├── CIsoSurface.h │ ├── Vectors.cpp │ ├── Vectors.h │ ├── glm.cpp │ └── glm.h │ ├── rply │ ├── rply.c │ └── rply.h │ ├── sizefunc3.h │ ├── sorter3.h │ ├── surf3.cpp │ ├── surf3.h │ ├── svd3.cpp │ ├── svd3.h │ ├── testcase.h │ ├── tetgen │ ├── LICENSE │ ├── README │ ├── example.poly │ ├── makefile │ ├── predicates.cxx │ ├── tetgen.cxx │ └── tetgen.h │ ├── util3.cpp │ ├── util3.h │ ├── vec3.h │ ├── write_bmp.cpp │ └── write_bmp.h ├── SkinSkeletonBone └── NeoHookeanFlesh │ ├── Cube.py │ ├── CubeSolver.py │ ├── __pycache__ │ ├── Cube.cpython-37.pyc │ └── CubeSolver.cpython-37.pyc │ ├── neo.py │ ├── snh_code │ ├── CMakeLists.txt │ ├── LICENSE.txt │ ├── README.md │ ├── cmake │ │ └── FindEigen3.cmake │ ├── cubesim │ │ ├── CGInterface.cpp │ │ ├── CGInterface.h │ │ ├── CGSolverType.h │ │ ├── CMakeLists.txt │ │ ├── Cube.cpp │ │ ├── Cube.h │ │ ├── CubeMesh.cpp │ │ ├── CubeMesh.h │ │ ├── CubeNewtonSolver.cpp │ │ ├── CubeNewtonSolver.h │ │ ├── EigenCG.cpp │ │ ├── EigenCG.h │ │ ├── InitialMesh.h │ │ ├── LineSearches.h │ │ ├── LocalHessianLocation.h │ │ ├── Material.cpp │ │ ├── Material.h │ │ ├── QuasistaticSolveResult.cpp │ │ ├── QuasistaticSolveResult.h │ │ ├── Settings.h │ │ ├── StableNeoHookean.cpp │ │ ├── StableNeoHookean.h │ │ ├── TetMesh.cpp │ │ ├── TetMesh.h │ │ └── TetNewtonSolver.h │ ├── download_eigen.sh │ ├── eigen_found.sh │ ├── hexcli │ │ ├── CMakeLists.txt │ │ └── hexcli.cpp │ └── tetcli │ │ ├── CMakeLists.txt │ │ └── tetcli.cpp │ └── sur.py ├── Sound └── PrecomputedTransfer │ ├── fastPAT.cpp │ ├── matrixIO.cpp │ ├── matrixIO.h │ ├── performanceCounter.cpp │ └── performanceCounter.h ├── Volumetric ├── DiffusionSurfaces_src.zip └── volfill │ └── volfill │ ├── ActiveGrid.cc │ ├── ActiveGrid.h │ ├── ChunkAllocator.cc │ ├── ChunkAllocator.h │ ├── ChunkLink.cc │ ├── ChunkLink.h │ ├── Linear.h │ ├── Makefile │ ├── Matrix2f.cc │ ├── Matrix2f.h │ ├── Matrix3f.cc │ ├── Matrix3f.h │ ├── Matrix4f.cc │ ├── Matrix4f.h │ ├── OccGrid.cc │ ├── OccGrid.h │ ├── OccGridRLE.cc │ ├── OccGridRLE.h │ ├── Quaternion.cc │ ├── Quaternion.h │ ├── README │ ├── Vec3f.cc │ ├── Vec3f.h │ ├── defines.h │ ├── fb.cc │ ├── fb.h │ ├── main.cc │ ├── util.cc │ ├── util.h │ ├── volfill │ └── vrip.h ├── WaterFlowFluid ├── FEMFluid │ ├── FemFluid.pdf │ ├── advectMacCormack.m │ ├── advectSemiLagrange.m │ ├── advectionCore.m │ ├── applyForces.m │ ├── calcDivergence.m │ ├── calcFrame.m │ ├── calcGradient.m │ ├── cellsToNodes.m │ ├── distanceFieldToFluidNodes.m │ ├── enforceBoundaryCondition.m │ ├── fluidNodesToDistanceField.m │ ├── getFluidCells.m │ ├── getInterfaceNodes.m │ ├── jacobi.m │ ├── loadScenario.m │ ├── main.m │ ├── mainUnitTest.m │ ├── reinitDistances.m │ ├── runSimulation.m │ ├── saveImage.m │ ├── saveVideo.m │ ├── setAirVelocity.m │ ├── solvePressure.m │ └── subtractPressureGradient.m ├── FSWW-master │ ├── CMakeLists.txt │ ├── LICENSE │ ├── README │ ├── Textures │ │ ├── harbour.png │ │ ├── island.png │ │ ├── line_hd.png │ │ └── test.png │ ├── build │ │ ├── configure-builds │ │ ├── external │ │ │ ├── .gitignore │ │ │ ├── README.org │ │ │ ├── bin │ │ │ │ └── configure-build │ │ │ └── etc │ │ │ │ ├── cget │ │ │ │ └── recipes │ │ │ │ │ ├── corrade.v2018.02 │ │ │ │ │ └── package.txt │ │ │ │ │ ├── corrade │ │ │ │ │ └── package.txt │ │ │ │ │ ├── hana.v1.4.0 │ │ │ │ │ └── package.txt │ │ │ │ │ ├── imgui.v1.53 │ │ │ │ │ ├── build.cmake │ │ │ │ │ └── package.txt │ │ │ │ │ ├── imgui.v1.60 │ │ │ │ │ ├── build.cmake │ │ │ │ │ └── package.txt │ │ │ │ │ ├── magnum-imgui.v0.1 │ │ │ │ │ ├── package.txt │ │ │ │ │ └── requirements.txt │ │ │ │ │ ├── magnum-imgui.v0.3 │ │ │ │ │ ├── package.txt │ │ │ │ │ └── requirements.txt │ │ │ │ │ ├── magnum-imgui │ │ │ │ │ ├── package.txt │ │ │ │ │ └── requirements.txt │ │ │ │ │ ├── magnum.v2018.02 │ │ │ │ │ ├── package.txt │ │ │ │ │ └── requirements.txt │ │ │ │ │ ├── magnum │ │ │ │ │ ├── package.txt │ │ │ │ │ └── requirements.txt │ │ │ │ │ └── rtags.v2.18 │ │ │ │ │ └── package.txt │ │ │ │ └── toolchains │ │ │ │ ├── generic │ │ │ │ ├── Emscripten-wasm.cmake │ │ │ │ └── Emscripten.cmake │ │ │ │ └── modules │ │ │ │ ├── Platform │ │ │ │ └── Emscripten.cmake │ │ │ │ └── UseEmscripten.cmake │ │ └── install-dependencies │ ├── conf │ │ ├── circle_interactive.conf │ │ ├── circle_static.conf │ │ ├── test_interactive.conf │ │ ├── test_interactive_neumann.conf │ │ ├── test_static.conf │ │ └── texture_static.conf │ ├── imgui.ini │ ├── modules │ │ ├── FindCorrade.cmake │ │ ├── FindEGL.cmake │ │ ├── FindEigen.cmake │ │ ├── FindMagnum.cmake │ │ ├── FindOpenGLES2.cmake │ │ ├── FindOpenGLES3.cmake │ │ └── FindSDL2.cmake │ ├── read.txt │ └── src │ │ ├── CMakeLists.txt │ │ ├── CircularObstacle.cpp │ │ ├── CircularObstacle.hpp │ │ ├── CudaWaterSurface.cu │ │ ├── CudaWaterSurface.hpp │ │ ├── DataFile.cpp │ │ ├── DataFile.hpp │ │ ├── DrawingPrimitives.cpp │ │ ├── DrawingPrimitives.hpp │ │ ├── EquivalentSource.cpp │ │ ├── EquivalentSource.hpp │ │ ├── ExceptionSimu.hpp │ │ ├── Grid.cpp │ │ ├── Grid.hpp │ │ ├── InputPoint.cpp │ │ ├── InputPoint.hpp │ │ ├── LinearWave.cpp │ │ ├── LinearWave.hpp │ │ ├── MovingEquivalentSource.cpp │ │ ├── MovingEquivalentSource.hpp │ │ ├── Obstacle.cpp │ │ ├── Obstacle.hpp │ │ ├── ProjectedGrid.cpp │ │ ├── ProjectedGrid.hpp │ │ ├── SquareObstacle.cpp │ │ ├── SquareObstacle.hpp │ │ ├── TextureObstacle.cpp │ │ ├── TextureObstacle.hpp │ │ ├── Times.cpp │ │ ├── Times.hpp │ │ ├── Viewer.cpp │ │ ├── Viewer.hpp │ │ ├── WaterSurface.cpp │ │ ├── WaterSurface.hpp │ │ ├── Wave.cpp │ │ ├── Wave.hpp │ │ ├── WavyObstacle.cpp │ │ ├── WavyObstacle.hpp │ │ ├── definitions.cpp │ │ ├── definitions.hpp │ │ ├── error.cpp │ │ ├── error.hpp │ │ ├── main.cpp │ │ ├── settings.cpp │ │ ├── settings.hpp │ │ ├── ui_parameters.cpp │ │ └── ui_parameters.hpp ├── LaplacianEigen │ ├── SourceCodes │ │ ├── LE.class │ │ ├── LE.java │ │ ├── SparseMatrix.class │ │ ├── SparseMatrix.java │ │ ├── WebContainer.class │ │ ├── WebContainer.java │ │ ├── index.htm │ │ └── index.htm~ │ └── java.py ├── Synthetic │ └── turb │ │ ├── .svn │ │ ├── all-wcprops │ │ ├── entries │ │ ├── prop-base │ │ │ ├── compile_check.sh.svn-base │ │ │ ├── makebu.sh.svn-base │ │ │ └── update_lastgood_parser.sh.svn-base │ │ └── text-base │ │ │ ├── CMakeLists.txt.svn-base │ │ │ ├── ChangeLog.svn-base │ │ │ ├── compile_check.sh.svn-base │ │ │ ├── config.h.cmake.svn-base │ │ │ ├── makebu.sh.svn-base │ │ │ ├── testCmakeCalls.txt.svn-base │ │ │ └── update_lastgood_parser.sh.svn-base │ │ ├── COPYING │ │ ├── Makefile │ │ ├── README.txt │ │ ├── render.sh │ │ ├── render │ │ ├── dyn_scene.pbrt │ │ └── sta_scene.pbrt │ │ ├── scene │ │ └── anim.txt │ │ ├── source │ │ ├── .svn │ │ │ ├── all-wcprops │ │ │ ├── entries │ │ │ ├── prop-base │ │ │ │ └── vortexplugins.cpp.svn-base │ │ │ └── text-base │ │ │ │ ├── advectionplugins.cpp.svn-base │ │ │ │ ├── animplugins.cpp.svn-base │ │ │ │ ├── asciiFileReader.cpp.svn-base │ │ │ │ ├── asciiFileReader.h.svn-base │ │ │ │ ├── clusterTracking.cpp.svn-base │ │ │ │ ├── clusterTracking.h.svn-base │ │ │ │ ├── conjugategrad.cpp.svn-base │ │ │ │ ├── conjugategrad.h.svn-base │ │ │ │ ├── convert.cpp.svn-base │ │ │ │ ├── convert.h.svn-base │ │ │ │ ├── fastiterativeeikonal.cpp.svn-base │ │ │ │ ├── fastiterativeeikonal.h.svn-base │ │ │ │ ├── fastmarch.h.svn-base │ │ │ │ ├── fastsweepingeikonal.cpp.svn-base │ │ │ │ ├── fastsweepingeikonal.h.svn-base │ │ │ │ ├── fileio.cpp.svn-base │ │ │ │ ├── fluidMatchingPlugins.cpp.svn-base │ │ │ │ ├── fluidsolver.cpp.svn-base │ │ │ │ ├── fluidsolver.h.svn-base │ │ │ │ ├── freesurfaceplugins.cpp.svn-base │ │ │ │ ├── glutgui.cpp.svn-base │ │ │ │ ├── grid.h.svn-base │ │ │ │ ├── gridOpPlugins.cpp.svn-base │ │ │ │ ├── guihelpers.cpp.svn-base │ │ │ │ ├── initplugins.cpp.svn-base │ │ │ │ ├── levelset.cpp.svn-base │ │ │ │ ├── levelset.h.svn-base │ │ │ │ ├── main.cpp.svn-base │ │ │ │ ├── main_noparser.cpp.svn-base │ │ │ │ ├── obstacle2Dplugins.cpp.svn-base │ │ │ │ ├── operators.h.svn-base │ │ │ │ ├── particles.h.svn-base │ │ │ │ ├── patches.cpp.svn-base │ │ │ │ ├── patches.h.svn-base │ │ │ │ ├── pointsurface.cpp.svn-base │ │ │ │ ├── pointsurface.h.svn-base │ │ │ │ ├── poissonsolvers.cpp.svn-base │ │ │ │ ├── reynoldsplugins.cpp.svn-base │ │ │ │ ├── smokeplugins.cpp.svn-base │ │ │ │ ├── solverinit.cpp.svn-base │ │ │ │ ├── solverinit.h.svn-base │ │ │ │ ├── solverparams.cpp.svn-base │ │ │ │ ├── solverparams.h.svn-base │ │ │ │ ├── solverplugin.h.svn-base │ │ │ │ ├── stdplugins.cpp.svn-base │ │ │ │ ├── testplugins.cpp.svn-base │ │ │ │ ├── viscoelasplugins.cpp.svn-base │ │ │ │ ├── volumetricFluidMipMap.cpp.svn-base │ │ │ │ ├── volumetricFluidMipMap.h.svn-base │ │ │ │ ├── vortexpart.cpp.svn-base │ │ │ │ ├── vortexpart.h.svn-base │ │ │ │ ├── vortexplugins.cpp.svn-base │ │ │ │ └── wlturbplugins.cpp.svn-base │ │ ├── advectionplugins.cpp │ │ ├── animplugins.cpp │ │ ├── conjugategrad.cpp │ │ ├── conjugategrad.h │ │ ├── fileio.cpp │ │ ├── fluidsolver.cpp │ │ ├── fluidsolver.h │ │ ├── glutgui.cpp │ │ ├── grid.h │ │ ├── guihelpers.cpp │ │ ├── initplugins.cpp │ │ ├── main.cpp │ │ ├── operators.h │ │ ├── poissonsolvers.cpp │ │ ├── smokeplugins.cpp │ │ ├── solverinit.cpp │ │ ├── solverinit.h │ │ ├── solverparams.cpp │ │ ├── solverparams.h │ │ ├── solverplugin.h │ │ ├── stdplugins.cpp │ │ ├── vortexpart.cpp │ │ ├── vortexpart.h │ │ └── vortexplugins.cpp │ │ └── util │ │ ├── .svn │ │ ├── all-wcprops │ │ ├── entries │ │ ├── prop-base │ │ │ ├── GLFontData.h.svn-base │ │ │ ├── GLFontRenderer.cpp.svn-base │ │ │ └── GLFontRenderer.h.svn-base │ │ └── text-base │ │ │ ├── GLFontData.h.svn-base │ │ │ ├── GLFontRenderer.cpp.svn-base │ │ │ ├── GLFontRenderer.h.svn-base │ │ │ ├── arrays.h.svn-base │ │ │ ├── boundbox.h.svn-base │ │ │ ├── geomfile.cpp.svn-base │ │ │ ├── geomfile.h.svn-base │ │ │ ├── globals.cpp.svn-base │ │ │ ├── globals.h.svn-base │ │ │ ├── imageio.cpp.svn-base │ │ │ ├── imageio.h.svn-base │ │ │ ├── isosurface.cpp.svn-base │ │ │ ├── isosurface.h.svn-base │ │ │ ├── lic.cpp.svn-base │ │ │ ├── lic.h.svn-base │ │ │ ├── matrixbase.h.svn-base │ │ │ ├── mcubes_tables.h.svn-base │ │ │ ├── md5.cc.svn-base │ │ │ ├── md5.hh.svn-base │ │ │ ├── opengl_includes.h.svn-base │ │ │ ├── paramset.cpp.svn-base │ │ │ ├── paramset.h.svn-base │ │ │ ├── parser.cpp.svn-base │ │ │ ├── parser.h.svn-base │ │ │ ├── pbrtlex.l.svn-base │ │ │ ├── pbrtparse.y.svn-base │ │ │ ├── quaternion.h.svn-base │ │ │ ├── quicklist.h.svn-base │ │ │ ├── randomlib.cpp.svn-base │ │ │ ├── randomlib.h.svn-base │ │ │ ├── randomstream.h.svn-base │ │ │ ├── vectorbase.h.svn-base │ │ │ └── waveletnoise.h.svn-base │ │ ├── boundbox.h │ │ ├── globals.cpp │ │ ├── globals.h │ │ ├── matrixbase.h │ │ ├── paramset.cpp │ │ ├── paramset.h │ │ ├── quaternion.h │ │ ├── randomstream.h │ │ ├── vectorbase.h │ │ └── waveletnoise.h ├── UnInclude │ └── tbb │ │ ├── fun.py │ │ └── note.md ├── clebsch │ └── code (7).zip ├── close │ ├── .vs │ │ ├── VSWorkspaceState.json │ │ ├── close │ │ │ └── v16 │ │ │ │ ├── .suo │ │ │ │ └── Browse.VC.db │ │ └── slnx.sqlite │ ├── CPT │ │ ├── .DS_Store │ │ ├── Makefile │ │ ├── Makefile.ubuntu │ │ ├── SETTINGS.h │ │ ├── data │ │ │ ├── .DS_Store │ │ │ └── houdini_input │ │ │ │ └── paddle_example.hipnc │ │ ├── iWaveHoudini.cpp │ │ ├── iWavePhysBAM.cpp │ │ ├── render │ │ │ ├── .DS_Store │ │ │ ├── pbrt_modifications │ │ │ │ ├── FIELD_3D.cpp │ │ │ │ ├── FIELD_3D.h │ │ │ │ ├── README.txt │ │ │ │ ├── VEC3.h │ │ │ │ ├── api.cpp │ │ │ │ ├── api.h │ │ │ │ ├── field.cpp │ │ │ │ └── field.h │ │ │ ├── pbrt_scenes │ │ │ │ ├── PhysBAM.pbrt │ │ │ │ ├── PhysBAM_scene_geometry.pbrt │ │ │ │ ├── env.exr │ │ │ │ ├── houdini.pbrt │ │ │ │ ├── houdini_scene_geometry.pbrt │ │ │ │ └── skylight-sunset.exr │ │ │ ├── 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SparseVector.h │ │ │ │ │ ├── SparseView.h │ │ │ │ │ └── TriangularSolver.h │ │ │ │ │ ├── SparseLU │ │ │ │ │ ├── SparseLU.h │ │ │ │ │ ├── SparseLUImpl.h │ │ │ │ │ ├── SparseLU_Memory.h │ │ │ │ │ ├── SparseLU_Structs.h │ │ │ │ │ ├── SparseLU_SupernodalMatrix.h │ │ │ │ │ ├── SparseLU_Utils.h │ │ │ │ │ ├── SparseLU_column_bmod.h │ │ │ │ │ ├── SparseLU_column_dfs.h │ │ │ │ │ ├── SparseLU_copy_to_ucol.h │ │ │ │ │ ├── SparseLU_gemm_kernel.h │ │ │ │ │ ├── SparseLU_heap_relax_snode.h │ │ │ │ │ ├── SparseLU_kernel_bmod.h │ │ │ │ │ ├── SparseLU_panel_bmod.h │ │ │ │ │ ├── SparseLU_panel_dfs.h │ │ │ │ │ ├── SparseLU_pivotL.h │ │ │ │ │ ├── SparseLU_pruneL.h │ │ │ │ │ └── SparseLU_relax_snode.h │ │ │ │ │ ├── SparseQR │ │ │ │ │ └── SparseQR.h │ │ │ │ │ ├── StlSupport │ │ │ │ │ ├── StdDeque.h │ │ │ │ │ ├── StdList.h │ │ │ │ │ ├── StdVector.h │ │ │ │ │ └── details.h │ │ │ │ │ ├── SuperLUSupport │ │ │ │ │ └── SuperLUSupport.h │ │ │ │ │ ├── UmfPackSupport │ │ │ │ │ └── UmfPackSupport.h │ │ │ │ │ ├── misc 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PhysicsOfOscillationsAndWaves ├── ch13Diffraction ├── allocateArrays.m ├── diffraction.m ├── generateExcitation.m ├── generateRelPositionData.m ├── linewidth.m ├── parameters.m ├── plotDiffraction.m ├── plotTheoreticalSingleSlit.m ├── summation.m └── writeToFile.m ├── ch15Coherence ├── antennaDiagram3.m └── crossCorrAbs.m ├── ch8Dispersion ├── pg_animer.m ├── pg_fft.m ├── pg_omega.m ├── pg_wave.m └── pg_wpack.m ├── diffraction.py ├── phase_and_group.py ├── trost_wavelet.py ├── wave_time_propagation.py └── wavelet_example.py /Bubble/AcousticBubbles/bubble.py: -------------------------------------------------------------------------------- https://raw.githubusercontent.com/Leon-Zhaohw/NumericalProjectsCollections/HEAD/Bubble/AcousticBubbles/bubble.py -------------------------------------------------------------------------------- /Bubble/boiling/Boiling.sln: -------------------------------------------------------------------------------- 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-------------------------------------------------------------------------------- /FluidSolidInteraction/resim/ZEPHYR/src/Eigen/scripts/release.in: -------------------------------------------------------------------------------- 1 | #!/bin/sh 2 | 3 | cmake -DCMAKE_BUILD_TYPE=Release . 4 | -------------------------------------------------------------------------------- /FrontTracking/DNS-Solver.pdf: -------------------------------------------------------------------------------- https://raw.githubusercontent.com/Leon-Zhaohw/NumericalProjectsCollections/HEAD/FrontTracking/DNS-Solver.pdf -------------------------------------------------------------------------------- /FrontTracking/LevelSetSculpt/main.cpp: -------------------------------------------------------------------------------- https://raw.githubusercontent.com/Leon-Zhaohw/NumericalProjectsCollections/HEAD/FrontTracking/LevelSetSculpt/main.cpp -------------------------------------------------------------------------------- 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https://raw.githubusercontent.com/Leon-Zhaohw/NumericalProjectsCollections/HEAD/Gemotry/InterferenceAware/iagm/README -------------------------------------------------------------------------------- /Gemotry/InterferenceAware/iagm/iagm/make.inc: -------------------------------------------------------------------------------- 1 | 2 | EIGEN_INC := /opt/local/include/eigen3 3 | 4 | # Switch to so for Linux 5 | # 6 | LIB_EXT := dylib 7 | 8 | -------------------------------------------------------------------------------- /Gemotry/InterferenceAware/iagm/make.inc: -------------------------------------------------------------------------------- https://raw.githubusercontent.com/Leon-Zhaohw/NumericalProjectsCollections/HEAD/Gemotry/InterferenceAware/iagm/make.inc -------------------------------------------------------------------------------- /Gemotry/artcode/Readme: -------------------------------------------------------------------------------- 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