├── .gitattributes ├── .github └── workflows │ ├── Build_and_deploy_website.yml │ ├── Create_release_with_latest_tag.yml │ ├── OpenData_Workfow.yml │ ├── Send_metadata_to_Govdata.yml │ ├── Send_metadata_to_nfdi4health.yml │ ├── Sync_OpenData_repo_to_OpenCoDE.yml │ └── Update_github_details.yml ├── LICENSE ├── LIZENZ ├── Metadaten ├── govdata.ttl ├── nfdi4health.json ├── schemas │ ├── tableschema_SARS-CoV-2-Entwicklungslinien_berichtet.json │ ├── tableschema_SARS-CoV-2-Entwicklungslinien_zu_Varianten.json │ └── tableschema_SARS-CoV-2-Sequenzdaten_Deutschland.json ├── zenodo-invenio.json └── zenodo.json ├── Readme.md ├── SARS-CoV-2-Entwicklungslinien_berichtet.tsv ├── SARS-CoV-2-Entwicklungslinien_zu_Varianten.tsv ├── SARS-CoV-2-Sequenzdaten_Deutschland.fasta.xz ├── SARS-CoV-2-Sequenzdaten_Deutschland.tsv.xz ├── [Dokumentation]_SARS-CoV-2-Sequenzdaten_aus_Deutschland.pdf ├── citation.cff └── datapackage.json /.gitattributes: -------------------------------------------------------------------------------- 1 | SARS-CoV-2-Sequenzdaten_Deutschland.fasta.xz filter=lfs diff=lfs merge=lfs -text 2 | SARS-CoV-2-Sequenzdaten_Deutschland.tsv.xz filter=lfs diff=lfs merge=lfs -text 3 | -------------------------------------------------------------------------------- /.github/workflows/Build_and_deploy_website.yml: -------------------------------------------------------------------------------- 1 | name: Manually build and deploy OpenData-Website 2 | on: 3 | workflow_dispatch: 4 | 5 | # A workflow run is made up of one or more jobs that can run sequentially or in parallel 6 | jobs: 7 | # This workflow contains a single job called "build" 8 | build: 9 | # Steps represent a sequence of tasks that will be executed as part of the job 10 | runs-on: ubuntu-latest 11 | steps: 12 | - name: Bulid and deploy OpenData Website 13 | uses: robert-koch-institut/OpenData-Website@main 14 | with: 15 | GH_TOKEN: ${{ secrets.GITHUB_TOKEN }} 16 | -------------------------------------------------------------------------------- /.github/workflows/Create_release_with_latest_tag.yml: -------------------------------------------------------------------------------- 1 | name: Manually create relese with latest tag 2 | on: 3 | workflow_dispatch: 4 | 5 | permissions: 6 | contents: write 7 | 8 | jobs: 9 | create_release: 10 | name: Create reslese 11 | runs-on: ubuntu-latest 12 | steps: 13 | - name: Checkout Repository 14 | uses: actions/checkout@v4 15 | with: 16 | fetch-depth: 0 17 | 18 | - name: Get latest tag and set env 19 | run: | 20 | echo "LATEST_TAG=$(git describe --tags `git rev-list --tags --max-count=1`)" >> $GITHUB_ENV 21 | 22 | - name: Create Release 23 | env: 24 | GITHUB_TOKEN: ${{ secrets.GITHUB_TOKEN }} 25 | uses: robert-koch-institut/OpenData-Workflows/Create_release_on_tag_push@main 26 | with: 27 | REF_NAME: ${{ env.LATEST_TAG }} 28 | -------------------------------------------------------------------------------- /.github/workflows/OpenData_Workfow.yml: -------------------------------------------------------------------------------- 1 | name: OpenData Workfow for FAIR Data 2 | on: 3 | push: 4 | tags: 5 | - '[0-9][0-9][0-9][0-9]-[0-1][0-9]-[0-3][0-9]' 6 | #workflow_dispatch: 7 | 8 | jobs: 9 | build: 10 | uses: robert-koch-institut/OpenData-Workflows/.github/workflows/OpenData_Workflows.yml@main 11 | with: 12 | # General Variables 13 | ZENODOJSON_PATH: Metadaten/zenodo.json 14 | 15 | # Push to OpenCoDE 16 | OPENCODE_ACTIVE: true 17 | OPENCODE_GROUPID: 2781 18 | OPENCODE_ACCESS_USER: RKIOpenData 19 | 20 | # Push to GovData Repositoy 21 | GOVDATA_ACTIVE: true 22 | GOVDATA_DESTINATION_REPO: robert-koch-institut/Metadaten_fuer_GovData 23 | 24 | # Push to NFDI4Health 25 | NFDI4HEALTH_ACTIVE: true 26 | 27 | #Build Open Data Website 28 | WEBSITE_ACTIVE: true 29 | 30 | #Update Github Details 31 | GITHUB_DETAILS_ACTIVE: true 32 | 33 | 34 | secrets: 35 | # Token from GovData Repository 36 | GOVDATA_GITHUB_TOKEN: ${{secrets.GOVDATA_TOKEN}} 37 | 38 | # Token from OpenCoDE Account 39 | OPENCODE_TOKEN: ${{secrets.OPENCODE_TOKEN}} 40 | 41 | # NFDI4Health Credentials 42 | NFDI4HEALTH_CLIENT_ID: CSH_RKI_CLIENT 43 | NFDI4HEALTH_CLIENT_SECRET: ${{secrets.NFDI4HEALTH_SECRET}} 44 | 45 | # Github Token 46 | GH_TOKEN: ${{secrets.GITHUB_TOKEN}} 47 | GITHUB_METADATA_TOKEN: ${{secrets.ADMINISTRATION_TOKEN}} 48 | -------------------------------------------------------------------------------- /.github/workflows/Send_metadata_to_Govdata.yml: -------------------------------------------------------------------------------- 1 | name: Manually send metadata to GovData 2 | on: 3 | workflow_dispatch: 4 | 5 | permissions: 6 | contents: write 7 | 8 | jobs: 9 | push_govdata: 10 | name: Push ttl to GovData repository 11 | runs-on: ubuntu-latest 12 | steps: 13 | - name: run GovData Action 14 | uses: robert-koch-institut/OpenData-Workflows/Send_metadata_to_Govdata@main 15 | with: 16 | govdata_github_token: ${{secrets.GOVDATA_TOKEN}} 17 | destination_repo: robert-koch-institut/Metadaten_fuer_GovData -------------------------------------------------------------------------------- /.github/workflows/Send_metadata_to_nfdi4health.yml: -------------------------------------------------------------------------------- 1 | name: Manually send metadata to NFDI4Health 2 | on: 3 | workflow_dispatch: 4 | 5 | jobs: 6 | sync_opencode: 7 | name: Send metadata to NFDI4Health 8 | runs-on: ubuntu-latest 9 | steps: 10 | - name: Sync Github Open Data repository 11 | uses: robert-koch-institut/OpenData-Workflows/Send_metadata_to_NFDI4Health@main 12 | with: 13 | nfdi4health_client_id: CSH_RKI_CLIENT 14 | nfdi4health_client_secret: ${{secrets.NFDI4HEALTH_SECRET}} 15 | nfdi4health_metadata_path: Metadaten/nfdi4health.json 16 | nfdi4health_authorization_endpoint: "https://sso.studyhub.nfdi4health.de/realms/nfdi4health/protocol/openid-connect/token" 17 | github_token: ${{secrets.GITHUB_TOKEN}} -------------------------------------------------------------------------------- /.github/workflows/Sync_OpenData_repo_to_OpenCoDE.yml: -------------------------------------------------------------------------------- 1 | name: Manually sync Github Open Data repository and its metadata to OpenCoDE.de 2 | 3 | on: 4 | workflow_dispatch: 5 | 6 | jobs: 7 | sync_opencode: 8 | name: Sync Github Open Data repository and its metadata to OpenCoDE.de 9 | runs-on: ubuntu-latest 10 | steps: 11 | - name: Sync Github Open Data repository 12 | uses: robert-koch-institut/OpenData-Workflows/Sync_OpenData_repo_to_OpenCoDE@main 13 | with: 14 | GITHUB_TOKEN: ${{ secrets.GITHUB_TOKEN }} 15 | OPENCODE_TOKEN: ${{ secrets.OPENCODE_TOKEN }} 16 | GROUP_ID: 2781 17 | ACCESS_USER: RKIOpenData 18 | ZENODOJSON_PATH: Metadaten/zenodo.json -------------------------------------------------------------------------------- /.github/workflows/Update_github_details.yml: -------------------------------------------------------------------------------- 1 | name: Manually update Github repository details 2 | on: 3 | workflow_dispatch: 4 | 5 | jobs: 6 | update-github-repository-details : 7 | runs-on: ubuntu-latest 8 | steps: 9 | - name: Update Github repository details weith zenodo.json metadata 10 | uses: robert-koch-institut/OpenData-Workflows/Update_details_on_Github@main 11 | with: 12 | GITHUB_TOKEN: ${{ secrets.GITHUB_TOKEN }} 13 | GITHUB_METADATA_TOKEN: ${{ secrets.ADMINISTRATION_TOKEN }} 14 | -------------------------------------------------------------------------------- /LICENSE: -------------------------------------------------------------------------------- 1 | Attribution 4.0 International 2 | 3 | ======================================================================= 4 | 5 | Creative Commons Corporation ("Creative Commons") is not a law firm and 6 | does not provide legal services or legal advice. Distribution of 7 | Creative Commons public licenses does not create a lawyer-client or 8 | other relationship. Creative Commons makes its licenses and related 9 | information available on an "as-is" basis. Creative Commons gives no 10 | warranties regarding its licenses, any material licensed under their 11 | terms and conditions, or any related information. Creative Commons 12 | disclaims all liability for damages resulting from their use to the 13 | fullest extent possible. 14 | 15 | Using Creative Commons Public Licenses 16 | 17 | Creative Commons public licenses provide a standard set of terms and 18 | conditions that creators and other rights holders may use to share 19 | original works of authorship and other material subject to copyright 20 | and certain other rights specified in the public license below. The 21 | following considerations are for informational purposes only, are not 22 | exhaustive, and do not form part of our licenses. 23 | 24 | Considerations for licensors: Our public licenses are 25 | intended for use by those authorized to give the public 26 | permission to use material in ways otherwise restricted by 27 | copyright and certain other rights. Our licenses are 28 | irrevocable. Licensors should read and understand the terms 29 | and conditions of the license they choose before applying it. 30 | Licensors should also secure all rights necessary before 31 | applying our licenses so that the public can reuse the 32 | material as expected. Licensors should clearly mark any 33 | material not subject to the license. This includes other CC- 34 | licensed material, or material used under an exception or 35 | limitation to copyright. More considerations for licensors: 36 | wiki.creativecommons.org/Considerations_for_licensors 37 | 38 | Considerations for the public: By using one of our public 39 | licenses, a licensor grants the public permission to use the 40 | licensed material under specified terms and conditions. If 41 | the licensor's permission is not necessary for any reason--for 42 | example, because of any applicable exception or limitation to 43 | copyright--then that use is not regulated by the license. Our 44 | licenses grant only permissions under copyright and certain 45 | other rights that a licensor has authority to grant. Use of 46 | the licensed material may still be restricted for other 47 | reasons, including because others have copyright or other 48 | rights in the material. A licensor may make special requests, 49 | such as asking that all changes be marked or described. 50 | Although not required by our licenses, you are encouraged to 51 | respect those requests where reasonable. More_considerations 52 | for the public: 53 | wiki.creativecommons.org/Considerations_for_licensees 54 | 55 | ======================================================================= 56 | 57 | Creative Commons Attribution 4.0 International Public License 58 | 59 | By exercising the Licensed Rights (defined below), You accept and agree 60 | to be bound by the terms and conditions of this Creative Commons 61 | Attribution 4.0 International Public License ("Public License"). To the 62 | extent this Public License may be interpreted as a contract, You are 63 | granted the Licensed Rights in consideration of Your acceptance of 64 | these terms and conditions, and the Licensor grants You such rights in 65 | consideration of benefits the Licensor receives from making the 66 | Licensed Material available under these terms and conditions. 67 | 68 | 69 | Section 1 -- Definitions. 70 | 71 | a. Adapted Material means material subject to Copyright and Similar 72 | Rights that is derived from or based upon the Licensed Material 73 | and in which the Licensed Material is translated, altered, 74 | arranged, transformed, or otherwise modified in a manner requiring 75 | permission under the Copyright and Similar Rights held by the 76 | Licensor. For purposes of this Public License, where the Licensed 77 | Material is a musical work, performance, or sound recording, 78 | Adapted Material is always produced where the Licensed Material is 79 | synched in timed relation with a moving image. 80 | 81 | b. Adapter's License means the license You apply to Your Copyright 82 | and Similar Rights in Your contributions to Adapted Material in 83 | accordance with the terms and conditions of this Public License. 84 | 85 | c. Copyright and Similar Rights means copyright and/or similar rights 86 | closely related to copyright including, without limitation, 87 | performance, broadcast, sound recording, and Sui Generis Database 88 | Rights, without regard to how the rights are labeled or 89 | categorized. For purposes of this Public License, the rights 90 | specified in Section 2(b)(1)-(2) are not Copyright and Similar 91 | Rights. 92 | 93 | d. Effective Technological Measures means those measures that, in the 94 | absence of proper authority, may not be circumvented under laws 95 | fulfilling obligations under Article 11 of the WIPO Copyright 96 | Treaty adopted on December 20, 1996, and/or similar international 97 | agreements. 98 | 99 | e. Exceptions and Limitations means fair use, fair dealing, and/or 100 | any other exception or limitation to Copyright and Similar Rights 101 | that applies to Your use of the Licensed Material. 102 | 103 | f. Licensed Material means the artistic or literary work, database, 104 | or other material to which the Licensor applied this Public 105 | License. 106 | 107 | g. Licensed Rights means the rights granted to You subject to the 108 | terms and conditions of this Public License, which are limited to 109 | all Copyright and Similar Rights that apply to Your use of the 110 | Licensed Material and that the Licensor has authority to license. 111 | 112 | h. Licensor means the individual(s) or entity(ies) granting rights 113 | under this Public License. 114 | 115 | i. Share means to provide material to the public by any means or 116 | process that requires permission under the Licensed Rights, such 117 | as reproduction, public display, public performance, distribution, 118 | dissemination, communication, or importation, and to make material 119 | available to the public including in ways that members of the 120 | public may access the material from a place and at a time 121 | individually chosen by them. 122 | 123 | j. Sui Generis Database Rights means rights other than copyright 124 | resulting from Directive 96/9/EC of the European Parliament and of 125 | the Council of 11 March 1996 on the legal protection of databases, 126 | as amended and/or succeeded, as well as other essentially 127 | equivalent rights anywhere in the world. 128 | 129 | k. You means the individual or entity exercising the Licensed Rights 130 | under this Public License. Your has a corresponding meaning. 131 | 132 | 133 | Section 2 -- Scope. 134 | 135 | a. License grant. 136 | 137 | 1. Subject to the terms and conditions of this Public License, 138 | the Licensor hereby grants You a worldwide, royalty-free, 139 | non-sublicensable, non-exclusive, irrevocable license to 140 | exercise the Licensed Rights in the Licensed Material to: 141 | 142 | a. reproduce and Share the Licensed Material, in whole or 143 | in part; and 144 | 145 | b. produce, reproduce, and Share Adapted Material. 146 | 147 | 2. Exceptions and Limitations. For the avoidance of doubt, where 148 | Exceptions and Limitations apply to Your use, this Public 149 | License does not apply, and You do not need to comply with 150 | its terms and conditions. 151 | 152 | 3. Term. The term of this Public License is specified in Section 153 | 6(a). 154 | 155 | 4. Media and formats; technical modifications allowed. The 156 | Licensor authorizes You to exercise the Licensed Rights in 157 | all media and formats whether now known or hereafter created, 158 | and to make technical modifications necessary to do so. The 159 | Licensor waives and/or agrees not to assert any right or 160 | authority to forbid You from making technical modifications 161 | necessary to exercise the Licensed Rights, including 162 | technical modifications necessary to circumvent Effective 163 | Technological Measures. For purposes of this Public License, 164 | simply making modifications authorized by this Section 2(a) 165 | (4) never produces Adapted Material. 166 | 167 | 5. Downstream recipients. 168 | 169 | a. Offer from the Licensor -- Licensed Material. Every 170 | recipient of the Licensed Material automatically 171 | receives an offer from the Licensor to exercise the 172 | Licensed Rights under the terms and conditions of this 173 | Public License. 174 | 175 | b. No downstream restrictions. You may not offer or impose 176 | any additional or different terms or conditions on, or 177 | apply any Effective Technological Measures to, the 178 | Licensed Material if doing so restricts exercise of the 179 | Licensed Rights by any recipient of the Licensed 180 | Material. 181 | 182 | 6. No endorsement. Nothing in this Public License constitutes or 183 | may be construed as permission to assert or imply that You 184 | are, or that Your use of the Licensed Material is, connected 185 | with, or sponsored, endorsed, or granted official status by, 186 | the Licensor or others designated to receive attribution as 187 | provided in Section 3(a)(1)(A)(i). 188 | 189 | b. Other rights. 190 | 191 | 1. Moral rights, such as the right of integrity, are not 192 | licensed under this Public License, nor are publicity, 193 | privacy, and/or other similar personality rights; however, to 194 | the extent possible, the Licensor waives and/or agrees not to 195 | assert any such rights held by the Licensor to the limited 196 | extent necessary to allow You to exercise the Licensed 197 | Rights, but not otherwise. 198 | 199 | 2. Patent and trademark rights are not licensed under this 200 | Public License. 201 | 202 | 3. To the extent possible, the Licensor waives any right to 203 | collect royalties from You for the exercise of the Licensed 204 | Rights, whether directly or through a collecting society 205 | under any voluntary or waivable statutory or compulsory 206 | licensing scheme. In all other cases the Licensor expressly 207 | reserves any right to collect such royalties. 208 | 209 | 210 | Section 3 -- License Conditions. 211 | 212 | Your exercise of the Licensed Rights is expressly made subject to the 213 | following conditions. 214 | 215 | a. Attribution. 216 | 217 | 1. If You Share the Licensed Material (including in modified 218 | form), You must: 219 | 220 | a. retain the following if it is supplied by the Licensor 221 | with the Licensed Material: 222 | 223 | i. identification of the creator(s) of the Licensed 224 | Material and any others designated to receive 225 | attribution, in any reasonable manner requested by 226 | the Licensor (including by pseudonym if 227 | designated); 228 | 229 | ii. a copyright notice; 230 | 231 | iii. a notice that refers to this Public License; 232 | 233 | iv. a notice that refers to the disclaimer of 234 | warranties; 235 | 236 | v. a URI or hyperlink to the Licensed Material to the 237 | extent reasonably practicable; 238 | 239 | b. indicate if You modified the Licensed Material and 240 | retain an indication of any previous modifications; and 241 | 242 | c. indicate the Licensed Material is licensed under this 243 | Public License, and include the text of, or the URI or 244 | hyperlink to, this Public License. 245 | 246 | 2. You may satisfy the conditions in Section 3(a)(1) in any 247 | reasonable manner based on the medium, means, and context in 248 | which You Share the Licensed Material. For example, it may be 249 | reasonable to satisfy the conditions by providing a URI or 250 | hyperlink to a resource that includes the required 251 | information. 252 | 253 | 3. If requested by the Licensor, You must remove any of the 254 | information required by Section 3(a)(1)(A) to the extent 255 | reasonably practicable. 256 | 257 | 4. If You Share Adapted Material You produce, the Adapter's 258 | License You apply must not prevent recipients of the Adapted 259 | Material from complying with this Public License. 260 | 261 | 262 | Section 4 -- Sui Generis Database Rights. 263 | 264 | Where the Licensed Rights include Sui Generis Database Rights that 265 | apply to Your use of the Licensed Material: 266 | 267 | a. for the avoidance of doubt, Section 2(a)(1) grants You the right 268 | to extract, reuse, reproduce, and Share all or a substantial 269 | portion of the contents of the database; 270 | 271 | b. if You include all or a substantial portion of the database 272 | contents in a database in which You have Sui Generis Database 273 | Rights, then the database in which You have Sui Generis Database 274 | Rights (but not its individual contents) is Adapted Material; and 275 | 276 | c. You must comply with the conditions in Section 3(a) if You Share 277 | all or a substantial portion of the contents of the database. 278 | 279 | For the avoidance of doubt, this Section 4 supplements and does not 280 | replace Your obligations under this Public License where the Licensed 281 | Rights include other Copyright and Similar Rights. 282 | 283 | 284 | Section 5 -- Disclaimer of Warranties and Limitation of Liability. 285 | 286 | a. UNLESS OTHERWISE SEPARATELY UNDERTAKEN BY THE LICENSOR, TO THE 287 | EXTENT POSSIBLE, THE LICENSOR OFFERS THE LICENSED MATERIAL AS-IS 288 | AND AS-AVAILABLE, AND MAKES NO REPRESENTATIONS OR WARRANTIES OF 289 | ANY KIND CONCERNING THE LICENSED MATERIAL, WHETHER EXPRESS, 290 | IMPLIED, STATUTORY, OR OTHER. THIS INCLUDES, WITHOUT LIMITATION, 291 | WARRANTIES OF TITLE, MERCHANTABILITY, FITNESS FOR A PARTICULAR 292 | PURPOSE, NON-INFRINGEMENT, ABSENCE OF LATENT OR OTHER DEFECTS, 293 | ACCURACY, OR THE PRESENCE OR ABSENCE OF ERRORS, WHETHER OR NOT 294 | KNOWN OR DISCOVERABLE. WHERE DISCLAIMERS OF WARRANTIES ARE NOT 295 | ALLOWED IN FULL OR IN PART, THIS DISCLAIMER MAY NOT APPLY TO YOU. 296 | 297 | b. TO THE EXTENT POSSIBLE, IN NO EVENT WILL THE LICENSOR BE LIABLE 298 | TO YOU ON ANY LEGAL THEORY (INCLUDING, WITHOUT LIMITATION, 299 | NEGLIGENCE) OR OTHERWISE FOR ANY DIRECT, SPECIAL, INDIRECT, 300 | INCIDENTAL, CONSEQUENTIAL, PUNITIVE, EXEMPLARY, OR OTHER LOSSES, 301 | COSTS, EXPENSES, OR DAMAGES ARISING OUT OF THIS PUBLIC LICENSE OR 302 | USE OF THE LICENSED MATERIAL, EVEN IF THE LICENSOR HAS BEEN 303 | ADVISED OF THE POSSIBILITY OF SUCH LOSSES, COSTS, EXPENSES, OR 304 | DAMAGES. WHERE A LIMITATION OF LIABILITY IS NOT ALLOWED IN FULL OR 305 | IN PART, THIS LIMITATION MAY NOT APPLY TO YOU. 306 | 307 | c. The disclaimer of warranties and limitation of liability provided 308 | above shall be interpreted in a manner that, to the extent 309 | possible, most closely approximates an absolute disclaimer and 310 | waiver of all liability. 311 | 312 | 313 | Section 6 -- Term and Termination. 314 | 315 | a. This Public License applies for the term of the Copyright and 316 | Similar Rights licensed here. However, if You fail to comply with 317 | this Public License, then Your rights under this Public License 318 | terminate automatically. 319 | 320 | b. Where Your right to use the Licensed Material has terminated under 321 | Section 6(a), it reinstates: 322 | 323 | 1. automatically as of the date the violation is cured, provided 324 | it is cured within 30 days of Your discovery of the 325 | violation; or 326 | 327 | 2. upon express reinstatement by the Licensor. 328 | 329 | For the avoidance of doubt, this Section 6(b) does not affect any 330 | right the Licensor may have to seek remedies for Your violations 331 | of this Public License. 332 | 333 | c. For the avoidance of doubt, the Licensor may also offer the 334 | Licensed Material under separate terms or conditions or stop 335 | distributing the Licensed Material at any time; however, doing so 336 | will not terminate this Public License. 337 | 338 | d. Sections 1, 5, 6, 7, and 8 survive termination of this Public 339 | License. 340 | 341 | 342 | Section 7 -- Other Terms and Conditions. 343 | 344 | a. The Licensor shall not be bound by any additional or different 345 | terms or conditions communicated by You unless expressly agreed. 346 | 347 | b. Any arrangements, understandings, or agreements regarding the 348 | Licensed Material not stated herein are separate from and 349 | independent of the terms and conditions of this Public License. 350 | 351 | 352 | Section 8 -- Interpretation. 353 | 354 | a. For the avoidance of doubt, this Public License does not, and 355 | shall not be interpreted to, reduce, limit, restrict, or impose 356 | conditions on any use of the Licensed Material that could lawfully 357 | be made without permission under this Public License. 358 | 359 | b. To the extent possible, if any provision of this Public License is 360 | deemed unenforceable, it shall be automatically reformed to the 361 | minimum extent necessary to make it enforceable. If the provision 362 | cannot be reformed, it shall be severed from this Public License 363 | without affecting the enforceability of the remaining terms and 364 | conditions. 365 | 366 | c. No term or condition of this Public License will be waived and no 367 | failure to comply consented to unless expressly agreed to by the 368 | Licensor. 369 | 370 | d. Nothing in this Public License constitutes or may be interpreted 371 | as a limitation upon, or waiver of, any privileges and immunities 372 | that apply to the Licensor or You, including from the legal 373 | processes of any jurisdiction or authority. 374 | 375 | 376 | ======================================================================= 377 | 378 | Creative Commons is not a party to its public 379 | licenses. 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Creative Commons übernimmt 11 | keinerlei Gewährleistung hinsichtlich seiner Lizenzen, jedweder unter 12 | deren Bedingungen lizenzierter Materialien oder darauf bezogener 13 | Informationen. Creative Commons schließt jegliche Haftung für Schäden, 14 | die aus ihrer Verwendung resultieren, so weit wie möglich aus. 15 | 16 | Verwendung der Creative Commons Public Licenses 17 | 18 | Creative Commons Public Licenses sind standardisierte 19 | Zusammenstellungen rechtlicher Bedingungen, die Urheber und andere 20 | Rechteinhaber verwenden können, um ihre selbst geschaffenen Werke und 21 | andere Materialien, die urheberrechtlich oder durch bestimmte andere 22 | Rechte geschützt sind, die unten in der Public License genauer benannt 23 | werden, zur Nutzung freizugeben. Die folgenden Überlegungen haben 24 | lediglich informativen Charakter, sind keineswegs vollständig und nicht 25 | Teil unserer Lizenzen. 26 | 27 | Überlegungen für Lizenzgeber: Unsere Public Licenses sind zur 28 | Verwendung durch diejenigen gedacht, die rechtlich befugt sind, 29 | der Allgemeinheit solche Nutzungen von Material zu erlauben, die 30 | sonst durch das Urheberrecht oder bestimmte andere Rechte 31 | untersagt wären. Unsere Lizenzen sind unwiderruflich. Lizenzgeber 32 | sollten die Bedingungen der Lizenz, die sie auswählen, lesen und 33 | verstehen, bevor sie die Lizenz verwenden. Lizenzgeber sollten 34 | zudem alle erforderlichen Rechte einholen, die für die Verwendung 35 | unserer Lizenzen notwendig sind, damit die Allgemeinheit das 36 | lizenzierte Material wie erwartet nutzen kann. Lizenzgeber sollten 37 | jegliches Material, für welches die Lizenz nicht gilt, klar 38 | kenntlich machen. Das gilt auch für anderes CC-lizenziertes 39 | Material und für Material, das gemäß einer urheberrechtlichen 40 | Beschränkung oder Ausnahme genutzt wird. Weitere Überlegungen für 41 | Lizenzgeber finden Sie im Creative Commons Wiki (in Englisch): 42 | wiki.creativecommons.org/Considerations_for_licensors 43 | 44 | Überlegungen für die Allgemeinheit: Durch die Verwendung einer 45 | unserer Public Licenses gibt ein Lizenzgeber der Allgemeinheit die 46 | Erlaubnis, das lizenzierte Material unter bestimmten Bedingungen 47 | zu nutzen. Falls die Erlaubnis des Lizenzgebers aus irgendwelchen 48 | Gründen gar nicht erforderlich ist – beispielsweise wegen einer 49 | urheberrechtlichen Ausnahme oder Beschränkung – dann wird die 50 | entsprechende Nutzung auch nicht durch die Lizenz geregelt. Die 51 | Erlaubnisse in unseren Lizenzen beziehen sich nur auf das 52 | Urheberrecht und bestimmte andere Rechte, hinsichtlich derer der 53 | Lizenzgeber Erlaubnisse geben kann. Die Nutzung des lizenzierten 54 | Materials kann aber dennoch aus anderen Gründen untersagt sein, 55 | etwa weil Dritte Urheber- oder andere Rechte am Material haben. 56 | Ein Lizenzgeber kann auch besondere Wünsche haben, etwa indem er 57 | dazu auffordert, alle Veränderungen zu kennzeichnen oder zu 58 | beschreiben. Obwohl dies dann nicht verpflichtend im Sinne unserer 59 | Lizenzen ist, sollten Sie sich bemühen, derlei Wünschen nach 60 | Möglichkeit nachzukommen. Weitere Überlegungen für die 61 | Allgemeinheit finden Sie im Creative Commons Wiki (in Englisch): 62 | wiki.creativecommons.org/Considerations_for_licensees 63 | 64 | ======================================================================= 65 | 66 | Creative Commons Namensnennung 4.0 International Public License 67 | 68 | Durch die Ausübung der lizenzierten Rechte (wie unten definiert) 69 | erklären Sie sich rechtsverbindlich mit den Bedingungen dieser Creative 70 | Commons Namensnennung 4.0 International Public License (“Public 71 | License”) einverstanden. Soweit die vorliegende Public License als 72 | Lizenzvertrag anzusehen ist, gewährt Ihnen der Lizenzgeber die in der 73 | Public License genannten lizenzierten Rechte im Gegenzug dafür, dass 74 | Sie die Lizenzbedingungen akzeptieren, und gewährt Ihnen die 75 | entsprechenden Rechte in Hinblick auf Vorteile, die der Lizenzgeber 76 | durch das Verfügbarmachen des lizenzierten Materials unter diesen 77 | Bedingungen hat. 78 | 79 | 80 | Abschnitt 1 -- Definitionen. 81 | 82 | a. Abgewandeltes Material bezeichnet Material, welches durch 83 | Urheberrechte oder ähnliche Rechte geschützt ist und vom 84 | lizenzierten Material abgeleitet ist oder darauf aufbaut und in 85 | welchem das lizenzierte Material übersetzt, verändert, 86 | umarrangiert, umgestaltet oder anderweitig modifiziert in einer 87 | Weise enthalten ist, die aufgrund des Urheberrechts oder ähnlicher 88 | Rechte des Lizenzgebers eine Zustimmung erfordert. Im Sinne der 89 | vorliegenden Public License entsteht immer abgewandeltes Material, 90 | wenn das lizenzierte Material ein Musikwerk, eine Darbietung oder 91 | eine Tonaufnahme ist und zur Vertonung von Bewegtbildern verwendet 92 | wird. 93 | 94 | b. Abwandlungslizenz bezeichnet die Lizenz, die Sie in Bezug auf Ihr 95 | Urheberrecht oder ähnliche Rechte an Ihren Beiträgen zum 96 | abgewandelten Material in Übereinstimmng mit den Bedingungen der 97 | vorliegenden Public License erteilen. 98 | 99 | c. Urheberrecht und ähnliche Rechte bezeichnet das Urheberrecht 100 | und/oder ähnliche, dem Urheberrecht eng verwandte Rechte, 101 | einschließlich insbesondere des Rechts des ausübenden Künstlers, 102 | des Rechts zur Sendung, zur Tonaufnahme und des 103 | Sui-generis-Datenbankrechts, unabhängig davon, wie diese Rechte 104 | genannt oder kategorisiert werden. Im Sinne der vorliegenden 105 | Public License werden die in Abschnitt 2(b)(1)-(2) aufgeführten 106 | Rechte nicht als Urheberrecht und ähnliche Rechte angesehen. 107 | 108 | d. Wirksame technische Schutzmaßnahmen bezeichnet solche Maßnahmen, 109 | die gemäß gesetzlichen Regelungen auf der Basis des Artikels 11 110 | des WIPO Copyright Treaty vom 20. Dezember 1996 und/oder ähnlicher 111 | internationaler Vereinbarungen ohne entsprechende Erlaubnis nicht 112 | umgangen werden dürfen. 113 | 114 | e. Ausnahmen und Beschränkungen bezeichnet Fair Use, Fair Dealing 115 | und/oder jegliche andere Ausnahme oder Beschränkung des 116 | Urheberrechts oder ähnlicher Rechte, die auf Ihre Nutzung des 117 | lizenzierten Materials Anwendung findet. 118 | 119 | f. Lizenziertes Material bezeichnet das Werk der Literatur oder 120 | Kunst, die Datenbank oder das sonstige Material, welches der 121 | Lizenzgeber unter die vorliegende Public License gestellt hat. 122 | 123 | g. Lizenzierte Rechte bezeichnet die Ihnen unter den Bedingungen der 124 | vorliegenden Public License gewährten Rechte, welche auf solche 125 | Urheberrechte und ähnlichen Rechte beschränkt sind, die Ihre 126 | Nutzung des lizenzierten Materials betreffen und die der 127 | Lizenzgeber zu lizenzieren berechtigt ist. 128 | 129 | h. Lizenzgeber bezeichnet die natürliche(n) oder juristische(n) 130 | Person(en), die unter der vorliegenden Public License Rechte 131 | gewährt (oder gewähren). 132 | 133 | i. Weitergabe meint, Material der Öffentlichkeit bereitzustellen 134 | durch beliebige Mittel oder Verfahren, die gemäß der lizenzierten 135 | Rechte Zustimmung erfordern, wie zum Beispiel Vervielfältigung, 136 | öffentliche Vorführung, öffentliche Darbietung, Vertrieb, 137 | Verbreitung, Wiedergabe oder Übernahme und öffentliche 138 | Zugänglichmachung bzw. Verfügbarmachung in solcher Weise, dass 139 | Mitglieder der Öffentlichkeit auf das Material von Orten und zu 140 | Zeiten ihrer Wahl zugreifen können. 141 | 142 | j. Sui-generis Datenbankrechte bezeichnet Rechte, die keine 143 | Urheberrechte sind, sondern gegründet sind auf die Richtlinie 144 | 96/9/EG des Europäischen Parlaments und des Rates vom 11. März 145 | 1996 über den rechtlichen Schutz von Datenbanken in der jeweils 146 | gültigen Fassung bzw. deren Nachfolgeregelungen, sowie andere im 147 | Wesentlichen funktionsgleiche Rechte anderswo auf der Welt. 148 | 149 | k. Sie bezeichnet die natürliche oder juristische Person, die von 150 | lizenzierten Rechten unter der vorliegenden Public License 151 | Gebrauch macht. Ihr bzw. Ihre hat die entsprechende Bedeutung. 152 | 153 | 154 | Abschnitt 2 -- Umfang. 155 | 156 | a. Lizenzgewährung. 157 | 158 | 1. Unter den Bedingungen der vorliegenden Public License gewährt 159 | der Lizenzgeber Ihnen eine weltweite, vergütungsfreie, nicht 160 | unterlizenzierbare, nicht-ausschließliche, unwiderrufliche 161 | Lizenz zur Ausübung der lizenzierten Rechte am lizenzierten 162 | Material, um: 163 | 164 | a. das lizenzierte Material ganz oder in Teilen zu 165 | vervielfältigen und weiterzugeben; und 166 | 167 | b. abgewandeltes Material zu erstellen, zu vervielfältigen 168 | und weiterzugeben. 169 | 170 | 2. Ausnahmen und Beschränkungen. Es sei klargestellt, dass, wo 171 | immer gesetzliche Ausnahmen und Beschränkungen auf Ihre 172 | Nutzung Anwendung finden, die vorliegende Public License 173 | nicht anwendbar ist und Sie insoweit ihre Bedingungen nicht 174 | einhalten müssen. 175 | 176 | 3. Laufzeit. Die Laufzeit der vorliegenden Public License wird 177 | in Abschnitt 6(a) geregelt. 178 | 179 | 4. Medien und Formate; Gestattung technischer Modifikationen. 180 | Der Lizenzgeber erlaubt Ihnen, die lizenzierten Rechte in 181 | allen bekannten und zukünftig entstehenden Medien und 182 | Formaten auszuüben und die dafür notwendigen technischen 183 | Modifikationen vorzunehmen. Der Lizenzgeber verzichtet auf 184 | jegliche und/oder versichert die Nichtausübung jeglicher 185 | Rechte und Befugnisse, Ihnen zu verbieten, technische 186 | Modifikationen vorzunehmen, die notwendig sind, um die 187 | lizenzierten Rechte ausüben zu können, einschließlich 188 | solcher, die zur Umgehung wirksamer technischer 189 | Schutzmaßnahmen erforderlich sind. Im Sinne der vorliegenden 190 | Public License entsteht kein abgewandeltes Material, soweit 191 | lediglich Modifikationen vorgenommen werden, die nach diesem 192 | Abschnitt 2(a)(4) zulässig sind. 193 | 194 | 5. Nachfolgende Empfänger. 195 | 196 | a. Angebot des Lizenzgebers -- Lizenziertes Material. 197 | Jeder Empfänger des lizenzierten Materials erhält 198 | automatisch ein Angebot des Lizenzgebers, die 199 | lizenzierten Rechte unter den Bedingungen der 200 | vorliegenden Public License auzuüben. 201 | 202 | b. Keine Beschränkungen für nachfolgende Empfänger. Sie 203 | dürfen keine zusätzlichen oder abweichenden Bedingungen 204 | fordern oder das lizenzierte Material mit solchen 205 | belegen oder darauf wirksame technische Maßnahmen 206 | anwenden, sofern dadurch die Ausübung der lizenzierten 207 | Rechte durch Empfänger des lizenzierten Materials 208 | eingeschränkt wird. 209 | 210 | 6. Inhaltliche Indifferenz. Die vorliegende Public License 211 | begründet nicht die Erlaubnis, zu behaupten oder den Eindruck 212 | zu erwecken, dass Sie oder Ihre Nutzung des lizenzierten 213 | Materials mit dem Lizenzgeber oder den 214 | Zuschreibungsempfängern gemäß Abschnitt 3(a)(1)(A)(i) in 215 | Verbindung stehen oder durch ihn gefördert, gutgeheißen oder 216 | offiziell anerkannt werden. 217 | 218 | b. Sonstige Rechte. 219 | 220 | 1. Urheberpersönlichkeitsrechte, wie etwa zum Schutz vor 221 | Werkentstellungen, werden durch die vorliegende Public 222 | License ebenso wenig mitlizenziert wie das Recht auf 223 | Privatheit, auf Datenschutz und/oder ähnliche 224 | Persönlichkeitsrechte; gleichwohl verzichtet der Lizenzgeber 225 | auf derlei Rechte bzw. ihre Durchsetzung, soweit dies für 226 | Ihre Ausübung der lizenzierten Rechte erforderlich und 227 | möglich ist, jedoch nicht darüber hinaus. 228 | 229 | 2. Patent- und Kennzeichenrechte werden durch die vorliegende 230 | Public License nicht lizenziert. 231 | 232 | 3. Soweit wie möglich verzichtet der Lizenzgeber auf Vergütung 233 | durch Sie für die Ausübung der lizenzierten Rechte, sowohl 234 | direkt als auch durch eine Verwertungsgesellschaft unter 235 | welchem freiwilligen oder abdingbaren gesetzlichen oder 236 | Pflichtlizenzmechanismus auch immer eingezogen. In allen 237 | übrigen Fällen behält sich der Lizenzgeber ausdrücklich jedes 238 | Recht vor, Vergütungen zu fordern. 239 | 240 | 241 | Abschnitt 3 -- Lizenzbedingungen. 242 | 243 | Ihre Ausübung der lizenzierten Rechte unterliegt ausdrücklich folgenden 244 | Bedingungen. 245 | 246 | a. Namensnennung. 247 | 248 | 1. Wenn Sie das lizenzierte Material weitergeben (auch in 249 | veränderter Form), müssen Sie: 250 | 251 | a. die folgenden Angaben beibehalten, soweit sie vom 252 | Lizenzgeber dem lizenzierten Material beigefügt wurden: 253 | 254 | i. die Bezeichnung der/des Ersteller(s) des 255 | lizenzierten Materials und anderer, die für eine 256 | Namensnennung vorgesehen sind (auch durch 257 | Pseudonym, falls angegeben), in jeder durch den 258 | Lizenzgeber verlangten Form, die angemessen ist; 259 | 260 | ii. einen Copyright-Vermerk; 261 | 262 | iii. einen Hinweis auf die vorliegende Public License; 263 | 264 | iv. einen Hinweis auf den Haftungsausschluss; 265 | 266 | v. soweit vernünftigerweise praktikabel einen URI oder 267 | Hyperlink zum lizenzierten Material; 268 | 269 | b. angeben, ob Sie das lizenzierte Material verändert 270 | haben, und alle vorherigen Änderungsangaben beibehalten; 271 | und 272 | 273 | c. angeben, dass das lizenzierte Material unter der 274 | vorliegenden Public License steht, und deren Text oder 275 | URI oder einen Hyperlink darauf beifügen. 276 | 277 | 2. Sie dürfen die Bedingungen des Abschnitts 3(a)(1) in jeder 278 | angemessenen Form erfüllen, je nach Medium, Mittel und 279 | Kontext in bzw. mit dem Sie das lizenzierte Material 280 | weitergeben. Es kann zum Beispiel angemessen sein, die 281 | Bedingungen durch Angabe eines URI oder Hyperlinks auf eine 282 | Quelle zu erfüllen, die die erforderlichen Informationen 283 | enthält. 284 | 285 | 3. Falls der Lizenzgeber es verlangt, müssen Sie die gemäß 286 | Abschnitt 3(a)(1)(A) erforderlichen Informationen entfernen, 287 | soweit dies vernünftigerweise praktikabel ist. 288 | 289 | 4. Falls Sie selbst erstelltes abgewandeltes Material 290 | weitergeben, darf die von Ihnen gewählte Abwandlungslizenz 291 | nicht dazu führen, dass Empfänger des abgewandelten Materials 292 | die vorliegende Public License nicht einhalten können. 293 | 294 | 295 | Abschnitt 4 -- Sui-generis-Datenbankrechte. 296 | 297 | Soweit die lizenzierten Rechte Sui-generis-Datenbankrechte beinhalten, 298 | die auf Ihre Nutzung des lizenzierten Materials Anwendung finden, gilt: 299 | 300 | a. es sei klargestellt, dass Abschnitt 2(a)(1) Ihnen das Recht 301 | gewährt, die gesamten Inhalte der Datenbank oder wesentliche Teile 302 | davon zu entnehmen, weiterzuverwenden, zu vervielfältigen und 303 | weiterzugeben; 304 | 305 | b. sofern Sie alle Inhalte der Datenbank oder wesentliche Teile davon 306 | in eine Datenbank aufnehmen, an der Sie 307 | Sui-generis-Datenbankrechte haben, dann gilt die Datenbank, an der 308 | Sie Sui-generis-Datenbankrechte haben (aber nicht ihre einzelnen 309 | Inhalte) als abgewandeltes Material; und 310 | 311 | c. Sie müssen die Bedingungen des Abschnitts 3(a) einhalten, wenn sie 312 | alle Datenbankinhalte oder wesentliche Teile davon weitergeben. 313 | 314 | Es sei ferner klargestellt, dass dieser Abschnitt 4 Ihre 315 | Verpflichtungen aus der vorliegenden Public License nur ergänzt und 316 | nicht ersetzt, soweit die lizenzierten Rechte andere Urheberrechte oder 317 | ähnliche Rechte enthalten. 318 | 319 | 320 | Abschnitt 5 -- Gewährleistungsausschluss und Haftungsbeschränkung. 321 | 322 | a. SOFERN DER LIZENZGEBER NICHT SEPARAT ANDERES ERKLÄRT UND SO WEIT 323 | WIE MÖGLICH, BIETET DER LIZENZGEBER DAS LIZENZIERTE MATERIAL SO 324 | WIE ES IST UND VERFÜGBAR IST AN UND SAGT IN BEZUG AUF DAS 325 | LIZENZIERTE MATERIAL KEINE BESTIMMTEN EIGENSCHAFTEN ZU, WEDER 326 | AUSDRÜCKLICH NOCH KONKLUDENT ODER ANDERWEITIG, UND SCHLIESST 327 | JEGLICHE GEWÄHRLEISTUNG AUS, EINSCHLIESSLICH DER GESETZLICHEN. 328 | DIES UMFASST INSBESONDERE DAS FREISEIN VON RECHTSMÄNGELN, 329 | VERKEHRSFÄHIGKEIT, EIGNUNG FÜR EINEN BESTIMMTEN ZWECK, WAHRUNG DER 330 | RECHTE DRITTER, FREISEIN VON (AUCH VERDECKTEN) SACHMÄNGELN, 331 | RICHTIGKEIT UND DAS VORLIEGEN ODER NICHTVORLIEGEN VON IRRTÜMERN, 332 | GLEICHVIEL OB SIE BEKANNT, UNBEKANNT ODER ERKENNBAR SIND. DORT, WO 333 | GEWÄHRLEISTUNGSAUSSCHLÜSSE GANZ ODER TEILWEISE UNZULÄSSIG SIND, 334 | GILT DER VORLIEGENDE AUSSCHLUSS MÖGLICHERWEISE FÜR SIE NICHT. 335 | 336 | b. SOWEIT WIE MÖGLICH, HAFTET DER LIZENZGEBER IHNEN GEGENÜBER NACH 337 | KEINEM RECHTLICHEN KONSTRUKT (EINSCHLIESSLICH INSBESONDERE 338 | FAHRLÄSSIGKEIT) ODER ANDERWEITIG FÜR IRGENDWELCHE DIREKTEN, 339 | SPEZIELLEN, INDIREKTEN, ZUFÄLLIGEN, FOLGE-, STRAF- EXEMPLARISCHEN 340 | ODER ANDEREN VERLUSTE, KOSTEN, AUFWENDUNGEN ODER SCHÄDEN, DIE SICH 341 | AUS DER VORLIEGENDEN PUBLIC LICENSE ODER DER NUTZUNG DES 342 | LIZENZIERTEN MATERIALS ERGEBEN, SELBST WENN DER LIZENZGEBER AUF 343 | DIE MÖGLICHKEIT SOLCHER VERLUSTE, KOSTEN, AUFWENDUNGEN ODER 344 | SCHÄDEN HINGEWIESEN WURDE. DORT, WO HAFTUNGSBESCHRÄNKUNGEN GANZ 345 | ODER TEILWEISE UNZULÄSSIG SIND, GILT DIE VORLIEGENDE BESCHRÄNKUNG 346 | MÖGLICHERWEISE FÜR SIE NICHT. 347 | 348 | c. Der Gewährleistungsausschluss und die Haftungsbeschränkung oben 349 | sollen so ausgelegt werden, dass sie soweit wie möglich einem 350 | absoluten Haftungs- und Gewährleistungsausschluss nahe kommen. 351 | 352 | 353 | Abschnitt 6 -- Laufzeit und Beendigung. 354 | 355 | a. Die vorliegende Public License gilt bis zum Ablauf der Schutzfrist 356 | des Urheberrechts und der ähnlichen Rechte, die hiermit lizenziert 357 | werden. Gleichwohl erlöschen Ihre Rechte aus dieser Public License 358 | automatisch, wenn Sie die Bestimmungen dieser Public License nicht 359 | einhalten. 360 | b. Soweit Ihr Recht, das lizenzierte Material zu nutzen, gemäß 361 | Abschnitt 6(a) erloschen ist, lebt es wieder auf: 362 | 363 | 1. automatisch zu dem Zeitpunkt, an welchem die Verletzung 364 | abgestellt ist, sofern dies innerhalb von 30 Tagen seit Ihrer 365 | Kenntnis der Verletzung geschieht; oder durch ausdrückliche 366 | Wiedereinsetzung durch den Lizenzgeber. 367 | 368 | Es sei klargestellt, dass dieser Abschnitt 6(b) die Rechte des 369 | Lizenzgebers, Ausgleich für Ihre Verletzung der vorliegenden 370 | Public License zu verlangen, nicht einschränkt. 371 | 372 | c. Es sei klargestellt, dass der Lizenzgeber das lizenzierte Material 373 | auch unter anderen Bedingungen anbieten oder den Vertrieb des 374 | lizenzierten Materials jederzeit einstellen darf; gleichwohl 375 | erlischt dadurch die vorliegende Public License nicht. 376 | 377 | d. Die Abschnitte 1, 5, 6, 7 und 8 gelten auch nach Erlöschen der 378 | vorliegenden Public License fort. 379 | 380 | 381 | Abschnitt 7 -- Sonstige Bedingungen. 382 | 383 | a. Der Lizenzgeber ist nicht an durch Sie gestellte zusätzliche oder 384 | abweichende Bedingungen gebunden, wenn diese nicht ausdrücklich 385 | vereinbart wurden. 386 | 387 | b. Jedwede das lizenzierte Material betreffenden und hier nicht 388 | genannten Umstände, Annahmen oder Vereinbarungen sind getrennt und 389 | unabhängig von den Bedingungen der vorliegenden Public License. 390 | 391 | 392 | Abschnitt 8 -- Auslegung. 393 | 394 | a. Es sei klargestellt, dass die vorliegende Public License weder 395 | besagen noch dahingehend ausgelegt werden soll, dass sie solche 396 | Nutzungen des lizenzierten Materials verringert, begrenzt, 397 | einschränkt oder mit Bedingungen belegt, die ohne eine Erlaubnis 398 | aus dieser Public License zulässig sind. 399 | 400 | b. Soweit wie möglich soll, falls eine Klausel der vorliegenden 401 | Public License als nicht durchsetzbar anzusehen ist, diese Klausel 402 | automatisch im geringst erforderlichen Maße angepasst werden, um 403 | sie durchsetzbar zu machen. Falls die Klausel nicht anpassbar ist, 404 | soll sie von der vorliegenden Public License abgeschieden werden, 405 | ohne dass die Durchsetzbarkeit der verbleibenden Bedingungen 406 | tangiert wird. 407 | 408 | c. Auf keine Bedingung der vorliegenden Public License wird 409 | verzichtet und kein Verstoß dagegen soll als hingenommen gelten, 410 | außer der Lizenzgeber hat sich damit ausdrücklich einverstanden 411 | erklärt. 412 | 413 | d. Nichts in der vorliegenden Public License soll zu einer 414 | Beschränkung oder Aufhebung von Privilegien und Immunitäten 415 | führen, die dem Lizenzgeber oder Ihnen insbesondere aufgrund 416 | rechtlicher Regelungen irgendeiner Rechtsordnung oder 417 | Rechtsposition zustehen, oder dahingehend interpretiert werden. 418 | 419 | 420 | ======================================================================= 421 | 422 | Creative Commons ist keine Vertragspartei seiner Public Licenses. 423 | Dennoch kann Creative Commons sich dazu entscheiden, eine seiner Public 424 | Licenses für selbst publiziertes Material zu verwenden, und ist in 425 | diesen Fällen als „Lizenzgeber” zu betrachten. Der Text der Creative 426 | Commons Public Licenses selbst wird mittels der CC0 Verzichtserklärung 427 | der Gemeinfreiheit überantwortet. Abgesehen vom begrenzten Zweck, 428 | darauf hinzuweisen, dass Material unter einer Creative Commons Public 429 | License freigegeben ist, und falls es nicht anderweitig erlaubt wird 430 | durch die Creative-Commons-Policies, die unter 431 | creativecommons.org/policies veröffentlicht sind, erlaubt Creative 432 | Commons es nicht, dass die Marke “Creative Commons” oder eine andere 433 | Marke oder ein anderes Logo von Creative Commons ohne vorherige 434 | schriftliche Zustimmung genutzt werden, insbesondere in Verbindung mit 435 | nicht autorisierten Veränderungen seiner Public Licenses oder sonstigen 436 | Regelungen, Übereinkünften oder Vereinbarungen in Bezug auf die Nutzung 437 | lizenzierten Materials. 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Ein zentraler Bestandteil einer erfolgreichen Erregersurveillance ist das Verständnis der Verbreitung eines Erregers sowie seiner pathogenen Eigenschaften. Hierbei stellt das Wissen über das Erregergenom eine wichtige Informationsquelle dar. So erlaubt der Nachweis von Mutationen im Genom eines Erregers, Verwandtschaftsbeziehungen zu rekonstruieren, Übertragungswege aufzudecken und Resistenzen vorherzusagen. Die Integrierte Genomische Surveillance (IGS) von SARS-CoV-2 zielt darauf ab, die Verbreitung des Virus und insbesondere von besorgniserregenden Virusvarianten in der Bevölkerung zu überwachen sowie auftretende Veränderungen des Virus genau zu beobachten. Besondere Bedeutung kommt dabei der öffentlichen Bereitstellung der genomischen Daten zu, um Wissenschaftlern in Deutschland und weltweit die Möglichkeit zu eigenständigen Analysen zu eröffnen.

Im Rahmen der Coronavirus-Surveillanceverordnung wurden bis zum 31.05.2023 SARS-CoV-2 Sequenzdaten aus ganz Deutschland über den Deutschen Elektronischen Sequenzdaten-Hub (DESH) an das RKI übermittelt. Mit Ablauf der Verordnung werden künftig Proben durch das IMSSC2 Labornetzwerk bereitgestellt und am RKI sequenziert, analysiert und hier bereitgestellt. Trotz reduzierter Probenanzahl, wird durch die sorgfältige Auswahl der beteiligten Labore ein repräsentativer Einblick in die Viruspopluation gesichert (Djin Ye Oh et al. 2022). Zusätzlich werden Sequenzen vom NRZ Coronaviren an der Charité beigetragen um das IMSSC2 Netzwerk zu ergänzen.

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Hierbei stellt das Wissen über das Erregergenom eine wichtige Informationsquelle dar. So erlaubt der Nachweis von Mutationen im Genom eines Erregers, Verwandtschaftsbeziehungen zu rekonstruieren, Übertragungswege aufzudecken und Resistenzen vorherzusagen. Die Integrierte Genomische Surveillance (IGS) von SARS-CoV-2 zielt darauf ab, die Verbreitung des Virus und insbesondere von besorgniserregenden Virusvarianten in der Bevölkerung zu überwachen sowie auftretende Veränderungen des Virus genau zu beobachten. Besondere Bedeutung kommt dabei der öffentlichen Bereitstellung der genomischen Daten zu, um Wissenschaftlern in Deutschland und weltweit die Möglichkeit zu eigenständigen Analysen zu eröffnen.\n\n\nIm Rahmen der Coronavirus-Surveillanceverordnung (https://www.gesetze-im-internet.de/corsurv/BJNR601910021.html) wurden bis zum 31.05.2023 SARS-CoV-2 Sequenzdaten aus ganz Deutschland über den Deutschen Elektronischen Sequenzdaten-Hub (DESH) an das RKI übermittelt (https://doi.org/10.5281/zenodo.8046538). Mit Ablauf der Verordnung werden künftig Proben durch das IMSSC2 Labornetzwerk bereitgestellt und am RKI sequenziert, analysiert und hier bereitgestellt. Trotz reduzierter Probenanzahl, wird durch die sorgfältige Auswahl der beteiligten Labore ein repräsentativer Einblick in die Viruspopluation gesichert (Djin Ye Oh et al. 2022) (https://doi.org/10.1093/cid/ciac399). Zusätzlich werden Sequenzen vom NRZ Coronaviren an der Charité beigetragen um das IMSSC2 Netzwerk zu ergänzen." 13 | } 14 | ], 15 | "titles": [ 16 | { 17 | "language": "DE (German)", 18 | "text": "SARS-CoV-2 Sequenzdaten aus Deutschland" 19 | } 20 | ], 21 | "ids": [ 22 | { 23 | "identifier": "10.5281/zenodo.15535746", 24 | "typeGeneral": "Dataset", 25 | "relationType": "A references B", 26 | "scheme": "DOI" 27 | }, 28 | { 29 | "identifier": "https://github.com/robert-koch-institut/SARS-CoV-2-Sequenzdaten_aus_Deutschland", 30 | "relationType": "A references B", 31 | "typeGeneral": "Dataset", 32 | "scheme": "URL" 33 | } 34 | ], 35 | "provenance": { 36 | "dataSource": "Automatically uploaded: Other" 37 | }, 38 | "keywords": [ 39 | { 40 | "label": "COVID-19" 41 | }, 42 | { 43 | "label": "SARS-CoV-2" 44 | }, 45 | { 46 | "label": "Virussequenzen" 47 | }, 48 | { 49 | "label": "Genom" 50 | }, 51 | { 52 | "label": "Basensequenz" 53 | }, 54 | { 55 | "label": "Deutschland" 56 | }, 57 | { 58 | "label": "Viral Sequences" 59 | }, 60 | { 61 | "label": "Genome" 62 | }, 63 | { 64 | "label": "Base Sequence" 65 | }, 66 | { 67 | "label": "Gesundheitsberichterstattung", 68 | "code": "info:ddc/22/de//614.42" 69 | }, 70 | { 71 | "label": "Biochemische Genetik", 72 | "code": "info:ddc/22/de//572.8" 73 | }, 74 | { 75 | "label": "Epidemiologie", 76 | "code": "info:ddc/22/de//614.4" 77 | }, 78 | { 79 | "label": "Biochemical genetics", 80 | "code": "info:ddc/22/eng//572.8" 81 | }, 82 | { 83 | "label": "Public health surveillance", 84 | "code": "info:ddc/22/eng//614.42" 85 | }, 86 | { 87 | "label": "Epidemiology", 88 | "code": "info:ddc/22/eng//614.4" 89 | }, 90 | { 91 | "label": "Open Data" 92 | }, 93 | { 94 | "label": "Offene Daten" 95 | }, 96 | { 97 | "label": "Deutschland" 98 | }, 99 | { 100 | "label": "Germany" 101 | }, 102 | { 103 | "label": "RKI" 104 | } 105 | ], 106 | "languages": [ 107 | "DE (German)" 108 | ], 109 | "nonStudyDetails": { 110 | "useRights": { 111 | "confirmations": { 112 | "authority": true, 113 | "irrevocability": true, 114 | "terms": true, 115 | "supportByLicensing": true 116 | }, 117 | "label": "CC BY 4.0 (Creative Commons Attribution 4.0 International)" 118 | }, 119 | "version": "2025-05-27" 120 | }, 121 | "webpage": "https://robert-koch-institut.github.io/SARS-CoV-2-Sequenzdaten_aus_Deutschland/", 122 | "contributors": [ 123 | { 124 | "affiliations": [ 125 | { 126 | "name": "Robert Koch-Institut", 127 | "identifiers": [ 128 | { 129 | "identifier": "01k5qnb77", 130 | "scheme": "ROR" 131 | } 132 | ] 133 | } 134 | ], 135 | "nameType": "Organisational", 136 | "organisational": { 137 | "name": "Robert Koch-Institut", 138 | "type": "Creator/Author" 139 | } 140 | } 141 | ], 142 | "identifier": "1302" 143 | } 144 | } -------------------------------------------------------------------------------- /Metadaten/schemas/tableschema_SARS-CoV-2-Entwicklungslinien_berichtet.json: -------------------------------------------------------------------------------- 1 | { 2 | "fields": [ 3 | { 4 | "name": "LINEAGE", 5 | "type": "string", 6 | "description": "Zugewiesene Pangolin Lineage", 7 | "constraints": { 8 | "required": true 9 | }, 10 | "example": "JN.1" 11 | }, 12 | { 13 | "name": "WHO_LABEL", 14 | "type": "string", 15 | "description": "Name der Virusvariante, der von der World Health Organisation vergeben wurde", 16 | "constraints": { 17 | "required": true 18 | }, 19 | "example": "Omikron" 20 | }, 21 | { 22 | "name": "CONTRIBUTING_LINEAGES", 23 | "type": "string", 24 | "description": "Pangolin Lineages, die von der Lineage abstammen", 25 | "constraints": { 26 | "required": true 27 | }, 28 | "example": "JN.1.1.10" 29 | } 30 | ] 31 | } -------------------------------------------------------------------------------- /Metadaten/schemas/tableschema_SARS-CoV-2-Entwicklungslinien_zu_Varianten.json: -------------------------------------------------------------------------------- 1 | { 2 | "fields": [ 3 | { 4 | "name": "LINEAGE", 5 | "type": "string", 6 | "description": "Zugewiesene Pangolin Lineage", 7 | "constraints": { 8 | "required": true 9 | }, 10 | "example": "BA.2" 11 | }, 12 | { 13 | "name": "WHO_LABEL", 14 | "type": "string", 15 | "description": "Name der Virusvariante, der von der World Health Organisation vergeben wurde", 16 | "constraints": { 17 | "required": true 18 | }, 19 | "example": "Omikron" 20 | }, 21 | { 22 | "name": "CONTRIBUTING_LINEAGES", 23 | "type": "string", 24 | "description": "Pangolin Lineages, die von der Lineage abstammen", 25 | "constraints": { 26 | "required": true 27 | }, 28 | "example": "JN.13.1" 29 | }, 30 | { 31 | "name": "COLOR", 32 | "type": "any", 33 | "description": "Veraltete Variable. 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Ein zentraler Bestandteil einer erfolgreichen Erregersurveillance ist das Verständnis der Verbreitung eines Erregers sowie seiner pathogenen Eigenschaften. Hierbei stellt das Wissen über das Erregergenom eine wichtige Informationsquelle dar. So erlaubt der Nachweis von Mutationen im Genom eines Erregers, Verwandtschaftsbeziehungen zu rekonstruieren, Übertragungswege aufzudecken und Resistenzen vorherzusagen. Die Integrierte Genomische Surveillance (IGS) von SARS-CoV-2 zielt darauf ab, die Verbreitung des Virus und insbesondere von besorgniserregenden Virusvarianten in der Bevölkerung zu überwachen sowie auftretende Veränderungen des Virus genau zu beobachten. Besondere Bedeutung kommt dabei der öffentlichen Bereitstellung der genomischen Daten zu, um Wissenschaftlern in Deutschland und weltweit die Möglichkeit zu eigenständigen Analysen zu eröffnen.

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Im Rahmen der Coronavirus-Surveillanceverordnung wurden bis zum 31.05.2023 SARS-CoV-2 Sequenzdaten aus ganz Deutschland über den Deutschen Elektronischen Sequenzdaten-Hub (DESH) an das RKI übermittelt. Mit Ablauf der Verordnung werden künftig Proben durch das IMSSC2 Labornetzwerk bereitgestellt und am RKI sequenziert, analysiert und hier bereitgestellt. Trotz reduzierter Probenanzahl, wird durch die sorgfältige Auswahl der beteiligten Labore ein repräsentativer Einblick in die Viruspopluation gesichert (Djin Ye Oh et al. 2022). Zusätzlich werden Sequenzen vom NRZ Coronaviren an der Charité beigetragen um das IMSSC2 Netzwerk zu ergänzen.

\n", 4 | "resource_type": { 5 | "id": "dataset" 6 | }, 7 | "publication_date": "2025-05-28", 8 | "creators": [ 9 | { 10 | "person_or_org": { 11 | "type": "organizational", 12 | "name": "Robert Koch-Institut" 13 | } 14 | } 15 | ], 16 | "contributors": [], 17 | "publisher": "Zenodo", 18 | "version": "2025-05-28", 19 | "dates": [ 20 | { 21 | "date": "2025-05-27T10:26:00+02:00", 22 | "type": { 23 | "id": "created" 24 | }, 25 | "description": "Date when the dataset was created" 26 | } 27 | ], 28 | "languages": [ 29 | { 30 | "id": "deu" 31 | } 32 | ], 33 | "related_identifiers": [ 34 | { 35 | "scheme": "url", 36 | "relation_type": { 37 | "id": "issupplementto" 38 | }, 39 | "identifier": "https://github.com/robert-koch-institut/SARS-CoV-2-Sequenzdaten_aus_Deutschland", 40 | "resource_type": { 41 | "id": "dataset" 42 | } 43 | } 44 | ], 45 | "rights": [ 46 | { 47 | "id": "cc-by-4.0" 48 | } 49 | ], 50 | "subjects": [ 51 | { 52 | "subject": "COVID-19" 53 | }, 54 | { 55 | "subject": "SARS-CoV-2" 56 | }, 57 | { 58 | "subject": "Virussequenzen" 59 | }, 60 | { 61 | "subject": "Genom" 62 | }, 63 | { 64 | "subject": "Basensequenz" 65 | }, 66 | { 67 | "subject": "Deutschland" 68 | }, 69 | { 70 | "subject": "Viral Sequences" 71 | }, 72 | { 73 | "subject": "Genome" 74 | }, 75 | { 76 | "subject": "Base Sequence" 77 | }, 78 | { 79 | "subject": "Open Data" 80 | }, 81 | { 82 | "subject": "Offene Daten" 83 | }, 84 | { 85 | "subject": "Deutschland" 86 | }, 87 | { 88 | "subject": "Germany" 89 | }, 90 | { 91 | "subject": "RKI" 92 | } 93 | ], 94 | "custom_fields": { 95 | "legacy:communities": [ 96 | "robertkochinstitut" 97 | ], 98 | "legacy:subjects": [ 99 | { 100 | "term": "Gesundheitsberichterstattung", 101 | "identifier": "info:ddc/22/de//614.42" 102 | }, 103 | { 104 | "term": "Biochemische Genetik", 105 | "identifier": "info:ddc/22/de//572.8" 106 | }, 107 | { 108 | "term": "Epidemiologie", 109 | "identifier": "info:ddc/22/de//614.4" 110 | }, 111 | { 112 | "term": "Biochemical genetics", 113 | "identifier": "info:ddc/22/eng//572.8" 114 | }, 115 | { 116 | "term": "Public health surveillance", 117 | "identifier": "info:ddc/22/eng//614.42" 118 | }, 119 | { 120 | "term": "Epidemiology", 121 | "identifier": "info:ddc/22/eng//614.4" 122 | } 123 | ] 124 | } 125 | } -------------------------------------------------------------------------------- /Metadaten/zenodo.json: -------------------------------------------------------------------------------- 1 | { 2 | "title": "SARS-CoV-2 Sequenzdaten aus Deutschland", 3 | "description": "

Ein zentraler Bestandteil einer erfolgreichen Erregersurveillance ist das Verständnis der Verbreitung eines Erregers sowie seiner pathogenen Eigenschaften. Hierbei stellt das Wissen über das Erregergenom eine wichtige Informationsquelle dar. So erlaubt der Nachweis von Mutationen im Genom eines Erregers, Verwandtschaftsbeziehungen zu rekonstruieren, Übertragungswege aufzudecken und Resistenzen vorherzusagen. Die Integrierte Genomische Surveillance (IGS) von SARS-CoV-2 zielt darauf ab, die Verbreitung des Virus und insbesondere von besorgniserregenden Virusvarianten in der Bevölkerung zu überwachen sowie auftretende Veränderungen des Virus genau zu beobachten. Besondere Bedeutung kommt dabei der öffentlichen Bereitstellung der genomischen Daten zu, um Wissenschaftlern in Deutschland und weltweit die Möglichkeit zu eigenständigen Analysen zu eröffnen.

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Im Rahmen der Coronavirus-Surveillanceverordnung wurden bis zum 31.05.2023 SARS-CoV-2 Sequenzdaten aus ganz Deutschland über den Deutschen Elektronischen Sequenzdaten-Hub (DESH) an das RKI übermittelt. Mit Ablauf der Verordnung werden künftig Proben durch das IMSSC2 Labornetzwerk bereitgestellt und am RKI sequenziert, analysiert und hier bereitgestellt. Trotz reduzierter Probenanzahl, wird durch die sorgfältige Auswahl der beteiligten Labore ein repräsentativer Einblick in die Viruspopluation gesichert (Djin Ye Oh et al. 2022). Zusätzlich werden Sequenzen vom NRZ Coronaviren an der Charité beigetragen um das IMSSC2 Netzwerk zu ergänzen.

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4 | 5 | [**Robert Koch-Institut | RKI**](https://rki.de) 6 | Nordufer 20 7 | 13353 Berlin 8 | 9 |
10 | 11 | --- 12 | 13 | **Zitieren** 14 | 15 | Robert Koch-Institut. (2025). SARS-CoV-2 Sequenzdaten aus Deutschland [Data set]. Zenodo. [https://doi.org/10.5281/zenodo.15535746](https://doi.org/10.5281/zenodo.15535746) 16 | 17 | 18 | 19 | ## Informationen zum Datensatz und Entstehungskontext 20 | 21 | Ein zentraler Bestandteil einer erfolgreichen Erregersurveillance ist das Verständnis der Verbreitung eines Erregers sowie seiner pathogenen Eigenschaften. Hierbei stellt das Wissen über das Erregergenom eine wichtige Informationsquelle dar. So erlaubt der Nachweis von Mutationen im Genom eines Erregers, Verwandtschaftsbeziehungen zu rekonstruieren, Übertragungswege aufzudecken und Resistenzen vorherzusagen. Die Integrierte Genomische Surveillance (IGS) von SARS-CoV-2 zielt darauf ab, die Verbreitung des Virus und insbesondere von besorgniserregenden Virusvarianten in der Bevölkerung zu überwachen sowie auftretende Veränderungen des Virus genau zu beobachten. Besondere Bedeutung kommt dabei der öffentlichen Bereitstellung der genomischen Daten zu, um Wissenschaftlern in Deutschland und weltweit die Möglichkeit zu eigenständigen Analysen zu eröffnen. 22 | 23 | Im Rahmen der [Coronavirus-Surveillanceverordnung](https://www.gesetze-im-internet.de/corsurv/BJNR601910021.html) wurden bis zum 31.05.2023 [SARS-CoV-2 Sequenzdaten aus ganz Deutschland über den Deutschen Elektronischen Sequenzdaten-Hub (DESH) an das RKI übermittelt](https://doi.org/10.5281/zenodo.7992536). Mit Ablauf der Verordnung werden künftig Proben durch das IMSSC2 Labornetzwerk bereitgestellt und am RKI sequenziert, analysiert und hier bereitgestellt. Trotz reduzierter Probenanzahl, wird durch die sorgfältige Auswahl der beteiligten Labore ein repräsentativer Einblick in die Viruspopluation gesichert ([Djin Ye Oh *et al.* **2022**)](https://doi.org/10.1093/cid/ciac399). Zusätzlich werden Sequenzen vom NRZ Coronaviren an der Charité beigetragen um das IMSSC2 Netzwerk zu ergänzen. 24 | 25 | ### Administrative und organisatorische Angaben 26 | 27 | Der Datensatz "SARS-CoV-2-Sequenzdaten aus Deutschland" wird vom [Robert Koch-Institut](https://rki.de) für Forschungsarbeiten im Zusammenhang mit der SARS-CoV-2-Surveillance im IGS Projekt bereitgestellt. 28 | 29 | Die Datenerhebung am RKI erfolgt mit Ablauf der Coronavirus-Surveillanceverordnung über das IMSSC2 Labornetzwerk unter der Leitung von [FG 17 | Influenzaviren und weitere Viren des Respirationstraktes](https://www.rki.de/DE/Institut/Organisation/Abteilungen/Abteilung-1/FG17/fg17-influenzaviren-und-weitere-viren-des-respirationstraktes-node.html) und durch das [Nationale Referenzzentrum für Coronaviren](https://virologie-ccm.charite.de/diagnostik/konsiliarlaboratorium_fuer_coronaviren/). 30 | 31 | Im Rahmen des IGS Projektes werden die produzierten Daten von [MF1 | Genome Competence Centre](https://www.rki.de/DE/Institut/Organisation/Abteilungen/MFI/MF1/mf1-genom-kompetenzzentrum-node.html) bioinformatisch analysiert. Fragen bezüglich des Projektes können am besten an [IGS@rki.de](mailto:IGS@rki.de) gerichtet werden. 32 | 33 | Die Koordinierung und Meldedatenerfassung wird von [FG 36 | Respiratorisch übertragbare Erkrankungen](https://www.rki.de/DE/Institut/Organisation/Abteilungen/Abteilung-3/FG36/fg36-respiratorisch-uebertragbare-erkrankungen-node.html) durchgeführt. 34 | 35 | Die Veröffentlichung der Daten, die Datenkuration sowie das Qualitätsmanagement der (Meta-)Daten erfolgen durch das Fachgebiet [MF 4 | Fach- und Forschungsdatenmanagement](https://www.rki.de/DE/Institut/Organisation/Abteilungen/MFI/MF4/mf4-fach-und-forschungsdatenmanagement-node.html) des RKI. Fragen zum Datenmanagement können an das Open Data Team des Fachgebiets MF4 gerichtet werden ([OpenData@rki.de](mailto:opendata@rki.de)). 36 | 37 | 38 | ### Datenerhebung 39 | 40 | Das IMSSC2 Labornetzwerk besteht aus ~20 labormedizinischen Einrichtungen in 13 Bundesländern, die wöchentlich zufällig ausgewähltes SARS-CoV-2-positives Probenmaterial ans RKI senden. Hier erfolgt eine Ganzgenomsequenzierung sowie weiterführende phylogenetische und genombiologische Analysen, die eine Identifizierung der häufigsten in Deutschland zirkulierenden SARS-CoV-2 Linien ermöglicht. Die Ergebnisse werden auf der Webseite des RKI und in Fachzeitschriften zeitnah publiziert und tragen zur Bewertung der aktuellen epidemiologischen Lage von COVID-19 bei. Erweitert werden die IMSSC2 Daten durch Sequenzen, die durch das Nationales Konsiliarlaboratorium für Coronaviren erhoben werden. Die Daten aus beiden Quellen werden über GitHub und andere öffentliche Datenbanken der Öffentlichkeit zur Verfügung gestellt. Ebenfalls im Datensatz enthalten sind SARS-CoV-2 Sequenzdaten aus ganz Deutschland die bis zum 31.05.2023 über den [Deutschen Elektronischen Sequenzdaten-Hub (DESH)](https://doi.org/10.5281/zenodo.7992536) an das RKI übermittelt wurden. 41 | 42 | ### Zuordnung von Viruslinien basierend auf Pangolin 43 | 44 | Die Zuordnung bekannter Viruslinien zu den erhobenen Sequenzen erfolgt mittels [Pangolin](https://github.com/cov-lineages/pangolin). Mit Erscheinen einer neuen Version oder aktualisierter Liniendefinitionen von [Pangolin](https://github.com/cov-lineages/pangolin) erfolgt eine Neuzuordnung der Linieninformation für die gesamte Sequenzkollektion den gesamten Sequenzdatensatz. Die Informationen über die Lineage und die genutzte Pangolin Version befindet sich für jede Sequenz in den Metadaten. 45 | 46 | Die bereitgestellten Informationen zu den Viruslinien entsprechen dem aktuellen [PANGOLIN Lineage Format](https://cov-lineages.org/resources/pangolin/output.html). Nur die Spalte "Taxon" wurde zur einfacherer Nachnutzung in SEQUENCE.ID umbenannt. Zentral für die Verknüpfung der Entwicklungslinien mit den weiteren Daten ist die SEQUENCE.ID, die in allen drei Daten enthalten ist. [PANGOLIN Lineage Format](https://cov-lineages.org/resources/pangolin/output.html) ist bei Widersprüchen authoritativ. 47 | 48 | ### Qualitätsmanagement 49 | 50 | Die Daten, die durch DESH erhoben wurden, durchliefen die Qualitätskontrolle (QC) der IGS am RKI nach veröffentlichten Kriterien (siehe: [rki.de - DESH Qualitaetskriterien.pdf](https://doi.org/10.25646/13054)). Zusätzlich wird für alle Sequenzen, inklusive IMSSC2 Proben, eine bioinformatische QC der Sequenz mit [PRESIDENT: PaiRwisE Sequence IDENtiTy](https://github.com/hoelzer-lab/president) durchgeführt mit einen Identitäts-Grenzwert von 70% und einen N-Grenzwert von 20%. Die Metadaten-QC überprüft die Metadaten auf fehlerhafte Daten und Eingaben, die die weitere Verarbeitung beeinflussen würden. 51 | Bei nicht bestehen der QC für Metadaten oder Sequenzdaten werden diese Daten nicht öffentlich bereitgestellt, um die hohe Qualität des öffentlichen Datensatzes zu gewährleisten. 52 | 53 | ## Aufbau und Inhalt des Datensatzes 54 | 55 | Der Datensatz umfasst genomische Sequenzen von SARS-CoV-2-Isolaten aus ganz Deutschland und zugehörige Metadaten. Im Datensatz enthalten sind: 56 | 57 | * [Übermittelte SARS-CoV-2-Genomsequenzen](#struktur-der-sequenzdaten) 58 | * [Metadaten zu den SARS-CoV-2-Genomsequenzen](#sequenzmetadaten) 59 | * Lizenz mit der Nutzungslizenz des Datensatzes 60 | * Metadaten Datei zum Import in Zenodo 61 | * Informationen über VOCs und VOIs 62 | * Liste von relevanten Lineages 63 | 64 | 65 | ### SARS-CoV-2-Sequenzdaten 66 | 67 | Die SARS-CoV-2-Sequenzdaten werden im Hauptverzeichnis unter "SARS-CoV-2-Sequenzdaten_Deutschland.fasta.xz" bereitgestellt. 68 | 69 | >[SARS-CoV-2-Sequenzdaten_Deutschland.fasta.xz](https://github.com/robert-koch-institut/SARS-CoV-2-Sequenzdaten_aus_Deutschland/blob/main/SARS-CoV-2-Sequenzdaten_Deutschland.fasta.xz) 70 | 71 | #### Struktur der Sequenzdaten 72 | 73 | Die bereitgestellte Datei enthält Sequenzeinträge, die nach dem FASTA-Format strukturiert sind. In diesem Format beginnt jeder Eintrag mit einer kurzen Beschreibung, auch Kopfzeile oder "description line" genannt. Diese Zeile wird durch ein ">"-Zeichen am Zeilenanfang gekennzeichnet. Nach der Kopfzeile folgt die Sequenz selbst, die eine Abfolge von Nukleinsäuren im IUB/IUPAC Format darstellt 74 | 75 | Jede Sequenz endet mit dem Beginn eines neuen Sequenzeintrages, gekennzeichnet durch eine neue Kopfzeile, oder, im Falle des letzten Sequenzeintrages, mit dem Ende der Datei. 76 | 77 | In den bereitgestellten Sequenzdaten entspricht die Kopfzeile der SEQUENCE.ID, was eine einfache Verknüpfung mit den bereitgestellten Metadaten erlaubt. 78 | 79 | * Kopfzeile: ">\ version=\ id=\ \" 80 | * Nukleinsäuresequenz: IUB/IUPAC Standard 81 | 82 | Daraus ergibt sich beispielhaft folgende Struktur einer .fasta-Datei: 83 | 84 | ```fasta= 85 | >IGS-101XX-CVDP-XX version=1 id=939421ee-feab-4b79-9f19-6dc248e0ee89 0 86 | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACCAACCAACTTTCGATCTCTT... 87 | >IGS-101YY-CVDP-YY version=0 id=08f5d734-d135-4d2a-9680-bc5a795b2d34 0 88 | NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACCAACTCTCGGCTGCATGCT... 89 | ``` 90 | #### Komprimierung der Sequenzdaten 91 | 92 | Die SARS-CoV-2-Sequenzdaten werden als [xz-komprimierte](https://en.wikipedia.org/wiki/XZ_Utils) [.fasta](https://en.wikipedia.org/wiki/FASTA_format) Datei bereitgestellt. Daraus ergibt sich die Dateiendung .fasta.xz. Es werden Linux Zeilenumbrüche verwendet. 93 | 94 | * Zeichensatz: UTF-8 95 | * Komprimierung: [.xz](https://en.wikipedia.org/wiki/XZ_Utils) 96 | * Enthaltenes Dateiformat: [.fasta](https://de.wikipedia.org/wiki/FASTA-Format) 97 | * Zeilenumbrüche: Linux Zeilenumbrüche 98 | 99 | Die Dateien können auf gängigen Betriebssystemen, beispielsweise mit den Programmen [7zip](https://www.7-zip.org/) oder [XZ Utils](https://tukaani.org/xz/), entpackt werden. Die Komprimierung wird vorgenommen, da insbesondere die .fasta-Dateien mehrere Gigabyte (GB) groß sind. 100 | 101 | ### Sequenzmetadaten 102 | 103 | Die Sequenzmetadaten werden in der "SARS-CoV-2-Sequenzdaten_Deutschland.tsv.xz" bereitgestellt. Diese Daten enthalten ebenfalls die zugeordneten Viruslinien. 104 | 105 | >[SARS-CoV-2-Sequenzdaten_Deutschland.tsv.xz](https://github.com/robert-koch-institut/SARS-CoV-2-Sequenzdaten_aus_Deutschland/blob/main/SARS-CoV-2-Sequenzdaten_Deutschland.tsv.xz) 106 | 107 | #### Variablen und Werte 108 | 109 | 110 | 111 | Die Datei [SARS-CoV-2-Sequenzdaten_Deutschland.tsv.xz](https://github.com/robert-koch-institut/SARS-CoV-2-Sequenzdaten_aus_Deutschland/blob/main/SARS-CoV-2-Sequenzdaten_Deutschland.tsv.xz) enthält die in der folgenden Tabelle abgebildeten Variablen und deren Ausprägungen. Ein maschinenlesbares Datenschema ist im [Data Package Standard](https://datapackage.org/) in [tableschema_SARS-CoV-2-Sequenzdaten_Deutschland.json](https://github.com/robert-koch-institut/SARS-CoV-2-Sequenzdaten_aus_Deutschland/blob/main/Metadaten/schemas/tableschema_SARS-CoV-2-Sequenzdaten_Deutschland.json) hinterlegt: 112 | > [tableschema_SARS-CoV-2-Sequenzdaten_Deutschland.json](https://github.com/robert-koch-institut/SARS-CoV-2-Sequenzdaten_aus_Deutschland/blob/main/Metadaten/schemas/tableschema_SARS-CoV-2-Sequenzdaten_Deutschland.json) 113 | 114 | 115 | | Variable | Typ | Ausprägungen | Beschreibung | 116 | |:--------------------------------------|:--------|:----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------|:--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------| 117 | | igs_id | string | Beispiel: `IGS-10099-CVDP-01A2C74B-54A8-4`
`7B1-B7E4-6562C6231234` | Ein eindeutiger Identifikator der Sequenzdaten und Metadaten zusammenführt. Dieser Identifikator wird als Teil der FASTA ID in den Sequenzdaten genutzt. | 118 | | date_of_sampling | date | Format: `YYYY-MM-DDTHH:MM:SS` | Datum der Probeentnahme im ISO 8601 Format ohne Zeitzone | 119 | | sequencing_platform | string | Beispiel: `ILLUMINA` | Die verwendete Sequenzierungs-Plattform auf Basis der von ENA zugelassenen Ontologie (siehe [ena](https://ena-docs.readthedocs.io/en/latest/submit/reads/webin-cli.html#permitted-values-for-platform)). | 120 | | sequencing_reason | string | Werte: `random`, `requested`, `clinical`, `other` | Grund für die Durchführung der Sequenzierung `random`: Die Probe wurde randomisiert genommen. `requested`: Die Probe wurde aufgrund von Bedenken/Verdacht auf eine neue Variante oder Vergleichbares genommen. `clinical`: Die Probe kommt aus einem klinischem Umfeld. `other`: Der Grund it keiner der oben genannten. | 121 | | isolation_source | string | Beispiel: `Nasopharyngeal swab (specimen)` | [DEMIS Vokabular](https://simplifier.net/rki.demis.laboratory/materialcvdp) | 122 | | lab_sequence_id | string | Beispiel: `873a7cc28d29e3f17b0544ea6e9e84`
`36defe32f6d60649159ee8ac78d414`
`7ac9` | Vom Labor genutzte FASTA ID in verschlüsselter Form | 123 | | date_of_submission | date | Format: `YYYY-MM-DDTHH:MM:SS` | Datum des Eingangs des Genoms am RKI im ISO 8601 Format ohne Zeitzone | 124 | | version | integer | Werte: `≥0` | Version der Sequenz startend mit 0 | 125 | | prime_diagnostic_lab.demis_lab_
id | string | Beispiel: `DEMIS-10099` | Identifikationsnummer des primärdiagnostischen Labors | 126 | | prime_diagnostic_lab.postal_
code | string | Beispiel: `50858` | Postleitzahl des primärdiagnostischen Labors | 127 | | sequencing_lab.demis_lab_id | string | Beispiel: `DEMIS-10099` | Identifikationsnummer des sequenzierenden Labors | 128 | | sequencing_lab.postal_code | string | Beispiel: `50858` | Postleitzahl des sequenzierenden Labors | 129 | | lineages | string | Beispiel: `[{'method': 'PANGOLIN_LATEST', 'classification_version': 'PUSHER-v1.28.1', 'tool_version': '4.3', 'lineage': 'BA.2', '@qc_notes': 'Ambiguous_content:0.02', '@is_designated': False, '@qc_status': 'pass', '@conflict': 0.0, '@note': 'Usher placements: BA.2(1/1)'}]` | Pangolin Zuordnung im JSON-Format | 130 | 131 | 132 | 133 | 134 | 135 | 136 | 137 | Die Datei [SARS-CoV-2-Entwicklungslinien_berichtet.tsv](https://github.com/robert-koch-institut/SARS-CoV-2-Sequenzdaten_aus_Deutschland/blob/main/SARS-CoV-2-Entwicklungslinien_berichtet.tsv) enthält die in der folgenden Tabelle abgebildeten Variablen und deren Ausprägungen. Ein maschinenlesbares Datenschema ist im [Data Package Standard](https://datapackage.org/) in [tableschema_SARS-CoV-2-Entwicklungslinien_berichtet.json](https://github.com/robert-koch-institut/SARS-CoV-2-Sequenzdaten_aus_Deutschland/blob/main/Metadaten/schemas/tableschema_SARS-CoV-2-Entwicklungslinien_berichtet.json) hinterlegt: 138 | > [tableschema_SARS-CoV-2-Entwicklungslinien_berichtet.json](https://github.com/robert-koch-institut/SARS-CoV-2-Sequenzdaten_aus_Deutschland/blob/main/Metadaten/schemas/tableschema_SARS-CoV-2-Entwicklungslinien_berichtet.json) 139 | 140 | 141 | | Variable | Typ | Ausprägungen | Beschreibung | 142 | |:----------------------|:-------|:----------------------|:------------------------------------------------------------------------------| 143 | | LINEAGE | string | Beispiel: `JN.1` | Zugewiesene Pangolin Lineage | 144 | | WHO_LABEL | string | Beispiel: `Omikron` | Name der Virusvariante, der von der World Health Organisation vergeben wurde | 145 | | CONTRIBUTING_LINEAGES | string | Beispiel: `JN.1.1.10` | Pangolin Lineages, die von der Lineage abstammen | 146 | 147 | 148 | 149 | 150 | 151 | 152 | 153 | Die Datei [SARS-CoV-2-Entwicklungslinien_zu_Varianten.tsv](https://github.com/robert-koch-institut/SARS-CoV-2-Sequenzdaten_aus_Deutschland/blob/main/SARS-CoV-2-Entwicklungslinien_zu_Varianten.tsv) enthält die in der folgenden Tabelle abgebildeten Variablen und deren Ausprägungen. Ein maschinenlesbares Datenschema ist im [Data Package Standard](https://datapackage.org/) in [tableschema_SARS-CoV-2-Entwicklungslinien_zu_Varianten.json](https://github.com/robert-koch-institut/SARS-CoV-2-Sequenzdaten_aus_Deutschland/blob/main/Metadaten/schemas/tableschema_SARS-CoV-2-Entwicklungslinien_zu_Varianten.json) hinterlegt: 154 | > [tableschema_SARS-CoV-2-Entwicklungslinien_zu_Varianten.json](https://github.com/robert-koch-institut/SARS-CoV-2-Sequenzdaten_aus_Deutschland/blob/main/Metadaten/schemas/tableschema_SARS-CoV-2-Entwicklungslinien_zu_Varianten.json) 155 | 156 | 157 | | Variable | Typ | Ausprägungen | Beschreibung | 158 | |:----------------------|:-------|:--------------------|:----------------------------------------------------------------------------------------| 159 | | LINEAGE | string | Beispiel: `BA.2` | Zugewiesene Pangolin Lineage | 160 | | WHO_LABEL | string | Beispiel: `Omikron` | Name der Virusvariante, der von der World Health Organisation vergeben wurde | 161 | | CONTRIBUTING_LINEAGES | string | Beispiel: `JN.13.1` | Pangolin Lineages, die von der Lineage abstammen | 162 | | COLOR | any | | Veraltete Variable. Ist nicht mehr relevant und wird persepektivisch entfernt. | 163 | | variant_category | string | Werte: `VOC`, `VOI` | WHO Einstufung der Variante als VOC (variant of concern) oder VOI (variant of interest) | 164 | 165 | 166 | 167 | 168 | 169 | 170 | #### Formatierung der Sequenzmetadaten 171 | 172 | Die Sequenzmetadaten werden als [xz-komprimierte](https://en.wikipedia.org/wiki/XZ_Utils), kommaseparierte .csv-Datei bereitgestellt. Daraus ergibt sich die Dateiendung .csv.xz. Der verwendete Zeichensatz der .csv-Datei ist UTF-8. Trennzeichen der einzelnen Werte ist ein Komma ",". Datumsangaben sind im ISO-8601-Standard formatiert. 173 | 174 | * Zeichensatz: UTF-8 175 | * Datumsformat: ISO 8601 176 | * Komprimierung: [.xz](https://en.wikipedia.org/wiki/XZ_Utils) 177 | * Enthaltenes Dateiformat: .tsv 178 | * .csv-Trennzeichen: Tab "\t" 179 | 180 | Die Dateien können auf gängigen Betriebssystemen, beispielsweise mit den Programmen [7zip](https://www.7-zip.org/) oder [XZ Utils](https://tukaani.org/xz/), entpackt werden. Die Komprimierung wird vorgenommen, da insbesondere die .fasta-Dateien mehrere Gigabyte (GB) groß sind. 181 | 182 | 183 | 184 | 185 | 186 | 187 | ### Metadaten 188 | 189 | Zur Erhöhung der Auffindbarkeit sind die bereitgestellten Daten mit Metadaten beschrieben. Über GitHub Actions werden Metadaten an die entsprechenden Plattformen verteilt. Für jede Plattform existiert eine spezifische Metadatendatei, diese sind im Metadatenordner hinterlegt: 190 | 191 | > [Metadaten/](https://github.com/robert-koch-institut/SARS-CoV-2-Sequenzdaten_aus_Deutschland/tree/main/Metadaten/) 192 | 193 | Versionierung und DOI-Vergabe erfolgt über [Zenodo.org](https://zenodo.org). Die für den Import in Zenodo bereitgestellten Metadaten sind in der [zenodo.json](https://github.com/robert-koch-institut/SARS-CoV-2-Sequenzdaten_aus_Deutschland/blob/main/Metadaten/zenodo.json) hinterlegt. Die Dokumentation der einzelnen Metadatenvariablen ist unter https://developers.zenodo.org/#representation nachlesbar. 194 | 195 | > [Metadaten/zenodo.json](https://github.com/robert-koch-institut/SARS-CoV-2-Sequenzdaten_aus_Deutschland/blob/main/Metadaten/zenodo.json) 196 | 197 | In der zenodo.json ist neben dem Publikationsdatum (`"publication_date"`) auch der Datenstand in folgendem Format enthalten (Beispiel): 198 | 199 | ``` 200 | "dates": [ 201 | { 202 | "start": "2023-09-11T15:00:21+02:00", 203 | "end": "2023-09-11T15:00:21+02:00", 204 | "type": "Collected", 205 | "description": "Date when the Dataset was created" 206 | } 207 | ], 208 | ``` 209 | 210 | 211 | Zusätzlich beschreiben wir tabellarische Daten mithilfe des [Data Package Standards](https://datapackage.org/). 212 | Ein Data Package ist eine strukturierte Sammlung von Daten und zugehörigen Metadaten, die den Austausch und die Wiederverwendung von Daten erleichtert. Es besteht aus einer datapackage.json-Datei, die zentrale Informationen wie die enthaltenen Ressourcen, ihre Formate und Schema-Definitionen beschreibt. 213 | 214 | Der Data Package Standard wird von der [Open Knowledge Foundation](https://okfn.org/) bereitgestellt und ist ein offenes Format, das eine einfache, maschinenlesbare Beschreibung von Datensätzen ermöglicht. 215 | 216 | Die Liste der in diesem Repository enthaltenen Daten ist in folgender Datei hinterlegt: 217 | 218 | > [datapackage.json](https://github.com/robert-koch-institut/SARS-CoV-2-Sequenzdaten_aus_Deutschland/tree/main/datapackage.json) 219 | 220 | Für tabellarische Daten definieren wir zusätzlich ein [Table Schema](https://datapackage.org/standard/table-schema/), das die Struktur der Tabellen beschreibt, einschließlich Spaltennamen, Datentypen und Validierungsregeln. Diese Schema-Dateien finden sich unter: 221 | 222 | > [Metadaten/schemas/](https://github.com/robert-koch-institut/SARS-CoV-2-Sequenzdaten_aus_Deutschland/tree/main/Metadaten/schemas) 223 | 224 | 225 | 226 | ## Hinweise zur Nachnutzung der Daten 227 | 228 | Offene Forschungsdaten des RKI werden auf [Zenodo.org](http://Zenodo.org/), [GitHub.com](http://GitHub.com/), [OpenCoDE](https://gitlab.opencode.de) und [Edoc.rki.de](http://Edoc.rki.de/) bereitgestellt: 229 | 230 | - https://zenodo.org/communities/robertkochinstitut 231 | - https://github.com/robert-koch-institut 232 | - https://gitlab.opencode.de/robert-koch-institut 233 | - https://edoc.rki.de/ 234 | 235 | ### Lizenz 236 | 237 | Der Datensatz "SARS-CoV-2 Sequenzdaten aus Deutschland" ist lizenziert unter der [Creative Commons Namensnennung 4.0 International Public License | CC-BY 4.0 International](https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/deed.de). 238 | 239 | Die im Datensatz bereitgestellten Daten sind, unter Bedingung der Namensnennung des Robert Koch-Instituts als Quelle, frei verfügbar. Das bedeutet, jede Person hat das Recht die Daten zu verarbeiten und zu verändern, Derivate des Datensatzes zu erstellen und sie für kommerzielle und nicht kommerzielle Zwecke zu nutzen. Weitere Informationen zur Lizenz finden sich in der [LICENSE](https://github.com/robert-koch-institut/SARS-CoV-2-Sequenzdaten_aus_Deutschland/blob/main/LICENSE) bzw. [LIZENZ](https://github.com/robert-koch-institut/SARS-CoV-2-Sequenzdaten_aus_Deutschland/blob/main/LIZENZ) Datei des Datensatzes. 240 | 241 | -------------------------------------------------------------------------------- /SARS-CoV-2-Entwicklungslinien_berichtet.tsv: -------------------------------------------------------------------------------- 1 | LINEAGE WHO_LABEL CONTRIBUTING_LINEAGES 2 | JN.1 Omikron JN.1 3 | JN.1 Omikron JN.1.1 4 | JN.1 Omikron JN.1.1.1 5 | JN.1 Omikron JN.1.1.10 6 | JN.1 Omikron JN.1.1.2 7 | JN.1 Omikron JN.1.1.3 8 | JN.1 Omikron JN.1.1.4 9 | JN.1 Omikron JN.1.1.5 10 | JN.1 Omikron JN.1.1.6 11 | JN.1 Omikron JN.1.1.7 12 | JN.1 Omikron JN.1.1.8 13 | JN.1 Omikron JN.1.1.9 14 | JN.1 Omikron JN.1.10 15 | JN.1 Omikron JN.1.11 16 | JN.1 Omikron JN.1.11.1 17 | JN.1 Omikron JN.1.11.2 18 | JN.1 Omikron JN.1.12 19 | JN.1 Omikron JN.1.13 20 | JN.1 Omikron JN.1.13.1 21 | JN.1 Omikron JN.1.14 22 | JN.1 Omikron JN.1.15 23 | JN.1 Omikron JN.1.15.1 24 | JN.1 Omikron JN.1.16 25 | JN.1 Omikron JN.1.16.1 26 | JN.1 Omikron JN.1.16.2 27 | JN.1 Omikron JN.1.16.3 28 | JN.1 Omikron JN.1.16.4 29 | JN.1 Omikron JN.1.16.5 30 | JN.1 Omikron JN.1.17 31 | JN.1 Omikron JN.1.18 32 | JN.1 Omikron JN.1.18.1 33 | JN.1 Omikron JN.1.18.2 34 | JN.1 Omikron JN.1.18.3 35 | JN.1 Omikron JN.1.18.4 36 | JN.1 Omikron JN.1.18.5 37 | JN.1 Omikron JN.1.18.6 38 | JN.1 Omikron JN.1.18.7 39 | JN.1 Omikron JN.1.18.8 40 | JN.1 Omikron JN.1.18.9 41 | JN.1 Omikron JN.1.19 42 | JN.1 Omikron JN.1.2 43 | JN.1 Omikron JN.1.2.1 44 | JN.1 Omikron JN.1.20 45 | JN.1 Omikron JN.1.21 46 | JN.1 Omikron JN.1.22 47 | JN.1 Omikron JN.1.23 48 | JN.1 Omikron JN.1.23.1 49 | JN.1 Omikron JN.1.24 50 | JN.1 Omikron JN.1.24.1 51 | JN.1 Omikron JN.1.25 52 | JN.1 Omikron JN.1.25.1 53 | JN.1 Omikron JN.1.26 54 | JN.1 Omikron JN.1.27 55 | JN.1 Omikron JN.1.28 56 | JN.1 Omikron JN.1.28.1 57 | JN.1 Omikron JN.1.29 58 | JN.1 Omikron JN.1.29.1 59 | JN.1 Omikron JN.1.3 60 | JN.1 Omikron JN.1.30 61 | JN.1 Omikron JN.1.30.1 62 | JN.1 Omikron JN.1.31 63 | JN.1 Omikron JN.1.32 64 | JN.1 Omikron JN.1.32.1 65 | JN.1 Omikron JN.1.34 66 | JN.1 Omikron JN.1.35 67 | JN.1 Omikron JN.1.36 68 | JN.1 Omikron JN.1.36.1 69 | JN.1 Omikron JN.1.37 70 | JN.1 Omikron JN.1.38 71 | JN.1 Omikron JN.1.38.1 72 | JN.1 Omikron JN.1.39 73 | JN.1 Omikron JN.1.39.1 74 | JN.1 Omikron JN.1.39.2 75 | JN.1 Omikron JN.1.39.3 76 | JN.1 Omikron JN.1.4 77 | JN.1 Omikron JN.1.4.1 78 | JN.1 Omikron JN.1.4.2 79 | JN.1 Omikron JN.1.4.3 80 | JN.1 Omikron JN.1.4.4 81 | JN.1 Omikron JN.1.4.5 82 | JN.1 Omikron JN.1.4.6 83 | JN.1 Omikron JN.1.4.7 84 | JN.1 Omikron JN.1.4.8 85 | JN.1 Omikron JN.1.4.9 86 | JN.1 Omikron JN.1.40 87 | JN.1 Omikron JN.1.41 88 | JN.1 Omikron JN.1.42 89 | JN.1 Omikron JN.1.42.1 90 | JN.1 Omikron JN.1.42.2 91 | JN.1 Omikron JN.1.43 92 | JN.1 Omikron JN.1.43.1 93 | JN.1 Omikron JN.1.44 94 | JN.1 Omikron JN.1.44.1 95 | JN.1 Omikron JN.1.45 96 | JN.1 Omikron JN.1.46 97 | JN.1 Omikron JN.1.47 98 | JN.1 Omikron JN.1.47.1 99 | JN.1 Omikron JN.1.47.2 100 | JN.1 Omikron JN.1.48 101 | JN.1 Omikron JN.1.48.1 102 | JN.1 Omikron JN.1.48.2 103 | JN.1 Omikron JN.1.48.3 104 | JN.1 Omikron JN.1.49 105 | JN.1 Omikron JN.1.49.1 106 | JN.1 Omikron JN.1.49.2 107 | JN.1 Omikron JN.1.49.3 108 | JN.1 Omikron JN.1.5 109 | JN.1 Omikron JN.1.50 110 | JN.1 Omikron JN.1.50.1 111 | JN.1 Omikron JN.1.50.2 112 | JN.1 Omikron JN.1.51 113 | JN.1 Omikron JN.1.51.1 114 | JN.1 Omikron JN.1.52 115 | JN.1 Omikron JN.1.53 116 | JN.1 Omikron JN.1.53.1 117 | JN.1 Omikron JN.1.54 118 | JN.1 Omikron JN.1.54.1 119 | JN.1 Omikron JN.1.55 120 | JN.1 Omikron JN.1.55.1 121 | JN.1 Omikron JN.1.55.2 122 | JN.1 Omikron JN.1.56 123 | JN.1 Omikron JN.1.56.1 124 | JN.1 Omikron JN.1.57 125 | JN.1 Omikron JN.1.57.1 126 | JN.1 Omikron JN.1.58 127 | JN.1 Omikron JN.1.58.1 128 | JN.1 Omikron JN.1.58.2 129 | JN.1 Omikron JN.1.58.3 130 | JN.1 Omikron JN.1.59 131 | JN.1 Omikron JN.1.59.1 132 | JN.1 Omikron JN.1.6 133 | JN.1 Omikron JN.1.6.1 134 | JN.1 Omikron JN.1.60 135 | JN.1 Omikron JN.1.61 136 | JN.1 Omikron JN.1.62 137 | JN.1 Omikron JN.1.63 138 | JN.1 Omikron JN.1.63.1 139 | JN.1 Omikron JN.1.64 140 | JN.1 Omikron JN.1.64.1 141 | JN.1 Omikron JN.1.65 142 | JN.1 Omikron JN.1.65.1 143 | JN.1 Omikron JN.1.66 144 | JN.1 Omikron JN.1.67 145 | JN.1 Omikron JN.1.67.1 146 | JN.1 Omikron JN.1.68 147 | JN.1 Omikron JN.1.68.1 148 | JN.1 Omikron JN.1.69 149 | JN.1 Omikron JN.1.7 150 | JN.1 Omikron JN.1.7.1 151 | JN.1 Omikron JN.1.7.2 152 | JN.1 Omikron JN.1.7.3 153 | JN.1 Omikron JN.1.7.4 154 | JN.1 Omikron JN.1.7.5 155 | JN.1 Omikron JN.1.7.6 156 | JN.1 Omikron JN.1.7.7 157 | JN.1 Omikron JN.1.7.8 158 | JN.1 Omikron JN.1.7.9 159 | JN.1 Omikron JN.1.8 160 | JN.1 Omikron JN.1.8.1 161 | JN.1 Omikron JN.1.8.2 162 | JN.1 Omikron JN.1.8.3 163 | JN.1 Omikron JN.1.8.4 164 | JN.1 Omikron JN.1.9 165 | JN.1 Omikron JN.1.9.1 166 | JN.1 Omikron JN.1.9.2 167 | JN.1 Omikron KP.1 168 | JN.1 Omikron KP.1.1 169 | JN.1 Omikron KP.1.1.1 170 | JN.1 Omikron KP.1.1.2 171 | JN.1 Omikron KP.1.1.3 172 | JN.1 Omikron KP.1.1.4 173 | JN.1 Omikron KP.1.1.5 174 | JN.1 Omikron KP.1.1.6 175 | JN.1 Omikron KP.1.2 176 | JN.1 Omikron KP.2 177 | JN.1 Omikron KP.2.1 178 | JN.1 Omikron KP.2.10 179 | JN.1 Omikron KP.2.11 180 | JN.1 Omikron KP.2.12 181 | JN.1 Omikron KP.2.13 182 | JN.1 Omikron KP.2.14 183 | JN.1 Omikron KP.2.14.1 184 | JN.1 Omikron KP.2.14.2 185 | JN.1 Omikron KP.2.15 186 | JN.1 Omikron KP.2.15.1 187 | JN.1 Omikron KP.2.16 188 | JN.1 Omikron KP.2.17 189 | JN.1 Omikron KP.2.18 190 | JN.1 Omikron KP.2.19 191 | JN.1 Omikron KP.2.2 192 | JN.1 Omikron KP.2.2.1 193 | JN.1 Omikron KP.2.2.2 194 | JN.1 Omikron KP.2.20 195 | JN.1 Omikron KP.2.20.1 196 | JN.1 Omikron KP.2.22 197 | JN.1 Omikron KP.2.23 198 | JN.1 Omikron KP.2.24 199 | JN.1 Omikron KP.2.25 200 | JN.1 Omikron KP.2.25.1 201 | JN.1 Omikron KP.2.25.2 202 | JN.1 Omikron KP.2.25.3 203 | JN.1 Omikron KP.2.26 204 | JN.1 Omikron KP.2.27 205 | JN.1 Omikron KP.2.28 206 | JN.1 Omikron KP.2.28.1 207 | JN.1 Omikron KP.2.3 208 | JN.1 Omikron KP.2.3.1 209 | JN.1 Omikron KP.2.3.10 210 | JN.1 Omikron KP.2.3.11 211 | JN.1 Omikron KP.2.3.12 212 | JN.1 Omikron KP.2.3.13 213 | JN.1 Omikron KP.2.3.14 214 | JN.1 Omikron KP.2.3.15 215 | JN.1 Omikron KP.2.3.2 216 | JN.1 Omikron KP.2.3.3 217 | JN.1 Omikron KP.2.3.4 218 | JN.1 Omikron KP.2.3.5 219 | JN.1 Omikron KP.2.3.6 220 | JN.1 Omikron KP.2.3.7 221 | JN.1 Omikron KP.2.3.8 222 | JN.1 Omikron KP.2.3.9 223 | JN.1 Omikron KP.2.4 224 | JN.1 Omikron KP.2.5 225 | JN.1 Omikron KP.2.6 226 | JN.1 Omikron KP.2.6.1 227 | JN.1 Omikron KP.2.6.2 228 | JN.1 Omikron KP.2.6.3 229 | JN.1 Omikron KP.2.6.4 230 | JN.1 Omikron KP.2.7 231 | JN.1 Omikron KP.2.8 232 | JN.1 Omikron KP.2.9 233 | JN.1 Omikron KP.4 234 | JN.1 Omikron KP.4.1 235 | JN.1 Omikron KP.4.1.1 236 | JN.1 Omikron KP.4.1.2 237 | JN.1 Omikron KP.4.1.3 238 | JN.1 Omikron KP.4.2 239 | JN.1 Omikron KP.4.2.1 240 | JN.1 Omikron KP.4.2.2 241 | JN.1 Omikron KP.4.2.3 242 | JN.1 Omikron KP.4.2.4 243 | JN.1 Omikron KP.4.2.5 244 | JN.1 Omikron KP.4.2.6 245 | JN.1 Omikron KP.5 246 | JN.1 Omikron KP.6 247 | JN.1 Omikron KQ.1 248 | JN.1 Omikron KR.1 249 | JN.1 Omikron KR.1.1 250 | JN.1 Omikron KR.1.2 251 | JN.1 Omikron KR.1.3 252 | JN.1 Omikron KR.1.4 253 | JN.1 Omikron KR.3 254 | JN.1 Omikron KR.4 255 | JN.1 Omikron KR.4.1 256 | JN.1 Omikron KR.5 257 | JN.1 Omikron KS.1 258 | JN.1 Omikron KS.1.1 259 | JN.1 Omikron KS.1.1.1 260 | JN.1 Omikron KS.1.1.2 261 | JN.1 Omikron KS.1.1.3 262 | JN.1 Omikron KS.1.2 263 | JN.1 Omikron KS.1.3 264 | JN.1 Omikron KS.1.4 265 | JN.1 Omikron KS.1.5 266 | JN.1 Omikron KS.2 267 | JN.1 Omikron KU.1 268 | JN.1 Omikron KU.2 269 | JN.1 Omikron KU.2.1 270 | JN.1 Omikron KU.2.2 271 | JN.1 Omikron KV.1 272 | JN.1 Omikron KV.2 273 | JN.1 Omikron KW.1 274 | JN.1 Omikron KW.1.1 275 | JN.1 Omikron KW.1.1.1 276 | JN.1 Omikron KW.1.2 277 | JN.1 Omikron KY.1 278 | JN.1 Omikron KZ.1 279 | JN.1 Omikron KZ.1.1 280 | JN.1 Omikron KZ.1.1.1 281 | JN.1 Omikron LA.1 282 | JN.1 Omikron LA.2 283 | JN.1 Omikron LC.1 284 | JN.1 Omikron LD.1 285 | JN.1 Omikron LD.1.1 286 | JN.1 Omikron LD.2 287 | JN.1 Omikron LE.1 288 | JN.1 Omikron LE.1.1 289 | JN.1 Omikron LE.1.2 290 | JN.1 Omikron LE.1.3 291 | JN.1 Omikron LE.1.3.1 292 | JN.1 Omikron LE.2 293 | JN.1 Omikron LF.1 294 | JN.1 Omikron LF.1.1 295 | JN.1 Omikron LF.1.1.1 296 | JN.1 Omikron LF.10 297 | JN.1 Omikron LF.2 298 | JN.1 Omikron LF.3 299 | JN.1 Omikron LF.3.1 300 | JN.1 Omikron LF.3.1.1 301 | JN.1 Omikron LF.3.1.2 302 | JN.1 Omikron LF.4 303 | JN.1 Omikron LF.4.1 304 | JN.1 Omikron LF.5 305 | JN.1 Omikron LF.6 306 | JN.1 Omikron LF.7 307 | JN.1 Omikron LF.7.1 308 | JN.1 Omikron LF.7.1.1 309 | JN.1 Omikron LF.7.1.2 310 | JN.1 Omikron LF.7.1.3 311 | JN.1 Omikron LF.7.1.4 312 | JN.1 Omikron LF.7.1.5 313 | JN.1 Omikron LF.7.2 314 | JN.1 Omikron LF.7.2.1 315 | JN.1 Omikron LF.7.3 316 | JN.1 Omikron LF.7.3.1 317 | JN.1 Omikron LF.7.3.2 318 | JN.1 Omikron LF.7.3.3 319 | JN.1 Omikron LF.7.3.4 320 | JN.1 Omikron LF.7.3.5 321 | JN.1 Omikron LF.7.3.6 322 | JN.1 Omikron LF.7.4 323 | JN.1 Omikron LF.7.5 324 | JN.1 Omikron LF.7.6 325 | JN.1 Omikron LF.7.6.1 326 | JN.1 Omikron LF.7.6.2 327 | JN.1 Omikron LF.7.7 328 | JN.1 Omikron LF.7.7.1 329 | JN.1 Omikron LF.7.7.2 330 | JN.1 Omikron LF.7.8 331 | JN.1 Omikron LF.7.9 332 | JN.1 Omikron LF.8 333 | JN.1 Omikron LF.8.1 334 | JN.1 Omikron LF.8.1.1 335 | JN.1 Omikron LF.9 336 | JN.1 Omikron LF.9.1 337 | JN.1 Omikron LG.1 338 | JN.1 Omikron LH.1 339 | JN.1 Omikron LH.2 340 | JN.1 Omikron LJ.1 341 | JN.1 Omikron LK.1 342 | JN.1 Omikron LK.2 343 | JN.1 Omikron LK.2.1 344 | JN.1 Omikron LL.1 345 | JN.1 Omikron LM.1 346 | JN.1 Omikron LN.1 347 | JN.1 Omikron LN.1.1 348 | JN.1 Omikron LP.1 349 | JN.1 Omikron LP.1.1 350 | JN.1 Omikron LP.1.2 351 | JN.1 Omikron LP.1.2.1 352 | JN.1 Omikron LP.10 353 | JN.1 Omikron LP.10.1 354 | JN.1 Omikron LP.10.1.1 355 | JN.1 Omikron LP.11 356 | JN.1 Omikron LP.2 357 | JN.1 Omikron LP.3 358 | JN.1 Omikron LP.4 359 | JN.1 Omikron LP.5 360 | JN.1 Omikron LP.6 361 | JN.1 Omikron LP.7 362 | JN.1 Omikron LP.8 363 | JN.1 Omikron LP.8.2 364 | JN.1 Omikron LP.8.2.1 365 | JN.1 Omikron LP.9 366 | JN.1 Omikron LQ.1 367 | JN.1 Omikron LQ.1.1 368 | JN.1 Omikron LQ.1.1.1 369 | JN.1 Omikron LQ.1.2 370 | JN.1 Omikron LQ.2 371 | JN.1 Omikron LQ.3 372 | JN.1 Omikron LR.1 373 | JN.1 Omikron LR.2 374 | JN.1 Omikron LR.3 375 | JN.1 Omikron LS.1 376 | JN.1 Omikron LS.2 377 | JN.1 Omikron LT.1 378 | JN.1 Omikron LU.1 379 | JN.1 Omikron LU.2 380 | JN.1 Omikron LU.2.1 381 | JN.1 Omikron LU.2.1.1 382 | JN.1 Omikron LU.2.2 383 | JN.1 Omikron LY.1 384 | JN.1 Omikron LY.2 385 | JN.1 Omikron LZ.1 386 | JN.1 Omikron LZ.1.1 387 | JN.1 Omikron LZ.2 388 | JN.1 Omikron LZ.2.1 389 | JN.1 Omikron LZ.2.1.1 390 | JN.1 Omikron LZ.2.1.2 391 | JN.1 Omikron LZ.2.2 392 | JN.1 Omikron LZ.3 393 | JN.1 Omikron LZ.4 394 | JN.1 Omikron LZ.5 395 | JN.1 Omikron MA.1 396 | JN.1 Omikron MA.1.1 397 | JN.1 Omikron MA.1.1.1 398 | JN.1 Omikron MA.1.2 399 | JN.1 Omikron MB.1 400 | JN.1 Omikron MB.1.1 401 | JN.1 Omikron MB.1.1.1 402 | JN.1 Omikron MB.1.1.2 403 | JN.1 Omikron MB.1.1.3 404 | JN.1 Omikron MD.1 405 | JN.1 Omikron MD.1.1 406 | JN.1 Omikron MD.1.1.1 407 | JN.1 Omikron MD.1.1.2 408 | JN.1 Omikron MD.1.2 409 | JN.1 Omikron MD.2 410 | JN.1 Omikron MD.3 411 | JN.1 Omikron MD.3.1 412 | JN.1 Omikron MD.3.1.1 413 | JN.1 Omikron MD.3.1.2 414 | JN.1 Omikron MD.3.1.3 415 | JN.1 Omikron MD.3.1.4 416 | JN.1 Omikron MD.4 417 | JN.1 Omikron MD.4.1 418 | JN.1 Omikron ME.1 419 | JN.1 Omikron MF.1 420 | JN.1 Omikron MF.2 421 | JN.1 Omikron MG.1 422 | JN.1 Omikron MG.2 423 | JN.1 Omikron MG.3 424 | JN.1 Omikron MG.4 425 | JN.1 Omikron MJ.1 426 | JN.1 Omikron MJ.1.1 427 | JN.1 Omikron MJ.2 428 | JN.1 Omikron MJ.2.1 429 | JN.1 Omikron MJ.2.1.1 430 | JN.1 Omikron MN.1 431 | JN.1 Omikron MQ.1 432 | JN.1 Omikron MQ.2 433 | JN.1 Omikron MS.1 434 | JN.1 Omikron MT.1 435 | JN.1 Omikron MT.1.1 436 | JN.1 Omikron MU.1 437 | JN.1 Omikron MU.1.1 438 | JN.1 Omikron MU.2 439 | JN.1 Omikron MU.2.1 440 | JN.1 Omikron MU.2.1.1 441 | JN.1 Omikron MU.3 442 | JN.1 Omikron MU.4 443 | JN.1 Omikron MU.5 444 | JN.1 Omikron MU.6 445 | JN.1 Omikron MV.1 446 | JN.1 Omikron MV.1.1 447 | JN.1 Omikron MV.2 448 | JN.1 Omikron MW.1 449 | JN.1 Omikron MZ.1 450 | JN.1 Omikron MZ.2 451 | JN.1 Omikron MZ.3 452 | JN.1 Omikron MZ.4 453 | JN.1 Omikron MZ.4.1 454 | JN.1 Omikron MZ.5 455 | JN.1 Omikron NA.1 456 | JN.1 Omikron NA.1.1 457 | JN.1 Omikron NC.1 458 | JN.1 Omikron NC.1.1 459 | JN.1 Omikron NC.1.2 460 | JN.1 Omikron NC.1.2.1 461 | JN.1 Omikron NC.1.2.2 462 | JN.1 Omikron NC.2 463 | JN.1 Omikron ND.1 464 | JN.1 Omikron ND.1.1 465 | JN.1 Omikron ND.1.1.1 466 | JN.1 Omikron ND.1.1.2 467 | JN.1 Omikron ND.1.1.3 468 | JN.1 Omikron ND.2 469 | JN.1 Omikron ND.2.1 470 | JN.1 Omikron ND.3 471 | JN.1 Omikron NE.1 472 | JN.1 Omikron NF.1 473 | JN.1 Omikron NF.1.1 474 | JN.1 Omikron NF.1.2 475 | JN.1 Omikron NF.1.3 476 | JN.1 Omikron NF.1.4 477 | JN.1 Omikron NF.1.5 478 | JN.1 Omikron 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Omikron KP.3.2.5 518 | KP.3 Omikron KP.3.2.6 519 | KP.3 Omikron KP.3.2.7 520 | KP.3 Omikron KP.3.2.8 521 | KP.3 Omikron KP.3.2.9 522 | KP.3 Omikron KP.3.3 523 | KP.3 Omikron KP.3.3.1 524 | KP.3 Omikron KP.3.3.2 525 | KP.3 Omikron KP.3.3.3 526 | KP.3 Omikron KP.3.3.4 527 | KP.3 Omikron KP.3.3.5 528 | KP.3 Omikron KP.3.3.6 529 | KP.3 Omikron KP.3.3.7 530 | KP.3 Omikron KP.3.3.8 531 | KP.3 Omikron KP.3.3.9 532 | KP.3 Omikron KP.3.4 533 | KP.3 Omikron KP.3.4.1 534 | KP.3 Omikron KP.3.5 535 | KP.3 Omikron KP.3.6 536 | KP.3 Omikron KP.3.7 537 | KP.3 Omikron LW.1 538 | KP.3 Omikron LW.1.1 539 | KP.3 Omikron LW.1.2 540 | KP.3 Omikron MK.1 541 | KP.3 Omikron MK.2 542 | KP.3 Omikron MK.3 543 | KP.3 Omikron ML.1 544 | KP.3 Omikron ML.2 545 | KP.3 Omikron MM.1 546 | KP.3 Omikron MM.2 547 | KP.3 Omikron MR.1 548 | KP.3 Omikron MR.2 549 | KP.3 Omikron MY.1 550 | KP.3 Omikron NP.1 551 | KP.3 Omikron NP.2 552 | KP.3 Omikron NQ.1 553 | KP.3 Omikron NR.1 554 | KP.3 Omikron NV.1 555 | KP.3 Omikron PB.1 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-------------------------------------------------------------------------------- 1 | version https://git-lfs.github.com/spec/v1 2 | oid sha256:857ffcb9601c1d22c6a330c5697b2ad1eb68eb94264b20ed1f0af5898faaf342 3 | size 79412092 4 | -------------------------------------------------------------------------------- /[Dokumentation]_SARS-CoV-2-Sequenzdaten_aus_Deutschland.pdf: -------------------------------------------------------------------------------- https://raw.githubusercontent.com/robert-koch-institut/SARS-CoV-2-Sequenzdaten_aus_Deutschland/e1a6a73d0b8f3479b7968efe318971c5fb7319a6/[Dokumentation]_SARS-CoV-2-Sequenzdaten_aus_Deutschland.pdf -------------------------------------------------------------------------------- /citation.cff: -------------------------------------------------------------------------------- 1 | cff-version: 1.2.0 2 | type: dataset 3 | title: SARS-CoV-2 Sequenzdaten aus Deutschland 4 | abstract: >- 5 | Ein zentraler Bestandteil einer erfolgreichen Erregersurveillance ist das 6 | Verständnis der Verbreitung eines Erregers sowie seiner pathogenen 7 | Eigenschaften. Hierbei stellt das Wissen über das Erregergenom eine wichtige 8 | Informationsquelle dar. So erlaubt der Nachweis von Mutationen im Genom eines 9 | Erregers, Verwandtschaftsbeziehungen zu rekonstruieren, Übertragungswege 10 | aufzudecken und Resistenzen vorherzusagen. Die Integrierte Genomische 11 | Surveillance (IGS) von SARS-CoV-2 zielt darauf ab, die Verbreitung des Virus 12 | und insbesondere von besorgniserregenden Virusvarianten in der Bevölkerung zu 13 | überwachen sowie auftretende Veränderungen des Virus genau zu beobachten. 14 | Besondere Bedeutung kommt dabei der öffentlichen Bereitstellung der 15 | genomischen Daten zu, um Wissenschaftlern in Deutschland und weltweit die 16 | Möglichkeit zu eigenständigen Analysen zu eröffnen. 17 | 18 | 19 | 20 | Im Rahmen der Coronavirus-Surveillanceverordnung 21 | (https://www.gesetze-im-internet.de/corsurv/BJNR601910021.html) wurden bis zum 22 | 31.05.2023 SARS-CoV-2 Sequenzdaten aus ganz Deutschland über den Deutschen 23 | Elektronischen Sequenzdaten-Hub (DESH) an das RKI übermittelt 24 | (https://doi.org/10.5281/zenodo.8046538). Mit Ablauf der Verordnung werden 25 | künftig Proben durch das IMSSC2 Labornetzwerk bereitgestellt und am RKI 26 | sequenziert, analysiert und hier bereitgestellt. Trotz reduzierter 27 | Probenanzahl, wird durch die sorgfältige Auswahl der beteiligten Labore ein 28 | repräsentativer Einblick in die Viruspopluation gesichert (Djin Ye Oh et al. 29 | 2022) (https://doi.org/10.1093/cid/ciac399). Zusätzlich werden Sequenzen vom 30 | NRZ Coronaviren an der Charité beigetragen um das IMSSC2 Netzwerk zu ergänzen. 31 | date-released: '2025-05-28' 32 | keywords: 33 | - COVID-19 34 | - SARS-CoV-2 35 | - Virussequenzen 36 | - Genom 37 | - Basensequenz 38 | - Deutschland 39 | - Viral Sequences 40 | - Genome 41 | - Base Sequence 42 | - Gesundheitsberichterstattung 43 | - Biochemische Genetik 44 | - Epidemiologie 45 | - Biochemical genetics 46 | - Public health surveillance 47 | - Epidemiology 48 | - Open Data 49 | - Offene Daten 50 | - Deutschland 51 | - Germany 52 | - RKI 53 | message: Cite me! 54 | url: >- 55 | https://robert-koch-institut.github.io/SARS-CoV-2-Sequenzdaten_aus_Deutschland/ 56 | license: CC-BY-4.0 57 | doi: 10.5281/zenodo.15535746 58 | version: '2025-05-27T10:26:00+02:00' 59 | authors: 60 | - name: Robert Koch-Institut 61 | -------------------------------------------------------------------------------- /datapackage.json: -------------------------------------------------------------------------------- 1 | { 2 | "name": "10.5281/zenodo.5139363", 3 | "title": "SARS-CoV-2 Sequenzdaten aus Deutschland", 4 | "description": "Diese Datei gibt eine Übersicht über die im Datensatz enthaltenen Daten im Data Package Standard (https://datapackage.org). Der dokumentierte Datensatz ist auf den Plattformen Zenodo (https://doi.org/10.5281/zenodo.5139363) und Github (https://github.com/robert-koch-institut/SARS-CoV-2-Sequenzdaten_aus_Deutschland) verfügbar.", 5 | "homepage": "https://doi.org/10.5281/zenodo.5139363", 6 | "resources": [ 7 | { 8 | "name": "sars-cov-2-sequenzdaten_deutschland", 9 | "type": "table", 10 | "path": "SARS-CoV-2-Sequenzdaten_Deutschland.tsv", 11 | "scheme": "file", 12 | "format": "tsv", 13 | "mediatype": "text/csv", 14 | "schema": "Metadaten/schemas/tableschema_SARS-CoV-2-Sequenzdaten_Deutschland.json" 15 | }, 16 | { 17 | "name": "sars-cov-2-entwicklungslinien_berichtet", 18 | "type": "table", 19 | "path": "SARS-CoV-2-Entwicklungslinien_berichtet.tsv", 20 | "scheme": "file", 21 | "format": "tsv", 22 | "mediatype": "text/csv", 23 | "schema": "Metadaten/schemas/tableschema_SARS-CoV-2-Entwicklungslinien_berichtet.json" 24 | }, 25 | { 26 | "name": "sars-cov-2-entwicklungslinien_zu_varianten", 27 | "type": "table", 28 | "path": "SARS-CoV-2-Entwicklungslinien_zu_Varianten.tsv", 29 | "scheme": "file", 30 | "format": "tsv", 31 | "mediatype": "text/csv", 32 | "schema": "Metadaten/schemas/tableschema_SARS-CoV-2-Entwicklungslinien_zu_Varianten.json" 33 | } 34 | ] 35 | } --------------------------------------------------------------------------------